摘要:通常,SCRNA-SEQ数据包含许多0值,每个基因的表达显示为零插入分布。因此,小提琴图通常用于显示SCRNA-Seq数据的分布,因为它们可以表示多模式分布的形状。但是,当0个值的比例非常大时,在小提琴图中,0峰变得太大,而非零值的分布形状很难看见。为了解决此问题,在这项研究中,提议了单簧管图作为小提琴图的替代方案,以显示SCRNA-SEQ数据的零空调。在单簧管图中,每个分布都以单簧管状的形状表示。长轴对应于分位数,宽度表示每个数据值的大小。末端的直线至0值。通过使用单簧管图,可以同时且有效地显示0个值的比例和非零值的分布。显示了用于人工数据的示例和实际数据。
结果:对95种病毒物种(包括72种RNA病毒物种和23种DNA病毒物种)共收集了2,847种病毒疫苗,手动注释并存储在小提琴疫苗数据库中。这些病毒疫苗使用了542疫苗抗原。分类学分析发现病毒疫苗涵盖的各种DNA和RNA病毒。这些疫苗针对不同的人,动物疫苗和HPV疫苗,以不同的病毒生命周期阶段(例如,病毒进入,组装,出口和免疫逃避)为目标。疫苗抗原蛋白也显示在病毒(例如HRSV疫苗)的不同病毒素位置。结构性和非结构性病毒蛋白已用于病毒疫苗的发育。根据Vaxign-ML计算,保护性疫苗抗原的蛋白质得分> 85%,该计算衡量了预测疫苗使用的适用性。虽然预测的粘合剂仍然具有保护性抗原的明显更高的机会,但只有21.42%的保护性病毒疫苗抗原被预测为粘附素。此外,我们的基因本体论(GO)富集分析使用定制的Fisher的精确测试确定了许多富集的模式,例如病毒进入宿主细胞,DNA/RNA/ATP/ION结合,并抑制宿主1类Interferon介导的信号介导的信号传导途径。病毒疫苗及其相关的实体和关系在疫苗本体论(VO)中是本体论建模和代表的。开发了小提琴Web界面,以支持病毒疫苗的用户友好查询。
Tai,T。C.(2010)。 小提琴,键盘和唱歌指令对空间能力的影响和Tai,T。C.(2010)。小提琴,键盘和唱歌指令对空间能力的影响和
使用戏剧软件,我们能够估计2020年,2025年,2029年和2036年的216个非构造航天器的碰撞概率和超过16,000个星座卫星。5下面的小提琴图显示了每年的碰撞概率的分布。小提琴图只是镜像统计分布。它表明,在2020年,碰撞概率集中在分布的上端(概率大于1000中的1000分之一),较长的概率很长。此分布会随着时间的流逝而变化,显示出较高概率向分布的上端积累。这还表明,随着时间的推移,最大概率随着时间的推移而增加(由于2025年太阳能活动的峰值,从2020年到2025年减少了)。
使用戏剧软件,我们能够估计2020年,2025年,2029年和2036年的216个非构造航天器的碰撞概率和超过16,000个星座卫星。5下面的小提琴图显示了每年的碰撞概率的分布。小提琴图只是镜像统计分布。它表明,在2020年,碰撞概率集中在分布的上端(概率大于1000中的1000分之一),较长的概率很长。此分布会随着时间的流逝而变化,显示出较高概率向分布的上端积累。这还表明,随着时间的推移,最大概率随着时间的推移而增加(由于2025年太阳能活动的峰值,从2020年到2025年减少了)。
图S6。 (a)纳米颗粒尺寸浓度和(b)小提琴图,在1 d,15 d,15 d和30 d的PET颗粒和30 d的PET颗粒和5 mm AC中插入粒度分布的盒子图。 在A中,实线表示粒子浓度的平均值,阴影代表95%的机密间隔。 在B中,框图的顶部和底部边缘分别表示第一个四分位数和第三四分位数,内部线代表中位数,晶须表示数据中的上极端和下极端。 小提琴图的宽度说明了不同粒径的浓度。 在(b)中,由于不同条件下的样本量和方差不相等,对韦尔奇的t检验进行了成对比较(* p <0.05,** p <0.01,*** p <0.001)。 在每个孵育时间从一个生物复制中收集数据。图S6。(a)纳米颗粒尺寸浓度和(b)小提琴图,在1 d,15 d,15 d和30 d的PET颗粒和30 d的PET颗粒和5 mm AC中插入粒度分布的盒子图。在A中,实线表示粒子浓度的平均值,阴影代表95%的机密间隔。在B中,框图的顶部和底部边缘分别表示第一个四分位数和第三四分位数,内部线代表中位数,晶须表示数据中的上极端和下极端。小提琴图的宽度说明了不同粒径的浓度。在(b)中,由于不同条件下的样本量和方差不相等,对韦尔奇的t检验进行了成对比较(* p <0.05,** p <0.01,*** p <0.001)。在每个孵育时间从一个生物复制中收集数据。
图1。Taxane mechanism of action ............................................................................ 2 Figure 2.Kaplan-Meier curve of the frequency of Grades 2-4 peripheral neuropathy separated by race ............................................................................................................. 5 Figure 3.曼哈顿的图3-4年级的tipn来自ECOG-5103中的AA患者................................................................................................................. 8图4。SBF2 expression across various tissues ........................................................... 10 Figure 5.Schematic of Schwann cells ........................................................................... 11 Figure 6.Simplified schematic representation of SBF2 protein and annotated functional domains ........................................................................................................ 