6-下一个酶将每个GP转换为另一种三碳化合物1,3-二磷酸糖酸。由于每个DHAP分子可以转换为GP,每个GP转换为1,3-二磷酸酯酸,因此对于每个初始的葡萄糖分子,结果是两个分子的1,3-二磷酸糖酸。GP通过将两个氢原子向NAD+转移以形成NADH氧化。酶将这种反应与糖和p之间的高能量键产生。三碳糖现在有两个P组。1 6 7-高能移至ADP,形成ATP,这是糖酵解的第一个ATP产生。(由于步骤4中的糖分,所有产品均加倍。因此,此步骤实际上偿还了两个ATP分子的早期投资。)
葡萄糖对生命至关重要,既是能量来源,又是生长的碳构建块。当葡萄糖受限时,细胞必须利用替代营养物质才能生存(“代谢灵活性”)。最近的研究报告称,癌症和生物体可以使用核苷酸和核酸作为燃料,使它们能够在葡萄糖稀缺的情况下生存,例如在肿瘤微环境中。核苷酸、RNA 和 DNA 在我们的饮食中含量丰富,最近的研究表明,通过基因阻断它们的分解代谢会阻碍癌症的生长(Nature Metabolism 2023,Nature 2023)。用小分子抑制核苷酸分解代谢在肿瘤学、免疫调节和代谢综合征领域具有很高的治疗意义。
Hua Sang 1,2, † , Jiali Liu 2, † , Fang Zhou 2 , Xiaofang Zhang 2 , Jingwei Zhang 2 , Yazhong Liu 2 ,
植物脂质是饮食的重要能源,是石油17基燃料和饲料储备的可持续替代品。种子发芽期间的脂肪酸分解对于幼苗18建立至关重要,但在种子填充过程中出乎意料。在这里,我们证明了脂肪酸的19个生物合成和降解的早期开始,并在油20填充和整个光周期的所有阶段继续进行。在骆驼,菜籽和工程高油的测试中,21烟草生产线证实,在22个发育中产生石油的组织的伴随合成和分解是规则,而不是例外。我们表明,专为23个明显更高的脂肪酸生物合成而设计的转基因无法实现储存脂质24水平的成比例增加,这是由于降解的增加,与预期相比,工程25行的表现不佳。26
免疫代谢研究免疫系统和细胞代谢之间的复杂关系。本研究深入探讨了线粒体 frataxin (FXN) 耗竭的后果,这是弗里德赖希共济失调 (FRDA) 的主要原因,这是一种以协调和肌肉控制受损为特征的使人衰弱的神经退行性疾病。通过使用单细胞 RNA 测序,我们在 FRDA 小鼠模型的小脑内发现了不同的细胞簇,强调缺乏 FXN 的小胶质细胞的稳态反应显著丧失。值得注意的是,这些缺乏 FXN 的小胶质细胞对炎症刺激表现出增强的反应性反应。此外,我们的代谢组学分析揭示了这些细胞向糖酵解和衣康酸生成的转变。值得注意的是,丁酸盐治疗可抵消这些免疫代谢变化,通过衣康酸-Nrf2-GSH 途径触发抗氧化反应并抑制炎症基因的表达。此外,我们确定 Hcar2 (GPR109A) 是一种参与在没有 FXN 的情况下恢复小胶质细胞稳态的介质。对 FRDA 小鼠进行的运动功能测试强调了丁酸盐补充的神经保护特性,可增强神经运动能力。总之,我们的研究结果阐明了小脑小胶质细胞稳态功能紊乱在 FRDA 发病机制中的作用。此外,它们还强调了丁酸盐在减轻炎症基因表达、纠正代谢失衡和改善 FRDA 神经运动能力方面的潜力。
摘要 Cre1 是一种重要的转录因子,可调节碳分解代谢抑制 (CCR),在真菌中广泛保守。cre1 基因已在几种子囊菌中得到广泛研究,而其在担子菌物种中基因表达调控的作用仍不太清楚。在这里,我们鉴定了 Coprinopsis cinerea 并研究了 cre1 的作用,Coprinopsis cinerea 是一种可以有效降解木质纤维素植物废物的担子菌模型蘑菇。我们使用一种基于 PCR 扩增的分裂标记 DNA 盒以及体外组装的 Cas9 引导 RNA 核糖核蛋白 (Cas9 RNPs) 的快速有效的基因缺失方法来生成 C. cinerea cre1 基因缺失菌株。两个独立的 C. cinerea cre1 突变体的基因表达谱显示碳水化合物代谢、植物细胞壁降解酶 (PCWDE)、质膜转运蛋白相关基因和几种转录因子编码基因等显著失调。我们的研究结果支持以下观点:与子囊菌中的报告一样,C. cinerea 的 Cre1 通过多种基因的联合调节来协调 CCR,包括 PCWDE、正向调节 PCWDE 的转录因子和可以导入可诱导 PWCDE 表达的单糖的膜转运蛋白。有些矛盾的是,虽然与其他伞菌一致,但与木质素降解相关的基因在 cre1 突变体中大多下调,表明它们受到的调节与其他 PCWDE 不同。基因缺失方法和此处提供的数据将扩展我们对担子菌中 CCR 的了解,并为与植物生物质降解相关的基因提供功能假设。
