Roboprep®96使DNA和RNA提取变得容易,与手动方法相比,动手时间大大减少。这使您可以优化日常工作,从而为其他有价值的实验室任务提供时间。您可以执行最多96个样本的自动提取。通过使用磁珠技术,结合加热块,样品裂解和洗脱的效率得到了提高。结果是高度纯化的核酸,不含抑制性成分,可以直接在实时PCR分析中使用。
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1 加拿大国家研究委员会航空航天研究中心;加拿大渥太华 2 aiRadar Inc.,www.airadar.com;加拿大温哥华 3 卡尔顿大学系统与计算机工程系;加拿大渥太华 4 加拿大国防研究与发展局,国防部;加拿大渥太华
添加了由分枝杆菌嗜睡引起的原发性神经麻风病(PNL)和麻风病,以及时采取公共卫生措施。更新的实验室标准,为M. leprae和M.昏昏性原乳添加了核酸检测试验。更新了流行病学标准和标准,以将新案例与复发或复发区分开。包含新的可能和可疑案例分类。添加了针对国家汉森病计划的建议,以鼓励医疗保健提供者向其管辖权公共卫生当局报告麻风病案件,并在此报告。
主要结果是与实验室确诊(通过聚合酶链反应或抗原检测试验)的 SARS-CoV-2 感染相关的 Covid-19 相关住院。使用记录芬兰所有住院患者数据的医疗保健登记册,我们将 Covid-19 相关住院定义为任何主要诊断为 Covid-19(国际疾病分类,第 10 修订版:U07.1、U07.2)、急性呼吸道感染(J00–J22、J46)或下呼吸道感染严重并发症(J80–84、J85.1、J86)的住院患者。如果阳性标本是在入院前 14 天或入院后 7 天内采集的,则认为住院与国家传染病登记册中记录的感染有关。
由SARS-COV-2拼写的Covid-19的当前全球崩溃不需要详细说明。随着各个国家的不断和不断爬升的死亡人数数量,小时的需求是开发容易部署,快速,负担得起的检测试验和套件,从而产生精确且一致的结果,并及时提供有效的抗sars-COV-COV-2策略来遏制它。常规采用的基于PCR的基于PCR的技术检测病毒患有几个障碍。在其他方法中,基于CRISPR的技术已经迎来了新的希望。最近的努力是为了开发基于CRISPR/CAS的低成本,快速检测方法以及开发一锅测定平台的努力。还评估了CRISPR-CAS系统来抵消病毒攻击的合理应用。本文中的文章反映了CRISPR/CAS技术的当前状态,前景和实际障碍,以检测和灭活新型Corona病毒SARS-COV-2。
中枢神经系统(CNS)感染(例如脑膜炎,脑炎和脑膜脑炎)是童年时期高死亡率和发病率高的主要传染病之一(1)。病毒,细菌和很少的寄生虫和真菌在其病因中起作用。最常见的细菌剂是肺炎链球菌,奈瑟氏菌脑膜炎和嗜血杆菌流感B型,而常见的病毒剂包括肠内病毒,单纯疱疹病毒,水疗Zoster Zoster Zoster病毒和腮腺炎病毒(2,3)。早期诊断和治疗至关重要,这是由于感染的潜力对快速进展,永久神经系统损害以及严重并发症的风险。微观检查脑脊液(CSF),生化方法和特定的微生物诊断测试用于CNS感染的诊断(4)。特定的微生物测试包括CSF培养,血清学研究,包括多重聚合酶链反应(PCR)测试的核酸扩增测试以及抗体和抗原检测试验。最近,CSF中的多重PCR和脑膜炎/脑炎小组(MEP)等核酸扩增测试已在频率上增加,因为它们的优势,例如获得快速效果,筛查细菌,病毒,真菌和单个样品的影响以及受单个样品影响,以及受抗抗抗菌病的影响较小(5,6))。这项研究旨在研究用MEP评估的可疑中枢神经系统感染的小儿患者的临床和流行病学特征。
评估 RNA 提取和 Illumina NGS 文库制备方法以从不同样本基质中检测病毒 RNA Sayma Afroj 1、Aaron Scholl 1、Binsheng Gong 2、Bingjie Li 1、Joshua Xu 2 和 Sandip De 1 * 1 美国食品药品管理局治疗产品办公室细胞治疗和人体组织办公室细胞治疗部 2 司肿瘤疫苗和生物技术处,10903 New Hampshire Avenue,Silver Spring,MD,20993;2 美国食品药品管理局国家毒理学研究中心生物信息学和生物统计学部 3900 NCTR Rd Jefferson,AR 72079。目标:当前的病原体和外来因子检测试验面临局限性,例如对某些病原体的特异性和灵敏度降低,这对 HCT/Ps 的安全使用提出了挑战。该项目旨在评估各种 RNA 提取和 NGS 文库制备方法,以实现对病原体和外来因子的快速、广泛、灵敏和特异性检测。方法:我们使用三种研究设计来评估 RNA 提取方法:将寨卡病毒 (ZIKV) 注入幼稚细胞、使用持续感染 ZIKV 的细胞系以及将持续感染的 ZIKV 细胞注入白膜样本。使用五种方法提取 RNA,并使用 qRT-PCR 对 ZIKV 进行定量分析。为了评估 RNA 文库制备方法,我们将病毒组 HEV RR.1 和 BEI-NR-59622(包含 PCV1、Reo、FeLV、RSV、EBV)注入 U937 细胞,提取总 RNA,并使用各种商业试剂盒和组合构建文库。这些文库在 Illumina NovaSeq 6000 平台上进行测序。正在分析 NGS 数据以确定病毒基因组图谱、基因组覆盖率和映射读取的百分比。结果与结论:总体而言,硅胶柱纯化的 TRIzol 提取被证明是提取病毒 RNA 的最佳方法。正如预期的那样,我们观察到不同的 NGS 文库制备方法之间存在显著差异。rRNA 耗竭有效减少了 NGS 文库中的人类 rRNA。正在进行进一步的数据分析,以研究各种文库制备方法对参考病毒 RNA 产生的 NGS 读数总数的影响。简明语言摘要:有效的病毒核酸提取和文库制备方法对于使用 NGS 技术从细胞和组织中检测不定病毒以及确保细胞和组织治疗的安全性至关重要。我们的研究评估了几种 RNA 提取方法,并观察到测试方法中病毒 RNA 提取效率的差异。总体而言,硅胶柱纯化的 TRIzol 是跨测试样本基质检测病毒最灵敏的方法。正如预期的那样,我们观察到不同的 NGS 文库制备方法之间存在显著差异。正在进行进一步的数据分析,以研究各种文库制备方法对参考病毒 RNA 产生的 NGS 读数总数的影响。