叶绿体ATP合酶包含质体和核遗传来源的亚基。为了研究这种复合物的协调生物发生,我们通过筛选绿色藻类衣原体中的新型ATP合酶突变体,通过筛选高光灵敏度。我们在这里报告了影响两个外围茎亚基B和B 0的突变体的表征,该突变体由ATPF和ATPG基因编码,以及三个鉴定核因子MDE1的独立突变体,这些突变体稳定叶绿体编码的ATPE mRNA所需的核因子MDE1。全基因组测序显示在ATPG的3 0 UTR中插入了转座子插入,而质谱显示在此敲低ATPG突变体中,功能性ATP合酶的一小部分积累。相反,通过CRISPR-CAS9基因编辑获得的敲除ATPG突变体,完全防止ATP合酶功能和积累,这也是在ATPF框架转移突变体中观察到的。与主要类囊体蛋白酶的FTSH1-1突变体穿越ATP合酶突变体将ATPH鉴定为FTSH底物,并表明FTSH显着促进了ATP合酶亚基的一致积累。在MDE1突变体中,不存在ATPE转录物完全阻止ATP合酶的生物发生和光合作用。使用嵌合ATPE基因营救ATPE转录本的积累,我们证明了一种新型的八度肽重复(OPR)蛋白MDE1遗传靶向ATPE 5 0 UTR。从主要内部生物生物症(〜1.5 Gy)的角度来看,将MDE1募集到其ATPE靶标招募了一个核/叶绿体相互作用的典范,这些相互作用是在最近进化的,在叶绿体的祖先中,我的cs cs cs exestor higlophyceae的祖先,〜300。
在原核生物和真核生物中,大多数已鉴定的离子泵 ATPase 属于以下三种结构类型之一。(i)F1Fo ATPase(F 型)存在于线粒体内膜(2)、叶绿体类囊体膜(3)和细菌细胞质膜(4)中。(ii)E1E2 ATPase(P 型)存在于真菌(5)、植物(6)和动物的细胞质膜中[包括 Na',K4-ATPase(7)和 H +,K + -ATPase(8)],以及肌细胞的肌浆网(Ca 2+-ATPase)(9)和细菌细胞质膜(K+-ATPase)(10,11)。 (iii) 已鉴定出第三类 ATPase(V 型),并从真菌和植物液泡(参考文献 12 及其中的参考文献)、包被囊泡(13、14)和嗜铬颗粒(15、16)的膜中部分纯化。正如 Mellman 等人(17)所建议的,我们使用术语“液泡 ATPase”来指代第三类 ATPase。F1Fo ATPase 通常使用 H+ 的电化学梯度(18)或偶尔使用 Na+ 梯度(19)来合成 ATP。这种类型的酶也表现出 ATPase 活性,在某些情况下仅在用蛋白酶活化后才表现出 ATPase 活性(20)。叠氮化物和 N,N'-二环己基碳二酰亚胺可抑制 F1Fo ATPase 的酶活性;寡霉素也可抑制线粒体 ATPase(21)。在 E1E2 ATPases 中,ATP 水解释放的能量与阳离子跨膜转运偶联。酶循环通过构象状态,包括形成磷酸化中间体。酶活性不受叠氮化物或寡霉素的影响,但被钒酸盐特异性抑制,在大多数情况下被 N-乙基马来酰亚胺和异硫氰酸荧光素抑制,而对于 Na4 ,K4-ATPase,则被乌巴因抑制 (5-11)。液泡 ATPases 似乎会水解 ATP,产生质子梯度,用于酸化细胞内区室 (12、17、22)。这组 ATP 酶因其抑制剂特异性而与其他两组 ATP 酶区分开来。液泡 ATPase 不受叠氮化物、寡霉素、钒酸盐或乌巴因的抑制。相反,
