靶向二代测序在传染病应用与实践专家共识 中国医疗保健国际交流促进会临床微生物学分会 通讯作者:王晖,北京大学人民医院检验科,北京 100044,Email:whuibj@163. com;曹斌,中日友好医院呼吸与危重症医学科,北京 100029,Email:caobin_ben@163.com 【摘要】靶向二代测序(tNGS)技术通过设计特异的引物或捕获探针来检测临床样本中的病原微生物及耐药基因,为传染病的诊断、治疗和监测提供依据。但目前tNGS和宏基因组二代测序(mNGS)的临床应用场景尚不明确,不同厂家的tNGS系统质量和结果差异很大。该技术的临床适应症、实验室流程、质量控制、性能验证和报告解释等都亟待制定共识和标准。为规范tNGS在传染病领域的应用与实践,中国医疗保健国际交流促进会临床微生物学分会的微生物学、传染病、呼吸道疾病、流行病学等领域的专家针对上述问题进行了探讨,撰写了tNGS在传染病领域应用与实践专家共识。
虽然临床症状和接触史可以缩小感染性腹泻的可能病因范围,但以前可能需要进行多次粪便检查和医疗访问才能确定病因。感染性腹泻检测组 (IDP) 是一种新的粪便检测,结合了粪便培养、虫卵与寄生虫 (O&P) 以及艰难梭菌。IDP 可在单个样本中检测一组标准化的 14 种病毒、细菌和原生动物病原体(表 1:每个实验室的感染性腹泻检测组 [IDP] 中包含的病原体)。IDP 不仅比以前的方法检测出更广泛的病原体,而且更快、更灵敏。它在功能上取代了粪便培养和 O&P;但是,独立的艰难梭菌测试仍然可用。考虑到 IDP 是一种昂贵的测试,本指南旨在描述 IDP 的最合适用途。由于对 CDI 的理解有所进步,该指南还描述了艰难梭菌测试的使用和解释。
**问题1 **正确的答案是:下面哪些建议定义了共生主义?正确的答案是a)微生物以生物存在的有机材料为食,而不会引起宿主的疾病或杀伤。**问题2 **正确的答案是:成人对以下血统的正确解释是什么?正确的答案是f)nf正常(正常血液配方)。**问题3 **沉积速度(VS)为:*具有很高灵敏度和特异性(> 90%)(a)*的炎症标记,它取决于炎症程度(c)**问题4 ** A ** A 38 -year -old Man -od -oear -old -ol -old Man在第一个小时的35毫米。正确的答案是:患者患有感染或炎症(b)。** Question 5 ** thrombocytopenia often accompanies the following infections:*Maladisme (a)*leptospirosis (B) ** Question 6 ** Renal insufficiency is often part of the table of the following infections:*leptospirosis (a)*Simple malaria to p falciparum (b)*Pyelonephritis (e) ** question 7 **可以进行感染:*提早直接借记,15天后进行较晚的直接借记,以检查是否有血清转换(B)** immunity **获得的免疫力(与自然免疫不同):不属性的体液因素是特有的,并且是每个病原体的特异性因素,并介入细胞内组织。2。体液免疫在抗击诸如诸如hiv * hiv * leprosy *疟疾 *疟疾 *的肝炎感染之类的疾病中起着领先作用。4。2。CD4淋巴细胞计数反映了细胞免疫的水平。正常范围为2000-5000/mm³,低于200,其明显的免疫抑制。1岁以下儿童的CD4计数高于成人。**免疫抑制** 5。与免疫抑制相关的情况包括: *怀孕 *老年 * 1-5岁的儿童 *糖尿病 *营养不良**自身免疫性疾病** 6。由自身抗体引起的自身免疫性疾病包括: * G6PD缺乏症 *哮喘 *麻风病 * purprosy * purpura血小板减少特发性 *糖尿病类型1 *类风湿关节炎Serotherapy: * Can be used in all infectious diseases if done early enough * Most useful in severe toxin infections * Can be used in poisoning or envenoming cases * Contraindicated in newborns and pregnant women * Should not be associated with vaccination **Immune Cells** 8.