摘要:在适应环境挑战时,酶滥交在进化上是在植物上获得新酶功能的有利有利的。但是,这种滥交会对微生物中植物酶编码的基因的表达产生负面影响。在这里,我们表明,精炼类黄酮3' - 羟化酶(F3'H)和4'-O -O-甲基转移酶(F4'OMT)的滥交可改善(2 s) - 大肠杆菌中的粘蛋白蛋白产生。首先,我们采用了反分子对接来筛选来自Tricyrtis hirta的高底物特异性Thf3'h,可以选择性地将100 mg l-1(2 s) - 纳林蛋白转换为(2 s)-eriodictyol,但不是(2 s) - sososakuranetin,with airair cyto p450 p450。第二,我们采用了一种定向的进化方法来限制Mentha×Piperita的MPOMT的滥交。携带MPOMT S142V突变体的菌株表现出对(2 s)eriodictyol的偏爱。最后,产生了27.5 mg l-1(2 s) - hisperetin,而仅少量的(2 s) - eriodictyol和(2 s) - 苏瓜氏素作为副产物积累。该值与父母菌株相比,(2 s) - 嵌素增加了14倍,以及侧产物的急剧减少。我们的工作强调了减轻微生物细胞工厂生产天然产物时植物酶滥交的好处。关键字:酶混合,类黄酮,(2s) - hesperetin,定向进化,类黄酮3' - 羟化酶,黄酮4''-o-甲基转移酶■简介黄酮类黄酮是遥远的基本c 6 -c 6 -c 6 -c 6 -c 6 -c 6 carbon carbon carbone carbon car car car the care1除了它们的生态重要性外,2种类黄酮施加抗氧化剂,3,4抗癌,5和肝保护活性。6最近,报告了类黄酮对SARS-COV19的积极作用。7在2020年,全球类黄酮市场的价值为1.497亿美元,预计到2030年将达到2.7178亿美元(按产品类型,表格,应用程序,应用:全球机会分析和行业预测,2021 - 2030年)。尤其是O-甲基化的类黄酮已成为具有众多生物学和药理特性的8-11
使用正交翻译系统(OTSS)是通过在遗传密码中添加非经典氨基酸(NCAA)来产生非天然蛋白质的最有效方法。在寻求扩展底物特异性时,常规方法始于(超 - )稳定酶,能够承受由于必要突变而导致的结构变化。然而,我们在这里从发展以应对不稳定性的酶开始,从而占据根本不同的位置,因此可能对突变表现出更大的弹性。通过工程化甲烷菌Coides Burtonii的精神病(“冷”)OTS,我们开发了常用的中嗜和热嗜热系统的替代方法。即使在非常低的NCAA浓度下,这种OT在体内效率和滥交方面都显示出显着的特性。鉴于适用的寄主生物的广泛范围,我们预计冷酷将极大地促进扩展的遗传密码从学科转变为高价值化学驱动的生物技术。
[a]Martínez-Martínez等人提供的EHS的实验测量的底物滥交水平。1。[b]基于Arpigny和Jaeger分类的家族35。[C] TopScore预测的全蛋白误差估计比较模型15。[d]在Pymol中“ Alignto”确定的PDB结构的模型之间的均方根偏差;在Å。[E] EHS的催化活性残基。 [F]基于预测的H type2,EHS具有EHS的全局灵活性。 [g]基于预测的RC IJ,邻居的EHS催化活性残基的局部灵活性。[E] EHS的催化活性残基。[F]基于预测的H type2,EHS具有EHS的全局灵活性。 [g]基于预测的RC IJ,邻居的EHS催化活性残基的局部灵活性。[F]基于预测的H type2,EHS具有EHS的全局灵活性。[g]基于预测的RC IJ,邻居的EHS催化活性残基的局部灵活性。
1859 年,查尔斯·达尔文出版了他的《物种起源》,该书宣称人类是动物,与地球上的所有生命都有进化联系,挑战了人类的神创论和与动物世界分离的观念。对许多人来说,这种与动物世界的联系为人类的“不道德”提供了科学的解释。人类不再认为不道德的特征代表着上帝的惩罚或魔鬼的诱惑。相反,达尔文提供了一个自然的解释,即这些特征是我们进化的遗产。达尔文的表弟弗朗西斯·高尔顿进一步阐述了这一解释,并得出结论,大多数社会弊病,如暴力和滥交倾向,都是由遗传的动物行为造成的。作为自然而非神赋予的特征,它们应该可以在后代得到纠正。 1883年,高尔顿提出了一种人类选择性育种系统,他称之为“优生学”,他认为此举可以消除我们的兽性遗传,并改善由此造成的社会问题。
为了充分理解基因功能,在某个时候,有必要研究完整生物体的影响。在1980年代后期创造了第一只淘汰老鼠的创建引起了整合生理学领域的革命,这种革命一直持续到今天。在选择遗传修饰策略时,有许多复杂的选择,其中一些将在本综述中涉及,但主要重点是突出由于体内心脏表型的解释而引起的潜在问题和陷阱。作为典范,我们将仔细检查心脏能量学领域,并尝试了解肌酸激酶(CK)能量缓冲和运输系统在完整生物体中的作用。这个故事强调了遗传背景,性别和年龄的混杂影响,以及根据滥交蛋白和代谢冗余而解释淘汰模型的困难。它将考虑转基因过表达的剂量依赖性效应和意外后果,以及在体内表型技术的背景下需要进行实验性严格的结果。本次审查不仅将使心脏能量学领域具有清晰度,而且还将帮助非专家评估和批判性地评估由体内遗传修饰引起的数据。
