冠状病毒含有RNA病毒中最大的基因组之一,编码与蛋白水解加工,基因组复制和转录有关的14-16个非结构性蛋白质(NSP),以及四种构建成熟Virion的核心的结构蛋白。由于跨冠状病毒的保护,NSP形成了一组有前途的药物靶标,因为它们的抑制作用直接影响病毒复制,因此会影响感染的进展。显示出一种由一种RNA依赖性RNA聚合酶(NSP12),一个NSP7,两个NSP8辅助亚基和两个解旋酶(NSP13)酶形成的最小但功能齐全的复制和转录复合物。我们的方法涉及NSP12和NSP13,以使多个起点干扰病毒感染的进展。在这里,我们报告了一种合并的体外重新利用筛选方法,确定了新的和确认报告的SARS-COV-2 NSP12和NSP13抑制剂。
摘要:宿主免疫系统的稳态受到白细胞的调节,具有各种细胞表面受体用于细胞因子。趋化性细胞因子(趋化因子)激活其受体,以唤起稳态迁移或朝向炎症组织或病原体的炎症条件下免疫细胞的趋化性。免疫系统的失调导致疾病,例如过敏,自身免疫性疾病或癌症,需要有效,快速作用的药物,以最大程度地减少慢性炎症的长期影响。 在这里,我们进行了基于结构的虚拟筛选(SBV),并由Keras/Tensorflow神经网络(NN)辅助使用,以发现作用于三种趋化因子受体的新型化合物支架:CCR2,CCR3和一个CXC受体CXCR3。 keras/tensorflow nn在此使用不作为典型使用的二进制分类器,而是作为有效的多级分类器,不仅可以丢弃非活性化合物,还可以丢弃低或中等活性化合物。 在100 ns全原子分子动力学中测试了SBV和NN提出的几种化合物,以确认其结合效率。 为了改善化合物的基本结合功能,提出了新的化学修饰。 将修饰的化合物与这三种趋化因子受体的已知拮抗剂进行了比较。 已知的CXCR3化合物是最受预测的化合物之一。因此,除了基于结构的方法外,还显示了在药物发现中使用KERAS/Tensorflow的好处。 此外,我们表明KERAS/Tensorflow NN可以准确预测化合物的受体亚型选择性,SBV通常会失败。导致疾病,例如过敏,自身免疫性疾病或癌症,需要有效,快速作用的药物,以最大程度地减少慢性炎症的长期影响。在这里,我们进行了基于结构的虚拟筛选(SBV),并由Keras/Tensorflow神经网络(NN)辅助使用,以发现作用于三种趋化因子受体的新型化合物支架:CCR2,CCR3和一个CXC受体CXCR3。keras/tensorflow nn在此使用不作为典型使用的二进制分类器,而是作为有效的多级分类器,不仅可以丢弃非活性化合物,还可以丢弃低或中等活性化合物。在100 ns全原子分子动力学中测试了SBV和NN提出的几种化合物,以确认其结合效率。为了改善化合物的基本结合功能,提出了新的化学修饰。将修饰的化合物与这三种趋化因子受体的已知拮抗剂进行了比较。已知的CXCR3化合物是最受预测的化合物之一。因此,除了基于结构的方法外,还显示了在药物发现中使用KERAS/Tensorflow的好处。此外,我们表明KERAS/Tensorflow NN可以准确预测化合物的受体亚型选择性,SBV通常会失败。我们从Chembl和策划数据集检索到大麻素受体的跨测试趋化因子受体数据集。在从Chembl检索的大麻素受体数据集上训练的NN模型是受体亚型选择性预测中最准确的。在趋化因子受体数据集训练的NN模型中,CXCR3模型在区分给定化合物数据集的受体亚型方面表现出最高的精度。
非周期性就是您所需要的:用于高性能复合材料的非周期单瓦片 Jiyoung Jung 1,2、Ailin Chen 1,2 和 Grace X. Gu 1,* 1 加利福尼亚大学机械工程系,美国 CA 伯克利 94720 2 这些作者对这项工作做出了同等贡献 * 通讯作者:ggu@berkeley.edu 摘要 本研究通过采用非周期单瓦片(覆盖非平移对称表面的形状)引入了一种新颖的复合材料设计方法。采用计算和实验相结合的方法,我们研究了用这些单瓦片制作的复合材料的断裂行为,并将它们的性能与传统的蜂窝状图案进行了比较。值得注意的是,与蜂窝设计相比,我们基于非周期单瓦片的复合材料表现出了优异的刚度、强度和韧性。这项研究表明,利用非周期结构固有的无序性可以迎来新一代坚固而有弹性的材料。 1. 简介 复合材料因其可定制的机械性能而备受赞誉,是航空航天和生物医学领域不可或缺的轻质结构部件。1-5 这些材料的强度在于它们的复合性质——结合不同基础材料的特性可以创建具有多种所需特性和谐平衡的复合材料。这一概念在生物材料 6-11 中得到了很好的体现,例如珍珠层和木材,尽管它们由相对较弱的成分组成,但其机械性能通常优于工程材料。传统工程复合材料通常以重复的单元为特征,这一特征简化了设计和制造过程。