元基因组组件和后处理完整数据集。使用hifiasm-meta和metamdbg组装了三个土壤中每一个的组合数据集。使用PACBIO HIFI-MAG-PIPELINE(V2+)3处理每个结果的重叠群集,该组件执行了长阅读特定的binning,QC和分类学注释步骤。我们评估了针对不同质量类别生产的MAG数量,包括单纤维高质量(SC- HQ)MAG,高质量(HQ)MAGS和中等质量(MQ)MAGS。我们显示了每个样品中最佳组装方法的结果。
摘要:耕种的花生(Arachis hypogaea L.)是全球重要的油和现金作物。一百个烟和种子的重量是花生产量的重要组成部分。在当前的研究中,为了揭开一百个pod重量(HPW)和百分子重量(HSW)的遗传基础,从JH5(JH5,大豆荚和种子重量和种子重量)之间的十字架开发了一个重组近交系(RIL)人群,并使用M130(小荚和种子重量)(小荚和种子重量),并用来识别QTLS和HPW和HPW。使用SSR,AHTE,SRAP,TRAP和SNP标记构建了一个集成的遗传链接图。该地图由3130个遗传标记组成,分配给20个染色体,并覆盖1998.95 cm,平均距离为0.64 cm。在此基础上,HPW和HSW的31个QTL位于7个染色体上,每个QTL占表型方差的3.7–10.8%(PVE)。其中,在多个环境下检测到了七个QTL,并且在B04和B08上发现了两个主要的QTL。值得注意的是,染色体A08上的QTL热点在2.74 cm的遗传间隔内包含7个QTL,其中包括0.36 MB物理图,包括18个候选基因。Arahy.d52S1Z,Arahy.ibm9rl,Arahy.W18Y25,Arahy.cplc2w和Arahy.14H.14H可能在调节花生荚和种子重量中发挥作用。这些发现可以促进进一步研究培养花生中影响豆荚和种子重量的遗传机制。