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马立克氏病疫苗诱导白来航鸡初级淋巴器官囊中已知和新型微小RNA的差异表达
摘要 马立克氏病 (MD) 是由 MD 病毒引起的家鸡传染病。MD 主要通过疫苗接种来控制，但世界各地仍时有发生。常用的 MD 疫苗包括 HVT、SB-1 和 CVI988/Rispens，据报道，它们的效力取决于多种因素，包括宿主遗传学。我们之前的研究表明，MD 疫苗的保护效力在不同鸡种之间可能存在巨大差异。深入了解调节疫苗效力的潜在遗传和表观遗传因素将极大地改善更有效疫苗的设计和开发策略。两种高度近交系的白来航鸡接种了 HVT 和 CVI988/Rispens。接种疫苗后 26 天采集法氏囊样本，并进行小 RNA 测序分析以分析微小 RNA (miRNA)。接种 HVT 或 CVI988/Rispens 后，在一个品系（称为品系 6 3 ）中总共鉴定出 589 个和 519 个 miRNA，在另一个品系（称为品系 7 2 ）中鉴定出 490 个和 630 个 miRNA。与同一品系的未接种疫苗组相比，HVT 和 CVI988/Rispens 在品系 6 3 鸟中诱导了互相排斥的 4 个和 13 个差异表达 (DE) miRNA。HVT 未能诱导任何 DE miRNA，而 CVI988/Rispens 在品系 7 2 鸟中诱导了一个 DE miRNA。预测了数千个 DE miRNA 的靶基因，这些靶基因在各种基因本体术语和通路中富集。这一发现表明表观遗传因素 microRNA 很可能参与调节鸡的疫苗保护功效。
细菌菌群和促炎细胞因子在经过处理和未经处理的特应犬的肛门囊中：与健康对照组的比较
肛门囊炎的发病机理尚未得到广泛的研究，尽管特应性狗似乎易于这种疾病。因此，这项研究的目的是在三组（健康的狗，未经治疗的狗，未经治疗的狗和特种狗接受抗精神病药或过敏性免疫疗法）中，在肛门症状上，在肛门症状上是否可以在SacciC上进行变化。通过使用Illumina Tech-nology测序15个健康狗的14只健康狗，14只未经治疗和6种经过治疗的特应犬的细菌群体的细菌种群，通过对16S rRNA基因的V4区域进行测序。通过Luminex多重测试分析促炎细胞因子。 在健康和未经处理的ATOPIC犬的肛门SAC之间以及未经处理和未经治疗的ATOPIC犬（分别为P = 0.012和P = 0.017）之间， commitition的成员和结构都显着差异（分别为p = 0.002和p = 0.003）。 然而，在健康和经过治疗的狗中，社区结构相似（p = 0.332）。 Among the proinflammatory cytokines assessed, there was no significant difference between groups, except for interleukin 8 which was higher in the anal sacs of untreated atopic dogs compared to treated atopic dogs ( P = 0.02), and tumor necrosis factor-alpha which was lower in the anal sacs of healthy dogs compared to treated atopic dogs ( P = 0.04). 这些结果揭示了特应犬的肛门囊中的营养不良，这可能部分解释了特应犬的易感性，以发展细菌性肛门囊炎。促炎细胞因子。commitition的成员和结构都显着差异（分别为p = 0.002和p = 0.003）。然而，在健康和经过治疗的狗中，社区结构相似（p = 0.332）。Among the proinflammatory cytokines assessed, there was no significant difference between groups, except for interleukin 8 which was higher in the anal sacs of untreated atopic dogs compared to treated atopic dogs ( P = 0.02), and tumor necrosis factor-alpha which was lower in the anal sacs of healthy dogs compared to treated atopic dogs ( P = 0.04).这些结果揭示了特应犬的肛门囊中的营养不良，这可能部分解释了特应犬的易感性，以发展细菌性肛门囊炎。由Atopic Dogs（Oclaci-tinib，Desloratadine和过敏原特异性免疫疗法）接受的治疗方法将肛门囊的微生物群转移到健康狗的菌群中。需要进一步的研究来鉴定出特应犬的肛门囊炎的重要细胞。
DNA 存储在热敏微胶囊中，用于重复随机多路复用数据访问
1. 荷兰埃因霍温理工大学生物医学工程系化学生物学实验室 2. 荷兰埃因霍温理工大学复杂分子系统研究所 (ICMS) 3. 荷兰埃因霍温理工大学生物医学工程系计算生物学组 4. 美国华盛顿州雷德蒙德市微软公司 5. 美国华盛顿州西雅图市华盛顿大学保罗·G·艾伦计算机科学与工程学院 6. 荷兰埃因霍温理工大学化学工程与化学系自组织软物质实验室 7. 荷兰奈梅亨拉德堡德大学医学中心内科系和拉德堡德传染病中心 (RCI) 8. 英国剑桥市微软研究院 9. 英国布里斯托尔大学化学学院原始生命研究中心和有组织物质化学中心 10. 学校上海交通大学材料科学与工程系，上海，中国 11. 上海交通大学张江高等研究院（ZIAS），上海，中国。 12. 华盛顿大学电气工程系，华盛顿州西雅图，美国 13. 荷兰奈梅亨拉德堡德大学分子与材料研究所 14. 荷兰埃因霍温-瓦赫宁根-乌得勒支联盟生命技术中心 * 通讯作者 电子邮件：yuanjc@microsoft.com；tfadgreef@tue.nl 摘要 由于其寿命长和极高的信息密度，DNA 已成为一种有吸引力的档案数据存储介质。可扩展的并行随机信息访问是任何存储系统的理想特性。然而，对于基于 DNA 的存储系统，这一点还有待稳健地建立。在这里，我们开发了热约束 PCR，这是一种新方法，可以实现对分区 DNA 文件进行多路复用、重复的随机访问。我们的策略是基于将生物素功能化的寡核苷酸稳定地定位在具有温度依赖性膜通透性的微胶囊内。在低温下，微胶囊对酶、引物和扩增产物具有渗透性，而在高温下，膜塌陷可防止扩增过程中的分子串扰。我们证明，在重复随机访问和降低多重 PCR 期间的扩增偏差方面，我们的平台优于非区室化 DNA 存储。使用荧光分选，我们还通过对微胶囊进行条形码编码来展示样本汇集和数据检索。我们的热响应微胶囊技术为重复随机访问档案 DNA 文件提供了一种可扩展的、与序列无关的方法。主要虽然世界正在生成越来越多的数据，但我们存储这些信息的能力却落后了 1 。传统的长期存储介质（如硬盘或磁带）在耐用性和存储密度方面受到限制，这导致人们对小有机分子 2,3 、聚合物 4,5 以及最近的 DNA 6–8 作为分子数据载体的兴趣日益浓厚。由于其固有的信息存储能力、寿命和高信息密度，DNA 尤其成为档案数字数据存储的主要候选者 9 。用于存储信息的编码方案 7,10,11 取得了重大进展