。cc-by 4.0国际许可(未经Peer Review尚未获得认证)是作者/资助者,他已授予Biorxiv的许可证,以永久显示预印本。这是该版本的版权所有,该版本发布于2023年1月24日。 https://doi.org/10.1101/2023.01.23.525218 doi:Biorxiv Preprint
。CC-BY-NC-ND 4.0 国际许可证下提供的(未经同行评审认证)是作者/资助者,他已授予 bioRxiv 永久展示预印本的许可。它是此预印本的版权持有者,此版本于 2025 年 1 月 8 日发布。;https://doi.org/10.1101/2025.01.08.631959 doi:bioRxiv 预印本
摘要背景:具有亚皮质囊肿(MLC)是一种涉及白质的罕见和进行性神经退行性疾病,并未被当前疾病模型充分概括。体细胞重编程,以及基因组工程的进步,可以允许建立用于疾病建模和药物筛查的MLC的体外人类模型。在这项研究中,我们利用细胞重编程和基因编辑技术来开发MLC的诱导多能干细胞(IPSC)模型来概括经典MLC影响的神经系统的细胞环境。方法:外周患者衍生的血液单核细胞(PBMC)的体细胞重编程用于开发MLC的IPSC模型。CRISPR-CAS9基于系统的基因组工程也用于创建该疾病的MLC1敲除模型。以2D细胞培养形式进行了IPSC与神经干细胞(NSC)和星形胶质细胞的分化,然后进行各种细胞和分子生物学方法,以表征疾病模型。结果:由体细胞重编程和基因组工程建立的MLC IPSC的多能性具有很好的特征。IPSC随后与疾病相关的细胞类型分化:神经干细胞(NSC)和星形胶质细胞。 MLC NSC的RNA测序分析揭示了与神经系统疾病和癫痫有关的一组差异表达的基因,这是MLC疾病中常见的临床发现。 该基因集可以作为筛查该疾病潜在治疗性的药物筛查的靶标。IPSC随后与疾病相关的细胞类型分化:神经干细胞(NSC)和星形胶质细胞。MLC NSC的RNA测序分析揭示了与神经系统疾病和癫痫有关的一组差异表达的基因,这是MLC疾病中常见的临床发现。该基因集可以作为筛查该疾病潜在治疗性的药物筛查的靶标。在分化与疾病相关的细胞类型 - 星形胶质细胞后,明确观察到了MLC特征液泡,这在对照组中显然不存在。这种出现概括了该疾病的显着表型标记。结论:通过MLC的IPSC模型的创建和分析,我们的工作解决了对MLC相关细胞模型的迫切需求,用于用于疾病建模和药物筛查测定法。进一步研究可以利用MLC IPSC模型以及生成的转录组数据集和分析,以确定这种衰弱疾病的潜在治疗干预措施。关键字:体细胞重编程,CRISPR-CAS9系统,指示分化引言概括性白细胞脑病带有皮层囊肿(MLC)是一种涉及白质的缓慢进行性退化性脑疾病,它是MLC1或GLC1或GLIAL CAMCAM CAMES跨越的病原变异的结果。这种疾病首先是由荷兰的Marjo van der Knaap博士独立发现的(van der Knaap等,1995),印度阿格拉瓦尔社区中的Bhim Sen Singhal博士(Singhal等,1996)。因此,MLC也被称为Van der Knaap-Singhal疾病(Van der Knaap等,2012)。因果变异的三个主要类别是:MLC1中的常染色体隐性突变,一种常染色体隐性隐性和glialcam中的常染色体显性突变(Capdevila-Nortes等,2013)。MLC1是第一个引起MLC并映射到22QTEL染色体的基因(Topçu等,2000; Leegwater等,2001)。MLC1转化为主要在大脑内的星形胶质细胞中表达的蛋白质(MLC1),尤其是在与血脑屏障的星形细胞末端脚接触(Masaki et al。,2012),在PIA MATER中,以及在Synaptic Cleft(Kater等人2023)中存在的星形胶质细胞。MLC患者的结构特征和观察到的大脑缺陷,例如脑水肿,液体填充囊肿,星形胶质细胞的空泡和降低降低,这表明MLC1可能调节
