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如何使用本花园规划指南
1) 蔓生豆（16 株） 2) 甜菜（12 株） 3) 青椒（3 株） 4) 胡萝卜（16 株） 5) 瑞士甜菜或羽衣甘蓝（6 株） 6) 大葱（24 株） 7) 墨西哥辣椒（3 株） 8) 土豆（3 株） 9) 生菜或菠菜（6-12 株） 10) 黄瓜（棚架上，2 株）* 11) 番茄，有限生长型（3 株） 12) 番茄，无限生长型（2 株） 13) 西葫芦（2 株）
细胞群体动态随机模型量化结肠隐窝内的稳态及其在早期肿瘤发生中的破坏
摘要：健康结肠隐窝如何维持其大小，以及驱动突变如何破坏细胞稳态，这些问题对于理解结直肠肿瘤发生至关重要。我们提出了一个包含三种类型的随机分支过程，分别考虑干细胞、过渡扩增 (TA) 细胞和完全分化 (FD) 细胞，以模拟结肠隐窝中细胞群的动态变化。我们的模型公式简单，使我们能够估算文献中除一个模型参数之外的所有参数。通过拟合剩余的一个参数，我们发现模型结果与健康人类结肠隐窝的数据吻合良好，捕捉到了实验观察到的群体大小的显著差异。重要的是，我们的模型可以预测健康结肠隐窝中相关参数值的稳态细胞群。我们表明，APC 和 KRAS 突变（导致结直肠癌的最显著的早期改变）会导致突变隐窝中稳态细胞群增加，这与实验结果一致。最后，我们的模型预测了隐窝内细胞无限生长的简单情况，这与结直肠恶性肿瘤相对应。预计这种情况发生在TA细胞的分裂率超过其分化率时，这对癌症的治疗预防策略具有重要意义。
肿瘤
o良性（仅在一个地方生长；不会散布或侵入其他身体部位，而是通过按下重要器官来引起问题；通常不会复发）；或o恶性肿瘤（生长，扩散并侵入其他身体部位并可以复发）癌症：一种潜在无限生长的恶性肿瘤，通过侵袭并通过转移而系统地扩展。转移：癌症从身体的一部分传播到另一部分。在病理分析下，转移性（或继发性）癌的细胞与原始（或原发性）癌的细胞相同。因此，病理学家可以确定特定部位中的癌症是主要还是次要的。例如，来自原发性肺癌的肺肿瘤的细胞看起来像肺癌细胞，而来自乳腺癌的肺肿瘤的细胞看起来像乳腺癌细胞。原因（Mayo Clinic，2022b）癌症是由细胞内DNA变化（突变）引起的。风险因素（梅奥诊所，2022b）许多癌症的特殊原因是未知的。风险因素包括：年龄65岁或以上（但可以在任何年龄段诊断）生活方式和习惯（吸烟，日晒，饮酒，肥胖，不安全的性，身体不活动等）家族史一些慢性健康状况环境暴露于化学物质，毒素，辐射等。体征和症状（Mayo Clinic，2022b）的体征和症状取决于类型，位置和阶段。（阶段是指癌症已经成长和扩散。）诊断工具（Mayo Clinic，2022a）活检和病理分析实验室测试诊断成像 - X射线，超声，CT，MRI和PET扫描等。治疗（Mayo Clinic，2022a）的治疗方法根据：癌症类型位置和阶段可能包括手术，化学疗法，免疫疗法，激素治疗，靶向药物治疗，放射治疗，干细胞移植或某些组合。
气候智能型番茄的基因组设计
摘要 番茄是世界上第一种被食用的蔬菜。它生长在非常不同的条件和地区，主要用于加工番茄的田间，而新鲜市场番茄通常在温室中生产。番茄面临着许多环境压力，包括生物压力和非生物压力。如今，许多新的基因组资源可用，从而加速了遗传进程。在本章中，我们将首先介绍培育气候智能型番茄的主要挑战。我们将介绍与生产力、果实质量和对环境压力的适应有关的育种目标，特别关注气候变化如何影响这些目标。在第二部分中，将介绍可用的遗传和基因组资源。然后将讨论传统和分子标记育种技术。然后将特别关注生态生理建模，这可能构成定义适应育种目标的新理想型的重要策略。最后，我们将说明如何实施新的生物技术工具以及如何使用它们来培育气候智能型番茄。 关键词：番茄，育种，生产力，生物胁迫，非生物胁迫，理想型，建模 1 简介 番茄是继马铃薯之后世界上第一种被食用的蔬菜。它已成为许多国家的重要食品。番茄主要有两种品种：用于加工业的有限生长番茄，仅在露地生产；用于新鲜市场的无限生长品种，可在从露地到受控条件的温室等各种条件下种植。番茄，Solanum lycopersicum L.，与马铃薯、茄子和辣椒同属茄科。它是一种自花授粉作物，具有中等大小（950 Mb）的二倍体（2n=2x=24）基因组。2012 年发表了一个高质量的参考基因组序列（番茄基因组联盟，2012 年）。番茄原产于南美洲，还有 12 种野生近缘种，可与栽培番茄品种杂交。存在几个大型遗传资源集合，这些基因库中保存了 70,000 多个品种。这些集合还包括科学资源，例如突变体集合或分离种群。长期以来，番茄也是遗传分析的典型物种。许多诱导重要表型变异的突变被发现并被克隆，许多抗病基因的功能也得到了表征。番茄也是果实发育和生理学的典型物种。它易于转化，是第一种生产和销售的转基因食品（Kramer 和 Redenbaugh，1994 年）。在本章中，我们将首先介绍培育气候智能番茄的主要挑战。与生产力相关的育种目标，我们将介绍水果品质和对环境压力的适应性，特别关注气候变化如何影响这些目标。第二部分将介绍可用的遗传和基因组资源。然后讨论传统和分子标记育种技术。然后，我们将特别关注生态生理建模，这可能是定义适应育种目标的新理想型的重要策略。最后，我们将说明如何实施新的生物技术工具以及如何将其用于培育气候智能型番茄。