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World File Search System三聚体
使用 CaverDock 和机器学习筛选全球批准的针对 SARS-CoV-2 高动态刺突糖蛋白的药物
新型严重急性呼吸综合征冠状病毒 2 (SARS-CoV-2) 会引起病理性肺部症状。针对这种病毒的疫苗和药物的大多数开发工作都针对刺突糖蛋白，特别是其 S1 亚基，该亚基被血管紧张素转换酶 2 识别。在这里，我们使用内部开发的工具 CaverDock 使用低温电子显微镜结构 (PDB-ID: 6VXX) 和来自先前发布的分子动力学模拟的五个最密集簇的代表性结构对刺突糖蛋白进行虚拟筛选。配体数据集来自 ZINC 数据库，包括全球批准用于临床的药物。针对完整数据集计算了单个药物通过刺突糖蛋白同源三聚体通道的轨迹、它们在通道内的结合能以及它们与三聚体三个亚基的接触持续时间。然后使用多元统计方法建立结构-活性关系并选择运动抑制的最佳候选药物。这种用于快速筛选多状态蛋白质结构（6 种状态）中全球批准药物（4359 种配体）的新协议在完成计算的速度方面表现出很高的稳健性。该协议是通用的，可以应用于任何具有包含蛋白质隧道或通道的实验性三级结构的目标蛋白质。该协议将在 CaverWeb 的下一个版本中实现（https://loschmidt.chemi.- muni.cz/caverweb/），以便更广泛的科学界可以访问它。2021 作者。由 Elsevier BV 代表计算和结构生物技术研究网络出版。这是一篇根据 CC BY 许可开放获取的文章（http://creativecommons. org/licenses/by/4.0/）。
激光照射对定向能量沉积中铝粉流的影响
催化，4,5酶固定6,7等。MOF的适当性高度依赖于固有的网络拓扑，而金属节点的配置几何形状和组件有机配体的形状又强烈地占据了强烈的影响。8,9这些引人入胜的MOF网络拓扑是使用多种理性方法设计和构建的，其中10-12种采用超分子构建块（SBB）的策略是最受欢迎的策略；在这里，金属 - 有机多面体用作组成块，以组装具有较大空腔和高连接网络拓扑的MOF。13,14超植物（ST），15 - 17，它是传统无机沸石的Sio 4和Alo 4四面体建筑单元，是MOF合成中广泛使用的SBB。两个最广泛研究的介孔MOF（MIL-100和MIL-101）具有相同的MTN沸石拓扑，这是由角落共享的STS产生的，其顶点被铬圆形剂占据。15,16已知MOF中金属三聚体的存在可容纳单个或多种金属离子，具有出色的催化性能以及出色的气体吸附和分离能力。18 - 21报告的众多Zeolitic网络拓扑中，由于STS的增强基于金属三聚体，即MTN 15,16,22和B- Cristobalite网络，只有两种类型可以归类为Zeolitic MoF。17,23,24这可能是由于缺乏单晶X射线
表达稳定化 Hiv-1 进化枝 C 包膜 Gp140 的 V2 热点优化 Mva 疫苗可延迟 Mamu-a*01 阴性恒河猴获得异源进化枝 C 2 级挑战
稳定的 HIV 包膜 (Env) 三聚体蛋白免疫原已被证实能诱导强烈的自体中和抗体反应。然而，关于由病毒载体免疫原表达的稳定 Env 的免疫原性和效力的数据有限。在这里，我们比较了两种基于可变环 2 热点 (V2 HS) 优化的 C.1086 包膜 (Env) 序列的改良安卡拉痘苗 (MVA) 疫苗的免疫原性和效力，一种表达膜锚定 gp150 (MVA-150)，另一种表达可溶性未裂解融合前优化 (UFO) gp140 三聚体 (MVA-UFO)，以 DNA 引发/MVA 加强方法对抗恒河猴 (RM) 中的异源 2 级 SHIV1157ipd3N4 直肠内攻击。两种 MVA 疫苗也表达 SIVmac239 Gag 并形成病毒样颗粒。DNA 疫苗表达 SIVmac239 Gag、C.1086 gp160 Env 和恒河猴 CD40L 作为内置佐剂。此外，所有免疫接种均采用皮内 (ID) 方式进行，以减少疫苗特异性 IFN g + CD4 T 细胞反应的诱导。我们的结果表明，MVA-150 和 MVA-UFO 疫苗均在血清和直肠分泌物中诱导了类似的 Env 特异性 IgG 反应。疫苗诱导的血清抗体显示出针对攻击病毒的 ADCC 和 ADCVI 活性。与之前通过肌肉内途径 (IM) 使用类似免疫原的研究相比，ID 免疫诱导的 SHIV 特异性 CD4 和 CD8 T 细胞反应明显低于 IM 免疫。攻击后，MVA-UFO 接种
在选择性激光烧结中构建取向相关微结构：与零件性能和老化演变的关系
