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RTPCR：QPCR数据分析 DACC：气候变化的检测和归因分析 接吻：保持简单的物种迁移模型 SGOF：多个假设测试 创建R对象的紧凑型哈希摘要 MLMTS：多元时间序列的机器学习算法 分析依赖量表的生物多样性变化与MOBR 机器：机器学习模型和工具 nmf：非负矩阵分解（NMF）的算法和框架 软件包'mobr' ddml：双/辩护机器学习 胚胎：通过期望最大化的稳健贝叶斯变量选择 'Google gemini'api 的接口 Jackstraw：无监督学习的统计推断 ODT：最佳决策树算法 具有组成反应的多元随机森林 软件包'joinet' rgbif.pdf OpenCV.pdf 软件包'mapme.biodoverity' MLR3DATA：“ MLR3'的机器学习数据集的收集 生存：使用机器学习的灵活生存分析工具 bio3d.pdf
描述各种方法用于实时PCR（定量PCR或QPCR）数据的统计分析和图形表示。'rtpcr'负责基于多达两个参考基因的实时PCR数据的扩增效率计算，统计分析和图形表示。通过考虑放大效率值的考虑，“ RTPCR”是由Ganger等人描述的一般计算方法开发的。（2017）和Taylor等。（2019），涵盖了livak和pfaffl方法。基于实验条件，“ RTPCR”包装的功能使用t检验（用于具有两级因子的实验），方差分析（ANOVA），协方差分析（ANCOVA）分析（ANCOVA）或重复测量数据分析以计算到calcu- colcu- flta delta delta delta delta delta ct方法（delta cta）或dela dela dela dela（re）（re）（re）。该功能进一步提供了平均值的标准误差和置信度间，采用统计平均比较并具有重要意义。为了促进功能应用，使用了不同的数据集作为示例，并解释了输出。“ RT- PCR”软件包还使用各种控制参数提供条形图。“ rtpcr”包装是用户友好且易于使用的，并提供了用于分析实时PCR数据的适用资源。
GREPore-seq：通过长距离 PCR 和纳米孔测序检测基因编辑后变化的强大工作流程
为了充分发挥基因编辑技术在临床治疗中的巨大潜力，需要彻底评估靶向编辑和非预期编辑的后果。然而，目前缺乏一种全面、流水线化、大规模且经济的工作流程来检测基因组编辑结果，特别是插入或删除大片段。在这里，我们描述了一种通过对条形码长距离 PCR 产物进行纳米孔池测序来有效准确地检测 CRISPR-Cas9 编辑后的多个基因变化的方法。为了克服纳米孔测序的高错误率和插入缺失，我们开发了一种流程，通过对纳米孔扩增子测序 (GREPore-seq) 的读取进行 grepping 来捕获条形码序列。GREPore-seq 可以检测 NHEJ 介导的双链寡脱氧核苷酸 (dsODN) 插入，其准确度与 Illumina 下一代测序 (NGS) 相当。GREPore-seq 还可以识别 HDR 介导的大基因敲入，这与 FACS 分析数据高度相关。还检测到了 HDR 编辑后的低水平质粒骨架插入。我们建立了一个实用的工作流程来识别遗传变化，包括量化 dsODN 插入、敲入、质粒骨架插入和 CRISPR 编辑后的大片段缺失。该工具包用于对汇集的长扩增子进行纳米孔测序，在评估靶向 HDR 编辑和超过 1 kb 的意外大插入缺失方面应具有广泛的应用。GREPore-seq 可在 GitHub 上免费获取（https://github.com/lisiang/GREPore-seq）。
使用通用循环模型在气候变化方面的河流盆地未来温度变化的投影
背景和目标：乔丹由于其干旱的气候和人口密度高而面临水资源挑战。这项研究选择了Zarqa河流域的一般循环模型，以在四个时期的共享社会经济途径2-4.5和5-8.5方面投射未来的温度变化：2015-2040，2041-2060，2061-2060，2061-2080，以及2081-2100，评估气候对水资源的影响。方法：统计缩减模型促进了在四个不同的时间范围内两种共享社会经济途径的温度波动的投影。该模型的预测因子来自一般循环模型和重新分析数据集。结果表明，Zarqa河盆地温度与选定的一般循环模型之间存在很强的相关性。在校准期（1983-2000）和验证期（2001-2014）期间，该模型准确地反映了温度特征。对扎尔卡河盆地内六个站进行了预测。发现：在选定的一般循环模型中，联合Kingdm地球系统建模项目和Hadley Center全球环境模型3 - 全球耦合配置3.1预测温度最快的升高。高发射方案（共享社会经济途径5-8.5）预测温度的上升比低发射方案（共享的社会经济途径2-4.5）。的预测表明，扎卡河盆地的北部将比南部地区进行更大的变暖，而2090年代相对于2050年代，预期的会大幅度增加。最低温度在最高温度速率的两倍上升高。到2100年，共享社会经济途径中的最高温度预计将在3.44-4.91摄氏度上升高，而在共享的社会经济途径5-8.5方案中，增加将增加5.5-6.2摄氏度。结论：该研究成功地开发了一个在共享的社会经济途径的情况下，为Zarqa河流域中未来温度预测的统计缩减模型。分析表明，扎尔卡河流域预计会经历以较高温度和降水降低的气候，而二十一世纪后期预期的温度显着升高。这些发现可能会为区域水文和环境建模提供宝贵的见解，并有助于评估生态系统可持续性。