修复退行性椎间盘疾病以及使用生长因子治疗脊髓损伤的使用,BAE已在顶级期刊上广泛发表,并在许多国家和国际会议上介绍。他是最早使用生长因子组织工程进行椎间盘,腰椎和颈椎的多级人工椎间盘替代,以及其他新型的医疗设备进行动态稳定和微创脊柱手术。bae获得了哥伦比亚大学工程和应用科学学院的生物力学学士学位。然后,他继续在耶鲁大学医学院赢得了医学学位。他的研究兴趣是对具有机械刺激的人类椎间盘细胞和组织中炎症和分解代谢蛋白的调节。此外,BAE正在测试潜在的生物学处理,以减少体外和体内炎症和分解代谢过程。
背景:在存在“良好”碳源(例如葡萄糖)的存在下,由于综合用于代谢“贫穷”碳源所需的酶的酶,例如乳糖或半乳糖。在许多生物技术过程中,这种现象被称为分解代谢产物抑制作用。因此,找到克服分解代谢物抑制的方法是很大的兴趣。我们的初步实验表明,酿酒酵母半乳糖调节剂的分解代谢物抑制酵母中分解代谢物抑制的模型系统可以通过与半乳糖摄取和分解代谢相关的基因表达的微小变化来克服。目标和方法论:这项工作的目的是了解半乳糖调节的诱导动力学的变化,使这些菌株能够克服分解代谢物的抑制作用。工作需要使用以下参考文献中描述的方法来改变结构基因的实验,并确定其诱导动力学。仪器
溶酶体分解并回收脂质和其他生物分子,以维持各种营养环境中的细胞稳态。溶酶体脂质分解代谢依赖于BIS(Monoacylglycero)磷酸盐(BMP)的刺激活性,这是一种神秘的脂质,其在众多溶酶体相关疾病中都会改变其左旋脂质。在这里,我们回顾了半个世纪前对BMP的发现及其结构特性,可促进脂质水解酶的激活和募集其共激活因子。我们进一步讨论了对BMP分解代谢和合成代谢的当前但不完整的理解。To conclude, we discuss its role in lysosome-associated diseases and the potential for modulating its levels by pharmacologically activating and inhibiting the BMP synthase to therapeu- tically target lysosomal storage disorders, drug-induced phospholipidosis, Alzheimer's disease, Parkinson's disease, frontotemporal dementia, cancer, and viral infection.
地中海盆地预计将被认为是气候变化的热点。在这里,我们使用了地中海的气候对比,以模仿气候变化对垃圾微生物群落的影响。单特异性(Pinus halepensis and Pistacia lentiscus)和垃圾(Pinus/Pistacia,50/50)的二元混合物的垃圾袋在法国和阿尔及利亚之间的对比气候上转移(从亚果和阿尔及利亚之间的对比气候中)。我们测试了垃圾类型(物种身份,混合垫料)和环境环境(海岸/内陆)对更限制气候条件的微生物反应的影响。在田间孵育12个月后,垃圾化学特性(C/N和固态13 C NMR)和微生物标记(活性微生物生物量(MB),基础呼吸(BR),细菌分解代谢和遗传结构(生物学和T-RFLP)表征。>。在田间孵育12个月后,垃圾化学特性(C/N和固态13 C NMR)和微生物标记(活性微生物生物量(MB),基础呼吸(BR),细菌分解代谢和遗传结构(生物学和T-RFLP)表征。转移后,分解代谢和遗传结构与法国和阿尔及利亚控制的分解代谢和遗传结构不同,并且反应取决于上下文和垃圾类型:在内陆环境中观察到更强的修饰,除了小保障小动物的微生物群落(弱变量)。但是,对于这种垃圾类型的转移,MB和BR降低了。另一方面,对于内陆或沿海环境,松弛垫的MB随着转移的响应而没有变化,而BR会在维持生物量和通过呼吸限制C损失方面反映微生物性能。这项研究表明,对气候变化的微生物反应随垃圾类型以及环境心理环境而异。在这里,垃圾混合物没有减轻气候压力对内陆和沿海环境中微生物群落的影响:在内陆环境中转移后转移后检测到较低的MB和BR,而较低的MB伴随着沿海环境中较高的BR,反映了CO 2释放的微生物生物量较弱的CO 2的增加。