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为什么变异系数为关键度量
somalogic的SOMASCAN®分析是唯一能够测量数千种蛋白质的蛋白质组学技术，同时具有高可重复性的高通量。该平台由称为Somamer®试剂的化学修饰DNA适体提供动力。Somamer试剂由简短的单链DNA序列组成，这些DNA序列结合了疏水性修饰，大大扩展了从中选择体体试剂的大型随机核酸库的生理化学多样性。通过菜单上的Somascan Assay在线菜单工具提供了人血清和血浆中所有Somamer试剂的性能指标。somalogic.com。尽管Somalogic的核心特征（高特异性，灵敏度和可重复性）是Somascan平台从生物标志物发现到临床诊断的主要原因，但其低变异系数（CVS）的功能不足。与其他蛋白质组学技术相比，SOMASCAN测定法的中位数为约5％，从而使研究能力较小的生物学变化具有较高的研究能力。以下讨论捕获了低简历的巨大好处，以及无与伦比的Somascan Platform CVS的特定价值。
随着时间的推移，血浆IP-10水平的定量免疫PCR检测：INFB-1生物制剂的候选药效生物标志物
血浆样品。根据制造商的说明，使用人IP-10 proquantum Immuno-aysay（Thermofisher Scientific）4测量等离子IP-10水平。浓度从标准曲线分析中推断出来。对于差异表达，我们在线性混合效应模型上进行了方差分析。用于吸毒时间相互作用的F检验p值<0.05被认为是显着的。学生的t检验是在药物和安慰剂的AUEC（效应曲线）之间进行的。使用Pearson的相关性进行了前Quantum分析结果与以前的蛋白质组学发现（Somascan®Assayv4.1，somalogic）5之间的比较。分析是在R（版本4.1.2）中进行的。
基于机器学习的生物标志物谱衍生自4210种串行测量的蛋白质预测心力衰竭患者的临床结果
1心脏病学系，伊拉斯mc MC，鹿特丹大学医学中心，荷兰鹿特丹摩伦沃特尔林博士40，3015GD； 2生物统计学系，伊拉斯姆斯MC，鹿特丹大学医学中心，莫伦沃特尔博士40，3015GD，荷兰鹿特丹； 3西北诊所心脏病学系，威廉米纳兰（Wilhelminalaan）12，1815 JD，荷兰阿尔克马尔（Alkmaar）； DELFT技术大学的Delft BioInformatics Lab 4，Van Mourik Broekmanweg 6，2628 Xe，Delft，Delft，荷兰； 5免疫学系，伊拉斯mc MC，鹿特丹大学医学中心，摩伦沃特尔博士40，3015GD，鹿特丹，荷兰； 6病理学系，伊拉斯mus MC，鹿特丹大学医学中心，莫伦沃特尔博士40，3015GD，鹿特丹，荷兰； 7 Somalogic，Inc。，2945 Wilderness Pl。，Boulder，Co 80301，美国； 8美国公共卫生科学系，亨利·福特卫生系统，1福特PL，底特律，密歇根州48202，美国； 9亨利·福特医院（Henry Ford Hospital），亨利·福特医院（Henry Ford Hospital），2799 W. Grand Boulevard，底特律MI，美国48202，亨利·福特医院； 10心脏和血管研究所，亨利·福特医院，2799 W. Grand Boulevard，底特律，密歇根州48202，美国； 11阿姆斯特丹大学医学中心，阿姆斯特丹大学心脏病学系，Meibergdreef 9，1105 AZ，阿姆斯特丹，荷兰； 12英国卫生数据研究研究所和健康信息学研究所，伦敦大学学院，伦敦高尔街，WC1E 6BT，英国；和13年流行病学系，伊拉斯mc MC，鹿特丹大学医学中心，莫伦沃特尔博士40，3015GD，鹿特丹，荷兰
婴儿单心室心脏病分期间的蛋白质组指纹：慢性炎症和生物网络广泛激活的证据
