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World File Search System可再现的
定量和可再现的生物缀合
生物结合是两种生物分子的化学连接，形成了一种单个杂种，该杂种保留了每个成分的生物学活性，但提供了每种单独的生物分子都无法实现的新功能。最复杂的生物分子（例如蛋白质）仅在水性环境中存在并起作用。因此，必须在水溶液中进行生物缀合物的制备，任何合适的生物偶联化学都必须保留此类环境中生物分子的生物学活性和功能。结合物通常是通过向两个生物分子中的每个分离的单独但互补的官能团添加而形成的。这些官能团通常是通过称为修饰的过程引入的，该过程包括将接头连接到感兴趣的生物分子上存在的胺或硫醇组。然后将两个修饰的生物分子混合在一起，通过在修饰过程中掺入的互补接头形成所需的生物缀合物。图1给出了此修改和共轭过程的典型工作流程。
定量和可再现的生物缀合
生物结合是两种生物分子的化学连接，形成了一种单个杂种，该杂种保留了每个成分的生物学活性，但提供了每种单独的生物分子都无法实现的新功能。最复杂的生物分子（例如蛋白质）仅在水性环境中存在并起作用。因此，必须在水溶液中进行生物缀合物的制备，任何合适的生物偶联化学都必须保留此类环境中生物分子的生物学活性和功能。结合物通常是通过向两个生物分子中的每个分离的单独但互补的官能团添加而形成的。这些官能团通常是通过称为修饰的过程引入的，该过程包括将接头连接到感兴趣的生物分子上存在的胺或硫醇组。然后将两个修饰的生物分子混合在一起，通过在修饰过程中掺入的互补接头形成所需的生物缀合物。图1给出了此修改和共轭过程的典型工作流程。
可再现的医疗保健生成AI评估
背景和意义生成AI（GAI）系统正在为广泛的医疗保健用例部署，包括临床决策支持，行政任务，医学教育和医学研究应用程序[1]。虽然GAI技术提供了有前途的能力，但它们在医疗保健中的利用带来了重大风险，对患者的安全产生了影响[2-3]。为了实际解决安全问题，同时保持GAI在医疗保健中的益处，技术方法已经发展到了使用独立的大语言模型（LLMS）以将控制和护栏纳入复杂，可验证的系统中。检索功能生成（RAG）代表一种这样的方法，通过将策划内容的响应扎根[4-5]，从而在医疗保健实施中提供了有希望的降低风险。通过这种体系结构，与独立的LLM相比，索引基于证据的来源时，抹布系统可以减少幻觉和不准确的产出，从而证明了事实，完整性和引文准确性的提高[4-5]。尽管如此，幻觉 - 模型输出内容缺乏事实基础或与已建立的证据相矛盾的发生的情况非常具有挑战性，可以完全挑战，而不会损害整体绩效[6-7]。即使有了这些建筑改进，可靠评估方法的实际应用对于量化临床使用中的潜在风险仍然至关重要。医疗保健GAI系统的评估方法在方法论和严格方面差异很大。尽管文本复杂度量（例如BLEU，Rouge和Helm）和传统的统计措施已被广泛用于评估LLM生成的文本的质量[8-13]，但这些指标主要衡量与参考的文本重叠程度，并不能完全捕获开放式，创造性的输出可以产生llms的创作能力。生成模型可以使用与参考有很大不同的措辞或结构正确传达信息，或者它们可以自信地提供合理的声音，但实际上是不正确的细节。因此，单独的文本比较指标无法充分评估LLM的自由形式反应在临床上是否准确，也无法可靠地评估医疗保健环境中的有用性[14]。这一限制促使人们广泛采用了人类评估方法，如Chow Tam对142项研究的荟萃分析所证明的那样，采用人类评估者评估临床适当性[11]。对研究医疗保健中的破布实施的37项研究的系统评价确定了人类和自动化方法的关键评估维度，包括准确性/正确性，完整性，忠诚/一致性，相关性和流利性[7]。随后对2018 - 2024年人类评估研究的综述确定了评估医疗保健LLM的安全性，可靠性和有效性的关键主题[11]。这些基本评估维度是通过在成对人类评估方法中检查了九个特定方面的前面工作，包括准确性，正确性，适当性和安全性[15]。WEI对评估GAI对临床问题的反应的医学专业人员的系统评价和荟萃分析[12]表明，尽管准确性和正确性是一致的主题，但测量方法在不同的Likert量表和评分系统中都有不同。尽管为医疗保健中GAI工具的人体评估维度而出现了共同的主题，但特定定义，实施方法和评分方法仍存在显着差异。这种方法学变化给寻求清晰的操作模型评估和监视GAI Systems
ciftistorm管道：促进可再现的脑电图/meg源连接
我们提出了ciftistorm，这是一种电生理源成像（ESI）管道，该管道结合了最近开发的改善正向和逆溶液的方法。Ciftistorm管道产生人类连接组项目（HCP）和符合空间分辨率程度的数据集输入的MegConnectome兼容输出。输入数据的范围可以从没有结构磁共振成像（SMRI）的低传感器密度脑电图（EEG）或磁脑电图（MEG）录制到具有HCP多模态SMRI符合SMRI的HCP EEG/ MEG记录。ciftistorm将铅场和几何校正的数字质量控制引入了正向建模的头部和源模型。对于反向建模，我们提出了基于多个先验的源头光谱的贝叶斯估计。我们促进了从单个SMRI获得的T1W/fsaverage32k高分辨率空间中的ESI。我们通过比较来自HCP MEG和MRI标准化数据集前十年中获得的CUBAN HUMEN BRAIN MAPPICS项目（CHBMP）的EEG和MRI数据的Ciftistorm输出来验证此功能。
