文章标题:综述:真菌细胞中的 CRISPR/Cas12 介导的基因组编辑:植物真菌病理学的进展、机制和未来方向 作者:Chiti Agarwal[1] 所属机构:华盛顿州立大学 [1] Orcid ids:0000-0003-4125-2880[1] 联系电子邮件:chiti.agarwal@gmail.com 许可信息:本作品已根据知识共享署名许可 http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ 以开放获取的方式发表,允许在任何媒体中不受限制地使用、分发和复制,只要对原始作品进行适当的引用。条件、使用条款和出版政策可在 https://www.scienceopen.com/ 上找到。预印本声明:本文为预印本,尚未经过同行评审,正在考虑并已提交给 ScienceOpen Preprints 进行开放同行评审。 DOI:10.14293/PR2199.000129.v2 预印本首次在线发布时间:2023 年 6 月 8 日 关键词:CRISPR、CRISPR/Cas12、真菌病原体、植物病原体
摘要 成簇的规律间隔短回文重复序列(CRISPR)和CRISPR相关蛋白(Cas)是细菌和古菌中对抗入侵核酸和噬菌体的适应性免疫系统。根据效应蛋白的组成,CRISPR/Cas大致分为多种类型和亚型。其中,VI型CRISPR/Cas系统尤受关注,有VI-A、VI-B、VI-C和VI-D四个亚型,被认为从转座子进化而来。这些亚型在结构架构和机制上表现出差异,具有多种Cas13a(C2c2)、Cas13b1(C2c6)、Cas13b2(C2c6)、Cas13c(C2c7)和Cas13d效应蛋白。CRISPR/Cas13 核糖核酸酶将前 crRNA 加工成成熟的 crRNA,后者在病毒干扰过程中靶向并敲除噬菌体基因组的单链 RNA。这种蛋白质的高特异性 RNA 引导和 RNA 靶向能力使其能够与多种效应分子融合,为 Cas13 介导的 RNA 靶向、追踪和编辑领域开辟了新途径。CRISPR/Cas13 具有靶向包括植物在内的 RNA 的独特功能,因此可以用作一种新的工具,用于工程干扰植物病原体(包括 RNA 病毒),具有更好的特异性,并可用于植物中的其他 RNA 修饰。荧光探针标记的失活可编程 Cas13 蛋白可用作体外 RNA 研究的替代工具。工程化的 Cas13 也可用于可编程的 RNA 编辑。CRISPR/Cas13 的高靶向特异性、低成本和用户友好的操作使其成为多种基于 RNA 的研究和应用的有效工具。因此,本章的重点是 CRISPR/Cas 系统的分类、VI 型 CRISPR/Cas 系统的结构和功能多样性,包括其发现和起源、机制以及 Cas13 在植物 RNA 编辑中的作用。
了解心脏的功能并监测其健康在现代医疗保健中至关重要。生命体征(包括心率)是心血管福祉的基本指标,并提供了至关重要的信息,以诊断和管理各种心脏病。对心率变化的持续评估可以帮助检测异常,确定潜在的风险并指导适当的干预措施,最终改善患者的预后[1]。评估心率和心脏特性活性最广泛的方法之一是心电图(ECG)。心电图是一种非侵入性的诊断工具,可记录由心脏产生的电脉冲,对其节奏,传导和整体性能的宝贵见解。ECG系统已经彻底改变了心血管医学,为临床医生提供了一种可靠的方法来评估心脏健康并就患者护理做出明智的决定[2]。通过ECG测量心脏的电活动,涉及将电极放置在皮肤表面上,该电极检测和传输心脏肌肉产生的电信号。这些信号(称为心电图波形)代表心脏周期中心脏不同区域的去极化和复极化。通过分析这些波形,医疗保健专业人员可以评估心脏的节奏,识别心律不齐,并检测缺血或心肌梗塞的迹象[3]。ECG测量通常在各种临床环境中进行,包括医院,门诊诊所和救护车。技术的进步导致了具有实时物联网的便携式和可穿戴的心电图设备的开发,从而可以长期监测传统健康环境之外的心脏活动[4,5]。