摘要:奎宁是一种历史上重要的天然产物,其中含有甲氧基群,假定在后期途径阶段掺入。在这里,我们表明奎宁和相关的金chona生物碱中的甲氧基群被引入起始底物色素。用金chona植物的喂养研究明确地表明,5-甲氧氨基胺被用作植物中的奎宁生物合成中间体。我们发现了编码负责的氧化酶和甲基转移酶的生物合成基因,并使用这些基因重建了尼古替尼亚尼古替尼亚氏菌的Cinchona生物碱生物合成途径的早期步骤,以产生甲氧基和甲氧基甲氧基氧化氧化氧化氧化物碱性碱的混合物。重要的是,我们表明,色胺和5-甲氧氨基胺底物的共发生,以及下游途径酶的底物滥交,可以平行地形成甲氧基化和脱甲氧基化的甲氧基化和脱甲氧基化的生物碱。
蛋白质蛋白相互作用的抽象截断SH3结构域的膜重塑桥梁整合剂1(BIN1,Amphiphysin 2)蛋白会导致中心核肌病。在这里,我们使用常规的体外和基于细胞的测定方法评估了一组自然观察到的,以前未经表征的BIN1 SH3结构域变体的影响,从而监测与Dynamin 2(DNM2)相互作用的相互作用,并确定了可能有害的,并且还可以暂时连接到神经肌肉肌肉肌肉disorders。然而,SH3领域通常是滥交的,并且预计除了DNM2以外,迄今为止,BIN1的其他伴侣也参与了Centronuclear肌病的发展。为了阐明这些其他相关的相互作用伙伴,并为BIN1 SH3域变体背后的病理机理的整体描绘,我们使用了亲和力相互作用。我们确定了数百种新的BIN1相互作用伙伴蛋白质组,其中许多似乎参与细胞分裂,这表明BIN1在调节有丝分裂中的关键作用。最后,我们表明已鉴定出的BIN1突变确实会导致蛋白质组广泛的亲和力扰动,这表明采用了无偏见的亲和力相互作用方法的重要性。
假单胞菌具有代谢灵活性,可以在不同的植物宿主上茁壮成长。然而,宿主滥交所需的代谢适应性尚不清楚。在这里,我们通过采用 RNAseq 并比较东湖假单胞菌 P482 对两种植物宿主(番茄和玉米)根系分泌物的转录组反应来弥补这一知识空白。我们的主要目标是找出这两种反应之间的差异和共同点。仅由番茄分泌物上调的途径包括一氧化氮解毒、铁硫簇的修复、通过对氰化物不敏感的细胞色素 bd 进行呼吸以及氨基酸和/或脂肪酸的分解代谢。前两个表明测试植物的分泌物中存在 NO 供体。玉米特异性地诱导了 MexE RND 型外排泵的活性和铜耐受性。与运动相关的基因由玉米诱导,但被番茄抑制。对渗出液的共同反应似乎受到来自植物的化合物和来自其生长环境的化合物的影响:砷抗性和细菌铁蛋白合成上调,而硫同化、柠檬酸铁和/或其他铁载体的感知、血红素获取和极性氨基酸的运输下调。我们的研究结果为探索植物相关微生物的宿主适应机制提供了方向。
合成生物学的进步促进了将异源代谢途径掺入各种细菌底盘中,从而导致靶向生物产品的合成。然而,异源生产途径的总产量可能会遭受低浮标,酶滥交,有毒中间体的形成或对竞争反应的中间损失,这最终阻碍了其全部潜力。基于蛋白质的细菌微校区(BMC)的自组装,易于修饰的,提供了一种复杂的方法来克服这些障碍,通过充当与细胞的调节性和代谢网络解耦的自主催化模块。More than a decade of fun- damental research on various types of BMCs, particularly structural studies of shells and their self-assembly, the recruitment of enzymes to BMC shell scaffolds, and the involve- ment of ancillary proteins such as transporters, regulators, and activating enzymes in the integration of BMCs into the cell's metabolism, has signi fi cantly moved the fi eld 向前。这些进步使生物工程师能够设计合成的多酶BMC,以促进乙醇或氢的产生,增加细胞多磷酸盐水平,并将甘油转化为丙二醇或甲酸盐或丙酮酸。这些开创性的努力揭示了合成BMC的巨大潜力,以封装非本性多酶生化途径以合成高价值产品。
Ardioculcular疾病一直是全球死亡率的主要原因,目前估计每年1790万人死亡。早期评估动脉粥样硬化心血管疾病(ASCVD)风险对于预防性干预至关重要。血浆脂质组学的进步突出了循环神经酰胺作为ASCVD的风险预测因子。神经酰胺(一类鞘脂)在仅仅是生物膜的结构成分之外发挥了作用。它们是参与各种细胞过程的生物活性分子,包括细胞凋亡,线粒体损伤,炎症和胰岛素抵抗(图)。神经酰胺包含鞘氨醇主链和由酰胺键连接的脂肪酸部分。了解神经酰胺稳态如何在Cellular层面调节,并且在系统上是为了欣赏神经酰胺在ASCVD病理生理学和开发特定治疗干预措施中的作用所必需的。1在细胞水平上,关于特定的神经酰胺效应至关重要:物种,位置和信号传导潜力。神经酰胺物种由6种神经酰胺合酶(CERS1-6)确定,展示了细胞特异性的表达模式,并结合了不同的脂肪酰基-COA。尽管神经酰胺合酶特异性存在一些滥交,但酶促反应在很大程度上是底物驱动的。这些途径起源于不同的亚细胞室,由于受体和氢键的供体的生物物理特性,导致局部神经酰胺浓度很高。这是利益 -在心肌中,神经酰胺过载构成线粒体功能,并触发炎症和凋亡,导致心力衰竭。