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小提琴疫苗知识库中病毒疫苗的系统收集，注释和模式分析
结果：对95种病毒物种（包括72种RNA病毒物种和23种DNA病毒物种）共收集了2,847种病毒疫苗，手动注释并存储在小提琴疫苗数据库中。这些病毒疫苗使用了542疫苗抗原。分类学分析发现病毒疫苗涵盖的各种DNA和RNA病毒。这些疫苗针对不同的人，动物疫苗和HPV疫苗，以不同的病毒生命周期阶段（例如，病毒进入，组装，出口和免疫逃避）为目标。疫苗抗原蛋白也显示在病毒（例如HRSV疫苗）的不同病毒素位置。结构性和非结构性病毒蛋白已用于病毒疫苗的发育。根据Vaxign-ML计算，保护性疫苗抗原的蛋白质得分> 85％，该计算衡量了预测疫苗使用的适用性。虽然预测的粘合剂仍然具有保护性抗原的明显更高的机会，但只有21.42％的保护性病毒疫苗抗原被预测为粘附素。此外，我们的基因本体论（GO）富集分析使用定制的Fisher的精确测试确定了许多富集的模式，例如病毒进入宿主细胞，DNA/RNA/ATP/ION结合，并抑制宿主1类Interferon介导的信号介导的信号传导途径。病毒疫苗及其相关的实体和关系在疫苗本体论（VO）中是本体论建模和代表的。开发了小提琴Web界面，以支持病毒疫苗的用户友好查询。
替代小提琴图以显示零充气...
摘要：通常，SCRNA-SEQ数据包含许多0值，每个基因的表达显示为零插入分布。因此，小提琴图通常用于显示SCRNA-Seq数据的分布，因为它们可以表示多模式分布的形状。但是，当0个值的比例非常大时，在小提琴图中，0峰变得太大，而非零值的分布形状很难看见。为了解决此问题，在这项研究中，提议了单簧管图作为小提琴图的替代方案，以显示SCRNA-SEQ数据的零空调。在单簧管图中，每个分布都以单簧管状的形状表示。长轴对应于分位数，宽度表示每个数据值的大小。末端的直线至0值。通过使用单簧管图，可以同时且有效地显示0个值的比例和非零值的分布。显示了用于人工数据的示例和实际数据。