moshpit：Qiime 2框架上的可访问，可再现的元基因组数据科学
图1。Moshpit和示范分析的概述。（a）当前分析工作流的示意图。对Kaiju的分类注释得到了原始阅读的支持，并且可以将Kraken 2应用于对原始读取，重叠群或脱封的MAGS进行分类。用蛋酒贴剂的功能注释可用于重叠群或（解换）mags。（b）塔拉海洋数据集的重新分析。该地图描绘了全球收集样品的香农多样性，对四个位置的缩放视图显示了跨样本深度的分类学分配。bray-curtis主坐标散点图突出了深海样品之间的组成相似性。（C-D）基于读取（C）和基于MAG的可可分析（D）在发酵过程中表现出一致的多样性下降，并伴随着功能基因谱的变化。
研究文章Linguaphylo：一种可再现的系统发育分析的概率模型规范语言
系统发育模型已经变得越来越复杂，系统发育数据集在规模和丰富度方面都扩大了。但是，当前的推理工具缺乏模型指定语言，可以简单地描述完整的系统发育分析，同时独立于实施细节。我们引入了一种新的轻巧和简洁的模型规范语言“ lphy”，该语言被设计为人类和机器可读性。图形用户界面伴随“ lphy”，允许用户构建模型，模拟数据并创建描述模型的自然语言叙述。这些叙述可以作为手稿方法部分的基础。此外，我们提出了一个命令行界面，用于将LPHY指定模型转换为与BEAST2软件平台兼容的分析规范文件（XML格式）。总的来说，这些工具旨在增强植物研究中描述的清晰度和概率模型的报告，最终促进结果的可重复性。
einprot：用于定量蛋白质组学数据统计分析的灵活，易于使用，可再现的工作流程
定量蛋白质组学已经走了很长一段路 - 过去在蛋白质组学研究小组中进行的专门分析是许多蛋白质组学核心设施中的常规服务，并且可以提供大量复杂的量化和分析工具。然而，必要的报告任务，包括对所得数据的统计分析，以及描述所有数据处理步骤，提供质量控制，探索机会和以用户友好方式发布的可视化，通常不是常规或自动化的，并且可以想象许多不同的分析工程（Peng等，20233）。此外，通常需要进行其他下游分析并与其他类型的数据集成，并且当常规数据分析工作流程的所有步骤透明且记录良好时，这些分析更有可能成功。
Calogero的实验室和BGCore -Calogerolab
•我们的工具，包括用于批量RNASEQ分析的Docker4Seq和用于单细胞RNASEQ分析的RCASC，利用Docker容器来高效，可扩展和可再现的工作流程。•个性化的Docker容器：
肿瘤免疫微环境的患者来源的肿瘤外植体模型揭示了明显且可再现的免疫疗法反应
Patient-derived tumor explant Models of tumor immune Microenvironment Reveal Distinct and Reproducible Immunotherapy Responses Rita Turpin * 1.2, Karita Peltonen 3.4,5 *, Jenna H. Coast 2, Ruixian Juo 1, Anita N. Kumari 3,4 1, Moon Hee Lee 3,4, Minna Mutka 6, Panu E. Kovanen 6, Laura Niinikoski 7，Tuomo Meretoja 7，Johanna Mattson 8，PetrusJärvinen9，Kanerva Lahdensuo 9，RiikkaJärvinen9，Sara Tornberg 9，Tuomas Mirtti 10，PiaBostrti 10，PiaBoström11，Ilkka Koskka Koskka Koskka Koskka Koskka Koskka Koskka Koskka Koskka Koskka Koskka Koskka Koskka Koskka Koskka Koskka Koskka Koskka Koskka Koskkivuo 12。 Pouwels 1，MaijaHollmén2 **，Satu Mustjoki 3,4,5 **，JuhaKlefström1,14,15,16** 1癌细胞巡回赛实验室，转化癌症医学，医学院，赫尔辛基大学医学院。
为明天制作的HPLC
最低的色散，快速和精确的梯度以及高度可再现的流速和保留时间使1290 Infinity III LC系统您的最佳前端三倍四倍体和（q-）TOF检测。这些LC/MS系统非常适合对药物杂质和代谢产物，食品安全，环境污染物以及法医/毒理学的高度特异性和超敏分析。