母亲反对脱皮性同源物4(SMAD4)是介导TGF-β信号转导的Smad转录因子家族的成员。SMAD4功能突变或缺失的丧失在约30%的胰腺导管腺癌(PDAC)和大肠癌腺癌和食管腺癌患者的15%,并且与预后不良有关。在过去的二十年中,其肿瘤抑制作用的作用已被阐明,SMAD4的损失足以促进多种GEM模型中的肿瘤发生。为了识别SMAD4缺陷癌的新型治疗脆弱性,在SMAD4等源性PDAC模型中采用了CRISPR辍学方法。我们将stearoyl-COA去饱和酶SCD鉴定为Smad4缺陷型环境中的合成致命靶标。scd对于从头脂质生物发生至关重要,并催化单不饱和脂肪酸的产生速率限制步骤。体外遗传学和药理学研究证实了这种合成的致命关系。此外,药物锚定的CRISPR辍学筛选和RNA表达分析表明,饱和脂肪酸对SCD抑制作用的积累驱动SMAD4缺陷细胞中的细胞毒性。用基于CRISPR的SCD敲除和特征良好的SCD抑制剂(A939572)的小鼠研究表明,SMAD4-突变异种移植模型中具有抗肿瘤功效。但是,与SCD的遗传基因敲除(KO)相比,药理学抑制剂在抑制体内肿瘤增殖方面的有效性较小。一起,这些数据将SCD识别为SMAD4突变癌中的选择性漏洞。
目标:恶性外周神经鞘肿瘤(MPNST)是高度侵略性的麦芽瘤,治疗率有限,存活率较差,因此需要发展新的治疗疗法。由于由近端抑制基因CDKN2A损失造成的乘客缺失,大约25-50%的MPNST港口丧失酶甲基腺苷磷酸化酶(MTAP)损失。PRMT5由于底物甲基噻吩并腺苷(MTA)的积累而被鉴定为MTAP被骨化细胞中的选择性依赖性,该细胞本身就是内源性PRMT5抑制剂。TNG908和TNG462是临床阶段MTA合件PRMT5抑制剂,可分别证明对MTAP细胞的选择性分别在15倍和45倍的MTAP -INTACT -INTACT细胞上。先前的报道表明,这两个分子都驱动了各种MTAP癌症组织学的异种移植模型中耐用的肿瘤回归。在这里,我们的目标是检查临床前MPNST模型中TNG908和TNG462的活性。
结果:〜20K药物和目标的学习机制捕获了关键的功能关系。将平台应用于高度选择性的USP1抑制剂TNG348,我们确定了和验证的细胞机制,解释了整个肺癌细胞系和PDX模型的药物反应变化> 50%。响应映射可以开发预测性生物标志物逻辑和潜在合理组合。