参与获得免疫的特异性免疫细胞包括: *淋巴细胞B和T *巨噬细胞 *肝细胞 *脂肪细胞**细胞毒性** 9。细胞毒性: *参与细胞免疫的防御机制 *破坏了携带抗原的细胞 *不是抗原**抗生素的特定机制** 1。抗生素(AB)是由微生物产生的生物分子,它对细菌具有特异性破坏作用(但不是病毒,真菌或寄生虫)。它对人类相对无毒,并通过细胞因子起作用。当细菌适应抗生素的存在时,可能会发生抗生素耐药性。如果使用不正确或过度使用抗生素,这种情况可能会发生。**抗生素:作用机理** 1。2。抗生素通过减少或消除细菌繁殖而无需杀死细菌本身而起作用。所有抗生素对细菌的作用机理类似。**抗生素抗性** 3。当细菌适应抗生素的存在时,可能会发生抗生素耐药性。**抗生素吸收和分布** 4。体内抗生素的吸收和分布可能会根据受影响的个体,组织类型和器官(例如,眼睛,前列腺)而变化。**抗生素:安全与禁忌症** 5。在怀孕或童年时期禁忌一些抗生素,而另一些抗生素可能是安全的。**普通抗生素错误** 6。使用抗生素使用的常见错误包括: *仅根据症状(例如发烧)的处方 *偏爱窄谱抗生素 *偏爱廉价抗生素 *经常在外科手术后预防抗生素。注意:原始文本包括编号的问题和答案,这些释义版本未包含。ab esttrèsrépandudans les les付费,校长en raison des特征Écourtés等人,ainsi que del'Accèsibèslibre-tous les les les les les les les les lesmédicements。la Synergie抗生素n'est pas toujoursprésente,mais elle peut exister avec exister avec lysemenes combinaisons d'antbibiotiques。l'Associal d'Ab est souventdéterminéepar le type de germevisé和la nature de l'nature de l'nature de l'nature de l'nature de l'nature de l'nature de l'nature de l'absévéritédusévéritéduthe the。
公众评论本指南正在发布,以解决2019年冠状病毒疾病(COVID-19)公共卫生紧急情况。本指南未经事先公开评论就可以实施,因为食品药品监督管理局(FDA或代理机构)已确定,该指南的事先公开参与不可行或不合适(请参阅《联邦食品,药物和美容行为》第701(h)(1)(1)(c)条(美国美国法典21371(h)(1)(c))和21 CFR 10.115(g)(2))。该指南文件正在立即实施,但仍需要根据该机构的良好指导实践发表评论。评论可以随时提交代理考虑。向码头管理人员(HFA-305)提交书面评论,食品和药物管理局,5630 Fishers Lane,RM。1061,Rockville,MD 20852。将电子评论提交https://www.regulations.gov。应通过案卷号FDA-2020-D-1136标识所有评论,并在请求中完成指南的完整标题。Additional Copies Additional copies are available from the FDA web page titled “COVID-19-Related Guidance Documents for Industry, FDA Staff, and Other Stakeholders,” available at https://www.fda.gov/emergency-preparedness-and-response/mcm-issues/covid-19-related-指导documents-industry-fda-staff-and-Other-takecters和FDA网页标题为“搜索FDA指导文档”,请访问https://www.fda.gov/Regulatory-gonegration-grountor-regulatory-groume/search-fda-guidance-documents-documents。