然而,这种有序结构在临界载荷下会导致灾难性的故障。同时,生物材料通常呈现无序结构,其中单元在空间上有所不同。12 这种无序在改善生物材料机械性能方面发挥的作用程度仍然是正在进行的研究课题。具有不规则或无序微观结构的材料的固有优势最近引起了科学界的兴趣。 13-15 这些结构具有异质微结构的特征,可以为应力波传播提供强化路径,从而提高重载下的弹性。16-19 新兴研究表明,通过放大这种不规则性,可以提高特定细胞框架的缺陷容忍度。20 此外,多晶结构的微观复杂性,包括晶界、沉淀物和相,被视为具有增强韧性的工程材料的潜在模板。21,22 目前创建这些异质结构的方法涉及在规则晶格结构内随机移动节点、构建材料泡沫等技术,或堆叠具有不同微观结构的材料 17,23,24 然而,这些方法给设计和制造带来了一层复杂性,尤其是由于不同取向的晶胞组装不完美而带来的挑战。为了应对这些挑战,我们的研究提出了将非周期单瓦片集成到复合材料设计中。正如最近文献中发现的那样,非周期单瓦片已被证明可以完全覆盖具有内在非周期性的表面。25 这使它们成为创建无序材料的理想选择。在复合材料设计中使用非周期单瓦片将有助于实现可调特性,同时保持出色的界面结合。在这项工作中,我们探索了一个全新的架构系列
1 堪萨斯大学癌症中心,美国堪萨斯州韦斯特伍德;2 梅奥诊所癌症中心,美国明尼苏达州罗切斯特;3 希望之城综合癌症中心,美国加利福尼亚州杜阿尔特;4 罗斯威尔帕克综合癌症中心,美国纽约州布法罗;5 玛格丽特公主癌症中心,加拿大安大略省多伦多;6 威尔康奈尔医学中心,美国纽约州纽约;7 加州大学洛杉矶分校大卫格芬医学院,美国加利福尼亚州洛杉矶;8 阿尔伯塔大学医院,加拿大艾伯塔省埃德蒙顿;9 德克萨斯大学 MD 安德森癌症中心,美国德克萨斯州休斯顿;10 Stemline Therapeutics Inc,美国纽约州纽约;11 塔夫茨大学医学院,美国马萨诸塞州波士顿
癌症因其高发病率和高死亡率,是全球主要的公共卫生问题,结直肠癌近年来已成为主要的癌症类型(1,2)。根据2018年全球癌症监测数据,中国新发癌症病例约430万,其中结直肠癌位居第二,占新发癌症病例的12.2%(1)。约25%的结直肠癌患者在诊断时患有转移性疾病(3)。转移性结直肠癌(mCRC)的治疗建议包括单一或联合化疗[5-氟尿嘧啶(5-FU)、卡培他滨、奥沙利铂和伊立替康],联合或不联合靶向治疗(贝伐单抗和西妥昔单抗)(4)。这些方案通常用于一线和二线治疗。对于一线和二线标准疗法失败的患者,三线治疗选择非常有限。
肺癌是一种恶性肿瘤,在中国和全球范围内,发病率和死亡率高。 小细胞肺癌(SCLC)约占所有肺癌的13–17%。 由于烟草的暴露,SCLC具有较高的体细胞突变率,并产生各种新抗原,导致更高的恶性和异质性,并且更容易容易出现局部浸润和远处转移。 在诊断时,60-70%的患者已经处于广泛的阶段(ES),而低剂量CT在早期诊断中没有显示出优势。 尽管SCLC对放疗和化学疗法敏感,但复发很容易发生,并且预后很差。 ES-SCLC患者的中位生存时间仅为7-12个月,总5年生存率仅为2.8-7.2%,与以前的(1-5)相比,这一生存率没有显着改善。 目前,同时放疗和化学疗法通常用于SCLC的临床治疗中。 对于不能忍受同时放疗和化学疗法的患者,可以利用顺序放疗和化学疗法(6)。 铂 - 估计剂通常用作一线化学疗法方案。 在2017年,WCLC统计数据显示,在一线化疗后,有19%的ES-SCLC患者接受了二线治疗,并且该方案经常与依托泊苷,Irinotecan或Topotecan结合使用。 然而,抗铂类型的复发后二线化疗的作用不令人满意(7)。肺癌是一种恶性肿瘤,在中国和全球范围内,发病率和死亡率高。小细胞肺癌(SCLC)约占所有肺癌的13–17%。由于烟草的暴露,SCLC具有较高的体细胞突变率,并产生各种新抗原,导致更高的恶性和异质性,并且更容易容易出现局部浸润和远处转移。在诊断时,60-70%的患者已经处于广泛的阶段(ES),而低剂量CT在早期诊断中没有显示出优势。尽管SCLC对放疗和化学疗法敏感,但复发很容易发生,并且预后很差。ES-SCLC患者的中位生存时间仅为7-12个月,总5年生存率仅为2.8-7.2%,与以前的(1-5)相比,这一生存率没有显着改善。目前,同时放疗和化学疗法通常用于SCLC的临床治疗中。对于不能忍受同时放疗和化学疗法的患者,可以利用顺序放疗和化学疗法(6)。铂 - 估计剂通常用作一线化学疗法方案。在2017年,WCLC统计数据显示,在一线化疗后,有19%的ES-SCLC患者接受了二线治疗,并且该方案经常与依托泊苷,Irinotecan或Topotecan结合使用。然而,抗铂类型的复发后二线化疗的作用不令人满意(7)。