简介：单心室心脏病 (SVHD) 儿童在不同系统和不同时间的发病率显著，70% 的患者出现急性肾损伤，33% 出现神经发育障碍，14% 出现生长障碍，5.5% 的患者出现坏死性小肠结肠炎。蛋白质组学是一种在复杂的生理状态下识别新生物标志物和损伤机制的方法。方法：将处于中间阶段的 SVHD 婴儿与年龄相仿的健康对照进行比较。收集血清样本，在 -80°C 下储存，并在单批次分析中对 1,500 种蛋白质组进行分析（Somalogic Inc.，CO）。使用偏最小二乘判别分析 (PLS-DA) 比较病例和对照的蛋白质组学谱，并使用 t 检验检测单个蛋白质的差异（FDR <0.05）。在 STRING 和 Cytoscape 中执行功能富集的蛋白质网络分析。结果：PLS-DA 仅基于蛋白质组学模式便可轻松区分 SVHD 病例（n = 33）和对照（n = 24）（准确度 = 0.96、R2 = 0.97、Q2 = 0.80）。568 种蛋白质在组间存在差异（FDR <0.05）。我们确定了 25 个上调的功能簇和 13 个下调的功能簇。活跃的生物系统分为六个主要组：血管生成和细胞增殖/周转、免疫系统激活和炎症、代谢改变、神经发育、胃肠系统以及心脏生理和发育。结论：我们报告了 SVHD 患者和健康对照者的循环蛋白质组的明显差异，>500 种循环蛋白质可区分两组。这些蛋白质组学数据确定了多个生物系统中普遍存在的蛋白质失调，并且具有作为 SVHD 发病驱动因素的良好生物学可行性。
工作地点/组织：伊拉斯mus MC大学医学中心鹿特丹系：心脏病学地址：Molewaterplein博士40邮政编码
一般课程（500个单词最大）作为转化心血管流行病学的完整教授的个人陈述，我领导着一项研究界，重点介绍了对心脏病的临床 - 疾病临床 - 人性病学研究的创新方法学方法，包括心脏衰竭；特别强调连续测量的血液生物标志物。我的工作弥合了临床前科学和临床实践之间的差距，在心力衰竭中具有重要贡献，例如1）在不良临床事件及其预后效用之前证明了循环蛋白水平不同的时间模式，以及2）识别基于动态的蛋白质组学 - 基于基于动态的蛋白质组学亚表格。我作为首席研究员获得了超过500万欧元的赠款，领导了几项多中心患者队列研究，其中包括Bio-Shift（HFREF）和Adapt-HFPEF（正在进行的入学）。我与联盟合作，例如Secure-e-Health（ITEA3），Imi Bigdata@Heart，Hermes；欧洲保守研究计划（EORP）；以及包括Labcorp，Somalogic，Olink在内的公司。教育2007博士，流行病学与生物统计学系，伊拉斯米斯MC Rotterdam 2004 MD，医学（和2002年MSC，医学），Erasmus MC Rotterdam 2002 MSC，北荷兰临床流行病学，荷兰卫生科学研究所（NIHES）（NIHES）（NIHES），ROTTERDAM职位/就业职位/就业职位/就业。心脏病学，Erasmus MC Rotterdam 2011-2022助理和IDEM助理教授，2011年 - 2012年荷兰心脏研究所（NHI）高级研究员，UTRECHT 2010- 2011年 - 2011年2011年 - 2011年，DOSTOC研究员。心脏病学，Erasmus MC Rotterdam 2007-2010居民（内科和心脏病学）； Erasmus mc;布雷达（Breda）两栖医院；鹿特丹的Maasstad医院，2006年，美国波士顿，美国波士顿，2010年哈佛医学院心血管疾病预防中心研究员 - 监督20名博士学位学生为正式论文主管（共同促销或促销员），以及3个后Dostocs和> 10个MSC学生。心脏病学，Erasmus MC Rotterdam 2007-2010居民（内科和心脏病学）； Erasmus mc;布雷达（Breda）两栖医院；鹿特丹的Maasstad医院，2006年，美国波士顿，美国波士顿，2010年哈佛医学院心血管疾病预防中心研究员 - 监督20名博士学位学生为正式论文主管（共同促销或促销员），以及3个后Dostocs和> 10个MSC学生。