您还可以将电子邮件请求发送至druginfo@fda.hhs.gov或ocod@fda.hhs.gov,以接收指南的额外副本。请在请求中包含文档编号FDA-2020-D-1136和指南的完整标题。有关此文件的问题的问题,请联系covid19-productdevelopment@fda.hhs.gov。
欢迎来到亚利桑那大学的传染病分裂!我们的教师在传染病以及艾滋病毒,球虫病,锥虫病,移植感染,抗菌管理,预防感染,公共卫生,公共卫生和结核病方面具有广泛的专业知识。我们的一些教师进行临床研究和其他基础科学研究。我们位于班纳 - 图森大学医学中心(BUMCT)主校区,南校园(BUMCS)和亚利桑那州南部VA医疗保健系统(Savahcs)。我们的教师致力于为您提供最好的教育。我们计划提供的临床经验非常出色。我们的部门在为艾滋病毒感染的人提供医疗服务方面具有卓越的卓越历史。重要的是,您在这一领域变得熟练,因为艾滋病毒血清阳性人群不仅在亚利桑那州而且在世界各地都在增长。当务之急,亚利桑那州的所有传染病医师都擅长于诊断和治疗球虫病,这是该州特有的疾病。我们的计划将在该领域的领导者的教职员工中提供特定的培训。您也将在住院和门诊设置中暴露于广泛的传染病。您将接受微生物学实验室的培训以及性传播疾病和结核病的诊断和治疗。在您的研究金结束时,您应该是一位高技能的传染病医师。在传染病领域中,有不同的职业道路,包括私人执业,公共卫生,普通感染疾病,移植传染病,艾滋病毒护理,抗菌治疗,预防感染和临床研究以及基础研究。在您的团契期间,我们将为您提供选修活动,以帮助您识别和发展职业道路。所有研究员都有望从事学术活动。我们的教师将根据您的兴趣,与您合作开发和实施基于临床或实验室的研究项目。研究员的培训计划将被个性化,以确保您获得所需的技能。我们的目标是支持您实现您寻求的职业。我们很荣幸与您一起培训下一代传染病专家。我们对我们的工作和我们的教育使命充满热情,并希望我们会激发您对您的同样的激情。
(7),它可能会改变感染动力学或免疫反应,当它传播回人类人群(8)。此外,对加拿大和美国感染人类感染鹿病毒的检测(3)引起了人们对持续的Human-Deer-Deer-Human-Human-Human Sars-Cov-2传播周期的关注。圈养的动物群人口密度增加和频繁的人干预可能支持人畜共患病原体的传播(10,11)。圈养的鹿也被发现自然暴露于SARS-COV-2,这是通过高探测病毒RNA的速度(12)和鹿中中性抗体的高滴度证明的(13)。在人类护理下管理高度易感动物物种为人类对手传播和随后在群群中的快速传播创造了机会(14)。2012年收集的数据估计,在美国存在≈5,500个白尾鹿育种设施(15)。在德克萨斯州,> 1,000个现有的便利设施平均每只180-242鹿(16,17)。在人类管理下拥有如此大量的鹿可能会有利于人与人对鹿和鹿的传播事件,从而导致随后从养殖动物中传播鹿适应的病毒回到人类中,这已记录在欧洲的耕种貂皮(Neovison Vison)(18,19),并在美国的可能性(20)(20)。尽管鹿在2021年11月在美国出现的OMICRON变体以来一直对SARS-COV-2进行测试,但鹿最近的谱系的检测率仍然很低(3,21)。用于检查,截至2024年8月14日,GISAID(https://www.gisaid.org)在Gisaid(https://www.gisaid.org)中只有2.5%(在648个基因组中)属于Omicron变体(GRA Clade)(GRA Clade)(22)。这些发现表明鹿对新的新兴谱系有可能,但感染显着降低的原因尚不清楚。减少鹿
摘要。这项研究评估了疫苗接种计划在降低低收入国家传染病发病率方面的有效性。通过分析免疫覆盖率数据和疾病患病率,该研究强调了疫苗接种计划所面临的成功和挑战。调查结果表明,全面的疫苗接种运动大大降低了发病率和死亡率,强调需要持续投资和社区参与以改善公共卫生结果。关键词:疫苗接种计划,传染病,低收入国家,免疫覆盖率,发病率,公共卫生