气候变化的社会经济和就业影响
欧洲环境局4最近从这种意义上表示了自己的看法，强调欧洲大陆面临着一个加速的变暖过程，每个国家都面临着非常异构的影响，其中一些人受到极端降水和灾难性的洪水的影响，而其他国家则由于降水量的大量减少和更严重的干旱而受到了巨大的危害。在后一个地区，气候变暖已经对农业生产，能源生产，户外工作，夏季旅游业以及更多森林大火的倾向产生影响。其主要结论是，欧洲没有为快速增长的气候风险做好准备，而气候风险的增长速度比我们作为一个社会的准备更快。该报告清楚地表明，欧洲是最快的变暖大陆，但西班牙是受影响最大的欧盟国家之一。因此，它会面临严重的气候风险，并产生倍增和级联效应。
物种生物学和人口统计历史决定了物种在热带岛屿特有鸟类中对气候变化的脆弱性
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证（未经同行评审证明）获得的是作者/资助者，他授予Biorxiv授予Biorxiv的许可，以永久显示预印本。它是制作
深海衍生的镁增强水对微生物组变化的代谢疾病的影响
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在丽贝卡·埃利奥特（Rebecca Elliott）的水下：损失，洪水保险和美国气候变化的道德经济
仍然是理论上的'（圣约翰，2019年）。作为受飓风桑迪（Sandy）影响的居民，并且正如丽贝卡·埃利奥特（Rebecca Elliott）的书提醒我们的那样，气候变化的影响不仅是理论上的。随着佛罗里达州门口的浮游圈和在加利福尼亚的郊区撕裂的野生动物撕裂，很明显，城市必须改变或继续面临破坏。问题是 - 面对巨大的损失，谁负责这一变化？在水下：损失，洪水保险和美国气候变化的道德经济，丽贝卡·埃利奥特（Rebecca Elliott）的奇异成就正在创建一个社会学框架，以面对这个问题。这本书是围绕损失的概念而组织的，这些损失源于损失，这些损失源于克利姆特的变化。埃利奥特（Elliott）认为，由于“现在显而易见的是气候变化破坏，损害和摧毁”（埃利奥特（Elliott），2021b，p。3），已经过去了社会科学家将他们的意义转移到旨在管理这些损失的机构中。通过保险，气候风险得到了经济的评估，或者是如何在家庭财政上进行节省的。为了说明这种动态的埃利奥特（Elliott），通过对美国浮游保险的深入历史和社会学考试来研究气候变化的道德经济。她的经验重点是国家洪水保险计划（NFIP）。水下的主要产物是损失的政治，在家里近在咫尺。这本书始于一个关于皇后区居民的故事。虽然Doyle的家不再在水下，但可能是如此。尽管他的墙仍然带有桑迪（Sandy）浮出水面的痕迹，但帕尔默·道尔（Palmer Doyle）的主要关注点是他是否负担得起新的保险费率。埃利奥特（Elliott）的中心论点是，保险是一个损失的地点，随后出现了道德困境（Elliott，2021b，p。7）。谈判包括关于公平和有价值的问题，以及关于谁可以在哪里，在哪里，多长时间和以多少代价生活的政治和道德问题。对于埃利奥特（Elliott）来说，气候变化的道德经济可以概念化为围绕损失的三个相互关联的困境集：责任，正当和损失的补偿。这些困境在多章中出现并重叠，说明了道德经济的复杂性质。这本书的经验故事是按时间顺序组织的，围绕过去，预先提出和可能的未来。在第1章中，埃利奥特（Elliott）提供了历史性的概述，概述了它所面临的NFIP和困境的起源，负责损失。埃利奥特（Elliott）描述了如何通过保险来构建的风险，以及这种转变如何需要“良性行为的特定愿景”以降低风险（Elliott，2021b，p。28）。在解决补贴利率可能对长期洪水土地利用的影响时，决策者和联邦官员认为，假设房屋已被损坏后，将被放弃，从而造成补贴政策的“自然磨损”（Elliott，2021b，2021b，p。56）。房主挑战了这样的假设，即财务薪酬是他们将损失的一切的公平权衡。这将水下放在对话中当这种消耗没有实现时，1973年对NFIP的叙述性的理由转移到了洪流受害者的应有性，以访问财务财务。在第2章中，埃利奥特（Elliott）将读者带入纽约人的家园，以应对飓风桑迪（Sandy）的后果，在那里失去财产意味着失去家庭和社会关系。对于一个面临决定支付100 000美元来减轻风险或将其子女送入大学的妇女来说，流量保险将财务价值带到风险上（Elliott，2021b，第83页）。尽管埃利奥特（Elliott）描述了详细的道德损失经济，但她从未看不见保险既是机构又是一门技术。
