作为一项旨在隔离人类肠道的所有细菌物种的培养物研究的一部分[1],我们在纯细菌菌株中分离了一种细菌菌株,矩阵辅助的激光脱骨/电离时间 - 质量光谱质量识别失败了http://www.mediterranee-infection.com/article.php?laref = 256&titre = urms-database)在微杆光谱仪上(Bruker Daltonics,莱比锡,德国)[2]。通过一个63岁的法国男子,患有严重的贫血的男子,与Melaena一起通过右结肠灌洗的样本来征服这种菌株,Melaena通过结肠镜检查进行了探测。患者的临床病史对于在此住院前4年进行了4年的袖子胃切除术而出色。患者提供了书面知情同意; IFR48国家伦理委员会(法国马赛)就这项研究达成了同意。在3天在37°C下在5%绵羊's
摘要:在过去的十年中,飞行质谱法(MALDI-TOF MS)的基质辅助解吸/电离时间已揭示了自己在临床微生物实验室的工作流程中的有效支持,用于鉴定细菌和真菌,在此应用程序中表现出高度可靠性和有效性。与常规的生化自动系统相比,它的使用降低了24小时,以获得微生物诊断的时间。提出了直接在临床样本中直接检测病原体的MALDI-TOF MS应用,但需要进行更深入的研究,而将其用于鉴定微生物的阳性血液培养物的应用,并且现在最有用的应用是最有用的应用。由于其迅速,准确性和低价在试剂和消耗品中,MALDI-TOF MS也已应用于临床微生物学的不同领域,例如检测抗生素易感性/抗性生物标志物,氨基酸序列的鉴定和蛋白质末端组的化学结构以及蛋白质末端组的化学结构,以及Microbial-amerial-amerial-amerial-a emerial-afemial-amerial-a emerial类型。其中一些应用程序正在等待广泛的评估,然后再确认转移到例程。MALDI-TOF MS尚未用于寄生虫的常规鉴定;然而,在过去的几年中,研究已经报道了其用于鉴定肠道原生动物,恶性疟原虫或外寄生虫的使用。MALDI-TOF MS在病毒鉴定中的创新应用也得到了报道,在将此工具改编为病毒诊断之前,请寻求进一步的研究。此迷你审查专注于诊断微生物实验室的现实生活中的MALDI-TOF MS应用。
在现代世界中,口腔的各种炎症性疾病已广泛,特别是牙周炎[1,2]。牙周炎和植入周围炎的主要原因是口腔微生物的组织感染。病理过程中已知的潜在参与者之一是链球菌,在几乎100%的病例中,它们在牙周口袋中被检测到[3-6]。同时,即使使用现代方法,链球菌仍然是识别微生物的最困难之一。当前,一种积极使用的物理方法来诊断包括链球菌在内的微生物,是基质辅助的激光解吸/电离时间 - 质谱质谱法(MALDI-TOFMS)。没有任何有关微生物识别的新技术,没有问题,而Maldi Tofms也是如此。是在具有基因型/蛋白质相似性的那些微型机构中无法进行准确的分歧,并且在数据库中没有可靠的数据[7]。在这方面,紧急任务是检测链球菌的物种鉴定。作为识别链球菌的替代方法,可以使用在生物医学实践中广泛应用的拉曼光谱法(RS)的方法[8]。rs允许分析分子的振动模式,并可以区分相似的分子,这使人们希望解决鉴定紧密相关的细菌物种的问题。鉴于链球菌作为各种局部疾病的致病药物的作用越来越大,需要在此方向上进行进一步的研究。以前,其他作者进行了类似的研究,但它集中在肺炎球菌的物种鉴定上,作为广义感染(肺炎和脑膜炎)的主要病因[9]。该研究的目的是对三种密切相关的链球菌链球菌,口腔链球菌和肺炎链球菌肺炎链球菌的菌株进行频谱研究,并使用拉曼光谱法对周期性诊断的细菌菌株进行快速评估。
铁和硫化微生物在几种自然和工业过程中起着重要作用。卵螺旋体(L.)铁皮氏菌是一种铁氧化的微生物,具有明显的适应性,可在极端的酸性环境中蓬勃发展,包括堆的生物渗透过程,酸性矿山排水(AMD)和天然酸性水。从智利北部的工业生物渗透过程中分离出了牛皮乳杆菌(IESL25)的菌株。该菌株挑战以增加硫酸盐浓度的生长,以评估蛋白质表达谱,细胞形状的变化并确定潜在的兼容溶质分子。结果揭示了三种蛋白质的变化:琥珀酸COA(SCOA)合成酶,异氯酸盐脱氢酶(IDH)和天冬氨酸半二氢脱氢酶(ASD);当菌株以硫酸盐浓度升高时,它们显着表达。ASD在兼容溶质纤维蛋白的合成中起关键作用,该溶质纤维蛋白与羟基切除素一起使用矩阵辅助激光解吸/飞行质谱法的电离时间(MALDI-TOF)。IDH,SCOA和骨蛋白产生之间的关系可能是由于TCA循环引起的,在该周期中,这两种酶产生的代谢产物可以用作前体或中间体的生物合成。此外,在硫酸盐应激条件下生长时,观察到了甲乳杆菌IESL25中不同的丝状细胞形态。这项研究强调了在高硫酸盐水平的存在下可能会发现甲乳杆菌可能的细胞反应的新见解,这通常是在硫化物矿物质或AMD环境的生物含量中发现的。
作者分支机构:1个国际分枝杆菌学实验室,丹麦哥本哈根Statens Serum Institut; 2英国诺丁汉诺丁汉特伦特大学生物科学系; 3罗斯基尔德大学科学与环境系,丹麦4000 Roskilde; 4丹麦哥本哈根大学公共卫生系全球卫生科。*通信:Xenia Emilie Sinding Iversen,Xesi@ssi。DK关键字:burgundiense sp。nov。;分枝杆菌Holstebronense sp。nov。;分枝杆菌kokjensenii sp。nov。;分枝杆菌Wendilense sp。nov。;非结核分枝杆菌;新物种;分类学描述。†共享的最后作者身份:这些作者对工作也同样贡献。在线补充材料中提供了补充数字和两个补充表。006620©2025作者缩写:ALRT,近似似然比测试; AMR,抗菌素耐药性; ANI,平均核苷酸身份; AST,抗菌敏感性测试; BIC,贝叶斯信息标准; CD,蛋白质编码序列; CLSI,临床和实验室标准研究所; GGD,基因组到基因组距离; HPLC,高性能液相色谱; IRLM,分枝杆菌国际参考实验室;它的内部转录垫片; LJ,Löwenstein -Jensen; LPA,线探测测定; MALDI-TOF,基质辅助激光解吸电离时间; MB7H10,Middlebrook 7H10; MBT,MALDIBIOTYPER®; MGIT,分枝杆菌生长指示灯管; MHB,Mueller – Hinton汤; MIC,最少抑制浓度; MS,质谱; NCBI,国家生物技术信息中心; NTM,无结核分枝杆菌; ONT,牛津纳米孔技术; PGAP,原核基因组注释管道; PPS,病原体概率评分; SSI,Statens Serum Institut;结核病,结核病; TES,N-三三(羟甲基)甲基-2-氨基乙磺酸; WGS,全基因组测序; Zn,Ziehl – Neelsen。