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World File Search System反式构象
硝苯地平晶体能量景观的实验和计算机预测
摘要：过去 50 年来，人们已经发现了目前已知的六种硝苯地平 (NIF) 多晶型物，其中最新发现的一种 (δ) 于 2020 年发现，其来自一条不寻常的途径。这种多晶型物在热力学稳定性方面排名第二，但之前的所有研究人员都未能发现，直到在其熔体中接种了一种外来物质非洛地平的晶体，而非洛地平的分子构象与当时已知的所有其他 NIF 多晶型物都不同。鉴于实验室中的这一不寻常发现，我们研究了晶体结构预测 (CSP) 是否可以在“常规”搜索中找到这种多晶型物和其他多晶型物。我们表明，我们的 CSP 可以发现目前已知的所有有序的 NIF 多晶型物均为低能结构（排名 1、3、4 和 43），包括最近通过伪种子发现的一种（排名 4）。 NIF 是一种柔性分子，因此了解其众多构象中的哪一种可作为晶体的最佳构建块是很有意义的。对这一问题的实验研究受生存限制；也就是说，我们仅掌握可观察到的结构的信息，而没有掌握难以观察到或尚未发现的结构的信息。在这方面，我们的“计算机实验”可以访问所有可能性。我们发现，就苯基扭转而言，同平面（sp ）构象产生的能量晶体比反平面（ap ）构象产生的能量低，最稳定的 ap 晶体的能量比最稳定的 sp 结构高 4 kJ/mol。实验上，sp 构象在溶液中优于 ap，并且是晶体中观察到的唯一构象。就酯扭转而言，顺式/反式构象产生的能量晶体最低，其次是顺式/顺式构象，最后是反式/反式构象。实验表明，六种已知多晶型物中有五种包含顺式/反式构象异构体，一种包含顺式/顺式构象异构体，没有一种包含反式/反式构象异构体。总体而言，尽管 NIF 的构象空间复杂，但 CSP 在预测其多晶型物方面非常成功，并且定量评估了使用不同构象异构体作为晶体构建单元的相对成本。■ 简介
在新型 CCSD(T) 机器上进行量子计算-...
摘要：乙醇是燃烧、天体化学和凝聚相溶剂中研究较为基础的分子。它的特点是具有两个甲基转子以及反式（反）和左旋构象异构体，已知它们的能量非常接近。本文我们表明，基于对振动零点态的严格量子计算，使用新的从头算势能面 (PES)，基态类似于反式构象异构体，但存在向左旋构象异构体的显著离域。这解释了关于识别和分离这两个构象异构体的实验问题。氘化 OH 基团时，这种“泄漏”效应会部分猝灭，这进一步证明了需要采用量子力学方法。采用扩散蒙特卡罗和全维半经典动力学计算。新的 PES 是通过 Δ 机器学习方法从预先存在的低级密度泛函理论表面开始获得的。使用相对较少的从头计算 CCSD(T) 能量，将该表面提升至 CCSD(T) 理论水平。标准测试的校正 PES 与直接从头计算结果之间的一致性非常好。还报告了侧重于反式扭转运动的一维和二维离散变量表示计算，结果与实验结果相当一致。■ 简介