将来,ECG设备将具有许多优势,例如心律不齐,远程患者监测,实时数据传输到医疗保健提供者,以及评估在不受欢迎环境中测量的信号质量的算法[6]。便携式ECG设备使个人有能力积极参与其心血管健康的管理,促进早期干预并有可能预防严重的心脏事件。对心电图记录的解释需要专业知识和实验。熟练心电图学的临床医生可以辨别波形的细微变化,识别异常并进行准确的诊断。然而,对心电图分析的需求不断增长以及对迅速结果的需求促使探索自动化算法和人工智能(AI)技术以帮助ECG解释。这些事态发展有望提高效率,减少诊断错误并扩大获得优质心脏护理的机会[7]。预期的应用是快速的质量伤亡分类,其中简化的3铅ECG系统可以提供快速的心脏筛查,以优先考虑对批评患者的治疗。在混乱的紧急情况下,将患者分类为类别至关重要,我们系统的想法是实现快速生命体征评估以帮助迅速分类决策。在本文中,我们的目标是深入ECG测量的复杂性,并探索用于低噪声生物能力测量的ADS1194集成电路。我们用三个电极,不同的铅配置讨论了测量,并显示
柑橘溃疡病影响柑橘生产。该病由柑橘黄单胞菌(Xcc)引起。先前的研究证实,在 Xcc 感染期间,转录激活因子样效应物 (TALE) PthA4 会从病原体转移到宿主植物细胞中。PthA4 与溃疡病易感基因 LOB1(EBE PthA4 -LOBP)启动子区中的效应物结合元件 (EBE) 结合,激活其表达,随后引起溃疡症状。之前,采用 Cas12a/CBE 共编辑方法破坏高度纯合的柚子的 EBE PthA4 -LOBP。然而,大多数商业柑橘品种都是杂合杂交种,更难产生纯合/双等位基因突变体。在这里,我们采用 Cas12a/CBE 共编辑方法来编辑 Hamlin(Citrus sinensis)的 EBE PthA4 -LOBP,这是一种在世界范围内种植的商业杂合柑橘品种。构建了二元载体 GFP- p1380N-ttLbCas12a:LOBP1-mPBE:ALS2:ALS1,并证明其可通过 Xcc 促进的农杆菌素过滤在 Hamlin 叶片中发挥作用。该构建体允许通过 GFP 选择无转基因再生体,编辑 ALS 以生成抗氯磺隆再生体作为基因组编辑的选择标记,这是通过 nCas9-mPBE:ALS2:ALS1 瞬时表达 T-DNA 的结果,并通过 ttLbCas12a 编辑感兴趣的基因(即本研究中的 EBE PthA4 -LOBP),从而产生无转基因柑橘。共产生了 77 株幼苗。其中 8 株幼苗为转基因植株(#Ham GFP 1 - #Ham GFP 8),4 株幼苗为非转基因植株(#Ham NoGFP 1 - #Ham NoGFP 4),其余为野生型。在 4 株非转基因幼苗中,三个品系(#Ham NoGFP 1、#Ham NoGFP 2 和 #Ham NoGFP 3)含有 EBE pthA4 的双等位基因突变,一个品系(#Ham NoGFP 4)含有 EBE pthA4 的纯合突变。我们在 C. sinensis cv. Hamlin 中实现了 EBE PthA4 – LOBP 的 5.2% 非转基因纯合/双等位基因突变效率,而之前研究中柚子的突变效率为 1.9%。重要的是,存活下来的 4 株无转基因植株和 3 株转基因植株均能抵抗柑橘
文章标题:评论:真菌细胞中的CRISPR/CAS12介导的基因组编辑:植物 - 真菌病理学中的进步,机制和未来方向作者:Chiti Agarwal [1],Vishnutej Ellur [1]附属机构[1]附属机构:华盛顿州立大学[1] ORCID IDS:0000-000-000-0003-41125-25-25-8880 [1] chiti.agarwal@gmail.com许可证信息:这项工作已在Creative Commons Attribution许可证下发布开放访问http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/,只要适当引用任何原始工作,该工作就允许在任何媒介中进行无限制的使用,分发,分发和复制。可以在https://www.scienceopen.com/上找到条件,使用条款和发布政策。预印度语句:本文是预印本,未经同行评审,正在考虑,并提交给ScienceOpen的预印本进行开放的同行评审。doi:10.14293/pr2199.000129.v1预印本在线发布:2023年5月14日关键字:CRISPR,CRISPR/CAS12,真菌病原体,植物病原体