13 Figure 7.Workflow of iPSC-dSN generation ................................................................ 20 Figure 8.Analysis pipeline of single-cell sequencing .................................................... 27 Figure 9.紫杉醇对IPSC-DSN生存能力和形态的影响........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 34图10。Relative expression of SBF2 and cell viability .............................................. 38 Figure 11.Neurite outgrowth in iPSC-dSN ................................................................... 40 Figure 12.IPSC-DSN的电生理特性。 .............................................. 46 Figure 13. GMC203细胞系中线粒体含量的小提琴图.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................IPSC-DSN的电生理特性。.............................................. 46 Figure 13.GMC203细胞系中线粒体含量的小提琴图.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................Barcode rank plot ......................................................................................... 52 Figure 14.RSAA12细胞系中线粒体含量的小提琴图.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................Violin plot of mitochondrial content in STAN601 cell line ........................... 57 Figure 17.线粒体含量的小提琴图06401单元线................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 58图18。每个测序样品的双重分布...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................IPSC-DSN的多维缩放(MDS)图............................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 60图20。Single-cell RNA-sequencing of iPSC-dSN ................................................... 62 Figure 21.Distribution of differentially expressed mature sensory marker genes among cell type-specific clusters ................................................................................... 63 Figure 22.火山图强调了紫杉醇和IPSC-DSN的媒介物处理之间的显着基因表达变化。.............................................................. 66 Figure 23.Multidimensional scaling (MDS) plot of NTC and si SBF2 cells ................... 71 Figure 24.si SBF2 IPSC-DSN中的差异基因表达.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................
fi g u r e 4皮肤DEG具有比皮肤DSG更大的基因共表达连通性,但DSGS的表达更高。(a)小提琴图显示了转录组,DSG和DEG中所有基因的总连通性(ktotal)值的分布。(b)小提琴图显示了转录组,DSG和DEG中所有基因的基因表达值的分布。表达值以每百万(TPM)的转录本为标准化。为了视觉清晰度,在“所有基因”类别中的表达值超过200 tpm的635个异常值不包括在图中。两者均为DSG和DEG的六个基因均不包括在任何分析中。在这两个图中,中间的白色钻石代表分布的中值,每个成对比较的置换测试的结果均显示为星号(*p <.05; *** p <.001; **** p <.0001)或ns(不重要)。
德国芒斯特大学的一项研究监测了两组20至30岁之间的大脑活动。 一组由20位播放音乐至少15年的音乐家组成。 另一组由13位非音乐家组成。 研究人员观看了他们的大脑反应,每个参与者都听了钢琴音乐的录音。 在听录音时,音乐家在处理听觉信号的大脑区域中表现出25%的活动。 尽管音乐来自钢琴,但无论弹奏钢琴,小提琴还是其他乐器,所有音乐家的响应水平都更高。德国芒斯特大学的一项研究监测了两组20至30岁之间的大脑活动。一组由20位播放音乐至少15年的音乐家组成。另一组由13位非音乐家组成。研究人员观看了他们的大脑反应,每个参与者都听了钢琴音乐的录音。在听录音时,音乐家在处理听觉信号的大脑区域中表现出25%的活动。尽管音乐来自钢琴,但无论弹奏钢琴,小提琴还是其他乐器,所有音乐家的响应水平都更高。
图 1 (a) 接种疫苗的准备程度(上图)和 (b) 愿意等待另一种疫苗(下图)的疫苗来源以及是否提供有效性信息(每对左侧)或隐瞒有效性信息(右侧)。箱线图表示数据的中位数、四分位距、限值和异常值。小提琴图说明了数据的分布,给定值的宽度大致表示该值的数据频率。