摘要:为了研究中国新鲜牛肉(CFB)的微生物的多样性和动力学,在冷藏过程中无酸排放处理,采用了高通量测序来分析CFB对0、3、7和10天的冷藏。结果表明,真菌和细菌的社区丰富性显着下降。但是,早期阶段的多样性下降,并在后期增加。在门水平上,蛋白酶(74.1–94.1%)和Firmicutes(77.3–96.8%)是绝对主要的真菌和细菌门。真菌和细菌门的相对丰度表现出增加然后减少的趋势。在属水平上,念珠菌(29.3–52.5%)和乳酸菌(19.8–59.3%)分别是主要的真菌和细菌属。念珠菌的相对丰度显示出增加然后减少的趋势,而乳球菌则具有相反的趋势。KEGG代谢途径分析表明,碳水化合物代谢,膜转运和氨基酸代谢是细菌的主要代谢途径。BugBase预测表明,冷藏过程中CFB细菌的主要微生物表型为革兰氏阳性(17.2–31.6%)。相关性分析表明,乳酸菌,柠檬酸杆菌,蛋白质和杜鹃花可能是促进CFB中降级物质产生的主要微生物。这项研究为保存中国新鲜牛肉提供了理论基础。
引言Ca 2+对于心脏电导传导和收缩至关重要(1,2)。虽然激发反应耦合触发了Ca 2+从肌浆网(SR)释放到通过Ryanodine receptors(Ryrs)到细胞质的,但SR Ca 2+将Ca 2+摄入Ca 2+在很大程度上由SR Ca 2+ -Atpase 2A(Serca 2a(Serca2a)(2,2,2,2,3)。在SR中,Ca 2+由最丰富的Ca 2+结合蛋白(Calsequestrin 2(Casq2)(4)保留。casq1与CASQ2高度同源,这两种蛋白质的作用类似于调节肌肉细胞中Ca 2+的稳态(5)。尽管CASQ1和CASQ2都存在于骨骼肌中,但仅在心肌细胞中发现CASQ2。小鼠遗传学研究表明,尽管SR Ca 2+稳态调节受到破坏,但CASQ1或CASQ2的丧失未能引起致命性心肌病(5)。相反,心肌细胞中具有CASQ2过表达的转基因小鼠患有严重的心肌病,并在16周的时间内过早死亡(6,7)。液泡心肌病是一种罕见但致命的心脏病,具有肌纤维中突出液泡的特征。它通常与溶酶体功能性缺陷有关,包括储存障碍(即富含酸α-葡萄糖苷酶缺乏症)和蛋白质缺乏症(即,Danon疾病,由LAMP2缺乏症引起)(8-10)。然而,经常观察到非散糖体相关的液泡心脏病,其发病机理需要研究(11,12)。染色质复制复合物调节大量基因表达(13)。以前,有报道称SWI/SNF染色质复合物调节心脏发育和产后心脏的生长(14)。例如,SWI/SNF染色质重塑剂的核心成分BRG1促进胚胎心肌细胞增殖并保留心脏分化(15)。在成年小鼠中,心脏应激激活的BRG1诱导病理α -MHC到β -MHC转移,导致肥大(15)。除了SWI/SNF染色质复合物复合物外,哺乳动物还存在其他3种其他染色质重塑剂(ISWI,NURD和INO80/SWR复合物)(13)。但是,与SWI/SNF复合物相比,这3种染色质复合物在产后心脏中的功能仍然未知。含锌手指命中域 - 含有含蛋白的蛋白1(Znhit1;补充表1;本文在线提供的补充材料; https://doi.org/10.1172/jci.insight.1487752ds1),是一个键