PA-12 粉末原料中存在的低分子量化合物的高分辨率质谱 (ESI-MS) 分析 PA-12 粉末原料中存在的 CHCl 3 可溶性低分子量物质的 ESI-MS 质谱如图 S2 所示。该质谱是在正离子模式下通过直接注入稀释的 CHCl 3 溶液获得的。文献中之前已详细描述了使用液相质谱法鉴定从聚酰胺材料中迁移出的十二内酰胺单体、二聚体和三聚体物质的方法。1 Irganox 1098 是长链脂肪族聚酰胺材料中常用的抗氧化剂。2
全长层粘连蛋白蛋白对于干细胞至关重要
a）全长层粘连蛋白在组织上皮组织和内皮组织的基底膜方面起着核心作用。它们通过与几个细胞表面受体结合，包括整联蛋白，Syndecans，Lutheran血液组糖蛋白以及其他基质蛋白（如Nidogen和Agrin），从而激活细胞信号级联，从而形成细胞外基质和细胞之间的直接结合。b）层粘连蛋白521是天然干细胞生态位的钥匙基底膜蛋白，由人多能干细胞（HPSC）在预植物植入的胚胎的内部细胞质量中表达和分泌。[5] c）层粘连蛋白是三聚体蛋白，同工型是根据相互交织的α，β和γ链的组合指定的。
Paul W. McMullin，SE，PhD
评估膜脂质和蛋白质成分在膜功能中的重要性，包括通过电化学梯度生产和维持膜电位。描述了内膜系统的结构，功能和组件，包括内吞和外生途径。分析细胞骨架元件的不同特性如何促进这些聚合物在细胞中的不同功能。解释运动蛋白如何利用能量沿细胞骨架轨迹移动以诱导肌肉收缩和细胞内运输。检查细胞周期检查点，癌症，基因突变和环境之间的关系。概述了细胞内信号转导机制的基本原理，包括响应特异性，单体和三聚体G蛋白的作用，磷酸化和第二使者。
在没有结构信息的情况下，快速响应亚基疫苗设计
在2020年之前，新型病毒大流行的威胁无处不在，但在很大程度上被忽略了。在2019年冠状病毒病（Covid-19）大流行前12个月，我们的团队获得了流行病准备创新联盟（CEPI）的资助，以建立并验证基于我们的专有分子夹具次基疫苗开发的快速响应管道。在2019年的整个过程中，我们对我们的系统进行了两次模拟测试，用于快速抗原生产，以针对两种潜在的新兴病毒病原体，Achimota paramyxovirus和Wenzhou Mammarenavirus进行了模拟测试。对于每种病毒，我们表达了膜融合蛋白的一小部分重组变体，并筛选出表达水平，产物均匀性以及预期的三聚体前融合构象的存在。从这项练习中学到的教训为我们对Covid-19的反应铺平了道路，我们的候选抗原目前正在I期临床试验中。
甲基群的角色 - 热 - ...
22 E.，Annandale，NJ 08801，美国摘要：芳烃的初始热反应与许多工业应用有关。然而，跟踪越来越多的重度多环芳烃（PAH）的产物极具挑战性，因为许多反应都与分子混合物并行展开。在此，我们研究了2,7-二甲基苯乙烯（DMPY）的反应，以解读轻度热处理过程中甲基取代基的作用。我们发现，甲基取代基的存在是减少自然分子混合物中化学反应所需的热严重程度的关键。通过NMR，质谱和非接触式原子力显微镜（NC-AFM）表征了包括单体，二聚体和三聚体在内的热产物的复杂混合物。确定了广泛的结构转化，包括甲基转移和聚合反应。在多环芳烃在聚合过程中的作用上获得了一种详细的理解。
下一代双价人源 Ad5 COVID-19 疫苗可同时递送刺突抗原和核衣壳抗原，引发 Th1 主导的 CD4+、CD8+ T 细胞和中和抗体反应
图 1 SARS-CoV-2 病毒、刺突、hAd5 [E1-、E2b-、E3-] 载体和候选疫苗构建体。 (a) 三聚体刺突 (S) 蛋白 ( ) 展示在病毒表面；核衣壳 (N) 蛋白 ( ) 与病毒 RNA 相关联。 (b) 受体结合结构域 (RBD) 位于 S1 区域内，其次是其他功能区域、跨膜结构域 (TM) 和位于病毒内的 C 端 (CT)。 (c) 所用的第二代人腺病毒血清型 5 (hAd5) 载体已删除 E1、E2b 和 E3 区域。所示的构建体为 (d) S 野生型 (S-WT)、(e) 具有增强 T 细胞刺激结构域 (S RBD-ETSD) 的 S-RBD、(f) S-Fusion、(g) N-ETSD 和 (h) 二价 hAd5 S-Fusion + N-ETSD；LP – 前导肽。
LINE-1 逆转录转座子的综合结构生物学
背景：LINE-1 (L1) 逆转录转座子通过其两个转录本（多功能酶 ORF2p 和分子伴侣 ORF1p）实现的“复制粘贴”机制写入了近一半的人类基因组。ORF2p 的核心包含一个逆转录酶 (RT)，其 N 端包含一个结构独立的核酸内切酶 (ENDO) 结构域。ORF1p 是小 RNA 结合结构域的卷曲螺旋三聚体组装体，进一步组装形成细胞中的多聚核糖核蛋白 (RNP) 颗粒。LINE-1 已成为与癌症、自身免疫、神经退行性疾病和衰老有关的潜在治疗靶点。我们最近解决了人类 LINE-1 RT 的第一个晶体结构，表征了催化循环中的不同状态以及与抑制剂结合的催化停滞状态。结合对 Line-1 ENDO 和 ORF1p 结构的访问，这使我们能够采取综合发现方法，合理设计调节 LINE-1 功能各个方面的小分子，以满足不同治疗适应症的细微要求。