背景:SAMHD1 通过切割三磷酸化形式介导对抗癌核苷类似物的耐药性,包括常用于治疗白血病的阿糖胞苷、地西他滨和奈拉滨。因此,SAMHD1 抑制剂是使白血病细胞对基于核苷类似物的疗法敏感的有希望的候选药物。在这里,我们在 SAMHD1 的背景下研究了胞嘧啶类似物 CNDAC 的影响,该物质已被提议作为 SAMHD1 抑制剂。方法:在 13 种急性髓系白血病 (AML) 细胞系、26 种急性淋巴细胞白血病 (ALL) 细胞系、10 种适应各种抗白血病药物的 AML 亚系、24 种单细胞衍生的克隆 AML 亚系和来自 24 名 AML 患者的原发性白血病母细胞中测试了 CNDAC。此外,还建立了 24 个 AML 细胞系 HL-60 和 PL-21 的 CNDAC 抗性亚系。使用 CRISPR/Cas9 破坏 SAMHD1 基因,使用 RNAi 和病毒 Vpx 蛋白耗尽 SAMHD1。通过慢病毒转导实现强制 DCK 表达。用甲基化敏感的 HpaII 内切酶处理基因组 DNA 后,通过 PCR 确定 SAMHD1 启动子甲基化。通过 LC-MS/MS 测定核苷(类似物)三磷酸盐水平。通过酶促测定和结晶分析了 CNDAC 与 SAMHD1 的相互作用。结果:尽管胞嘧啶类似物 CNDAC 预计会抑制 SAMHD1,但 SAMHD1 介导白血病细胞中的内在 CNDAC 抗性。因此,SAMHD1 耗竭会增加 CNDAC 三磷酸盐 (CNDAC-TP) 水平和 CNDAC 毒性。酶促分析和结晶研究证实,CNDAC-TP 是 SAMHD1 底物。在 24 个适应 CNDAC 的急性髓系白血病 (AML) 亚系中,抗药性是由 DCK(催化初始核苷磷酸化)损失引起的。适应 CNDAC 的亚系仅对其他 DCK 底物(例如阿糖胞苷、地西他滨)表现出交叉抗药性。适应不受 DCK 或 SAMHD1 影响的药物的细胞系仍然对 CNDA C 敏感。在适应阿糖胞苷的 AML 细胞中,SAMHD1 增加和 DCK 水平降低导致阿糖胞苷和 CNDAC 抗药性。
2024年第四季度的销售额下降了1.5%,至14.71亿欧元,而2024年第三季度为14.93亿欧元。货物从2024年第三季度的61.7千吨减少到2024年第四季度的5万吨,这是由于可回收和可再生能源细分市场的销量较低,尽管季节性货运较高。调整后的EBITDA在本季度增加到1.16亿欧元(不包括200万欧元的特殊收益),比9,900万欧元(不包括800万欧元的非凡收益)。主要驱动因素是积极的组合,较低的购买价格和积极的估值效应,使较低的数量和较低的价格过度。2024年第四季度的折旧和摊销费用为欧元(54)亿欧元,包括损失欧元(1)百万。Aperam的营业收入在2024欧元中的第四季度的营业收入为6400万欧元,而上一季度的营业收入为4,900万欧元。筹资成本,包括2024年第四季度的FX和衍生品的净成本为欧元(6)百万。本季度的现金成本为1300万欧元。2024年第四季度的所得税费用为欧元(4600万欧元)(包括(16)百万欧元(16000万欧元),延迟税收资产的净纳税资产已被证明是在携带的税收损失和其他税收福利所承认的)。Aperam记录的净结果是2024年第四季度的利润为1200万欧元,而2024年第三季度的利润为1.79亿欧元。
光传感器要有效地工作,它们必须是应用程序的正确类型,以便保持对测量属性的敏感性。•光传感器是许多常见设备的组成部分,包括计算机,复制