认可印度尼西亚的土著人民价值观，以解决气候变化的政策
抽象的气候变化对脆弱的社区有重大影响；其中之一是土著人。土著人民对环境和自然资源的依赖性和亲密关系表明，他们必须是第一个体验气候变化的负面影响的人。该摘要着重于政策改革和战略，以应对印度尼西亚的气候变化，以认识到土著人民中的环境价值观。当前对印度尼西亚气候变化的管理表明，土著人民参与政策制定以及缓解气候变化和适应的行动存在差距和弱点。本文首先解释了法律保护的保证，并确定了受气候变化影响的人们的权利，包括研究印度尼西亚现有的气候变化政策是否支持土著人民。除此之外，印度尼西亚土著人民描绘的环境价值的出口也是提出对气候变化处理政策策略的认可的基础。回答法律问题，选择了法律和文学研究。拟议的对环境价值观的认可将旨在保护和维持在气候变化的威胁中土著人民的存在。研究结果将成为政府的建议，首先要改革有问题的政策，以采取进一步的步骤认识规定的环境价值。最后，强烈期望本文对“气候立法”的中间有重大贡献
喀麦隆（中非）城市地区地下和雨水中分离出的某些芽孢杆菌菌株的抗生素敏感性以及季节变化的潜在影响
Morelle Raïsa Djiaala Tagne、Mireille Ebiane Nougang、Edith Brunelle Mouafo Tamnou、Awawou Manouore Njoya、Pierrette Ngo Bahebeck、Samuel Davy Baleng、Paul Aain Nana、Yves Yogne Poutoum、Genevieve Bricheux、Claire Stéphane Metsopkeng、Télesphore Sime-Ngando 和 Moïse Nola DOI： https://doi.org/10.22271/micro.2023.v4.i1b.72 摘要 这项研究评估了在雅温得（喀麦隆）的井和雨水样本中分离的蜡状芽孢杆菌、苏云金芽孢杆菌和枯草芽孢杆菌菌株的抗生素敏感性。在长旱季 (LDS)、短旱季 (SDS)、长雨季 (LRS) 和短雨季 (SRS) 期间每月收集水井水样，对于雨水则在 LRS 和 SRS 期间收集。考虑的抗生素包括亚胺培南、阿米卡星、庆大霉素、环丙沙星、氧氟沙星、磺胺甲唑和四环素。对于来自地下水的菌株，对于苏云金芽孢杆菌，抗生素抑制直径从 9.13 毫米（SDS 期间的磺胺甲唑）到 32.78 毫米（LDS 期间的亚胺培南），对于蜡状芽孢杆菌，抗生素抑制直径从 8.2 毫米（SDS 期间的磺胺甲唑）到 35.25 毫米（LDS 期间的亚胺培南）不等，对于枯草芽孢杆菌，抗生素抑制直径从 5.05 毫米（LRS 期间的氧氟沙星）到 29.25 毫米（LDS 期间的亚胺培南）。雨水中的芽孢杆菌直径从 4.55 mm（LRS 期间使用磺胺甲唑）到 25.65mm（LRS 期间使用亚胺培南），蜡状芽孢杆菌从 2.13 mm（LRS 期间使用亚胺培南）到 20.05mm（SRS 期间使用亚胺培南），枯草芽孢杆菌从 5.03 mm（SRS 期间使用庆大霉素）到 25.15mm（SRS 期间使用四环素）。LRS 期间分离出的芽孢杆菌菌株对大多数抗生素具有多重耐药性。大多数抗生素的抑菌直径在不同季节之间存在显著差异（p<0.05）。关键词：抗生素敏感性，芽孢杆菌菌株，地下水和雨水，抑菌直径变化 1. 引言 不同国家的水消耗量差异很大。这取决于其发展、人口和资源本身。当水被污染时，水会成为许多疾病的主要传播媒介之一，而这些疾病是导致人类或动物大规模流行病的原因。污染源包括河流、水体、咸水以及雨水、露水、雪和极地冰。每种环境中的水都可能被化学物质和微生物污染，包括原生动物、病毒和细菌 [1] 。水环境中有各种细菌科。这些微生物具有各种特性。通常用于识别细菌微生物的一些特性是革兰氏染色细胞壁和产孢特性。芽孢杆菌属细菌被称为革兰氏阳性菌和产孢菌。它们存在于空气、水中或土壤中 [2] 。对于人类来说，一些芽孢杆菌种是病原体或机会性病原体，而另一些只是共生菌。然而，细菌的共生特性取决于其环境中的几个因素 [3] 。除了食物中毒外，这些细菌会引起局部和全身感染，有时会导致患者死亡 [4, 5] 。多年来，人们也认识到生物颗粒对大气过程的潜在相关性 [6, 7] 。空气中的生物颗粒作为一个整体也被称为生物气溶胶。它们可以包括细菌细胞和细胞碎片、真菌孢子和真菌