蛋白质N-乙酰化是真核生物中最丰富的翻译和后翻译的修饰之一,将其扩展到血管植物内的叶绿体。最近,在拟南芥中揭示了一种新型的塑料酶家族,该酶家族包括八个表现出双赖氨酸和N末端乙酰化活性的乙酰基转移酶。其中,GNAT1,GNAT2和GNAT3揭示了明显的系统发育接近,形成了称为NAA90的亚组。我们的研究着重于特征性GNAT1,与状态过渡乙酰转移酶GNAT2密切相关。与GNAT2相比,GNAT1对状态转变并不是必需的,并且与高光条件下的野生型相比,没有明显的表型差异,而GNAT2突变体受到了严重影响。然而,GNAT1突变体显示出类似于GNAT2突变体类似的类似类似类似的类囊体膜。对重组GNAT1的体外研究表明,在合成底物肽上表现出耐药的N端乙酰化活性。 通过N末端乙酰基团在两个独立的GNAT1敲除线中通过N末端乙酰基团在体内确认了这种活性。 这将塑料蛋白上的几个乙酰化位点归因于GNAT1,反映了GNAT2的底物光谱的子集。 此外,共免疫沉淀与质谱法相结合,揭示了GNAT1和GNAT2之间的牢固相互作用,以及GNAT2与GNAT3的显着关联 - NAA90中的第三个乙酰转移酶。 这些发现引入了质体代谢中乙酰化依赖性调节中的新型调节层。对重组GNAT1的体外研究表明,在合成底物肽上表现出耐药的N端乙酰化活性。通过N末端乙酰基团在两个独立的GNAT1敲除线中通过N末端乙酰基团在体内确认了这种活性。这将塑料蛋白上的几个乙酰化位点归因于GNAT1,反映了GNAT2的底物光谱的子集。共免疫沉淀与质谱法相结合,揭示了GNAT1和GNAT2之间的牢固相互作用,以及GNAT2与GNAT3的显着关联 - NAA90中的第三个乙酰转移酶。这些发现引入了质体代谢中乙酰化依赖性调节中的新型调节层。这项研究揭示了叶绿体中至少存在两个乙酰基转移酶络合物的存在,因此复合物的形成可能对整个乙酰基转移酶活性的细节具有关键作用。
使用小鼠ICM胚胎Beatrice F. Tan 1,Olivier J.M.Schäffers1,2,Sarra Merzouk 1,Eric M. Bindels 3,Danny Huylebroeck 4,Joost Gribnau 1,4,CathérineDupont1,†, * 1 1 1 1, * 1 1, * 1,荷兰鹿特丹,伊拉斯mus大学医学中心,伊拉斯特大学医学中心。2荷兰鹿特丹伊拉斯mus大学医学中心妇产科和胎儿医学系。3荷兰鹿特丹伊拉斯mus大学医学中心血液学系。4荷兰鹿特丹伊拉斯mus大学医学中心的细胞生物学系。†最后一位作者。*通讯作者:c.dupont@erasmusmc.nl。抽象的基于干细胞的胚胎模型是研究早期胚胎发生的有希望的替代方法。我们介绍了两个不同的模型,以复制小鼠胚胎发育过程中胚胎内胚层和epiblast之间的动力学。诱导性GATA6(I GATA6)胚胎体(EB),仅源自I GATA6胚胎干细胞(ES)细胞,对于对原始内胚层的位置依赖性发展进行建模非常有价值。内部细胞质量(ICM)胚胎,相反,通过汇总“野生型”和i GATA6 ES细胞形成,准确,以可比的PACE模拟在E7.5到E7.5的体内发育中的相当PACE模拟。值得注意的是,ICM胚胎模型细胞分类,并通过玫瑰花结状阶段,将层级从幼稚到启动多能的过渡。此外,在该模型中缺乏胚胎外胚层样细胞,将表皮和内脏内胚层引导到前发育的命运。因此,I GATA6 EB和ICM胚胎是在小鼠早期胚胎发育过程中对细胞命运决策的理解的强大工具。引言小鼠的植入前发育标志着两个细胞命运决策,每种都会导致谱系隔离[1]。在胚泡中,第一个隔离发生在胚胎第3-3.5(e3-e3.5)的情况下,并形成了滋养型剂(TE)和内部细胞质量(ICM)。随后在ICM中随后发生了第二个隔离,并形成了原始内胚层(PRE,低纤维细胞)和层细胞。在第二个决策中运行的机制涉及位置效应,细胞分选和凋亡。随着发育的进展,PRE不仅形成顶叶内胚层,还会产生内脏内胚层(VE),当后者从幼稚到启动的多能状态过渡时,围绕着层状的内胚层(VE)。pre/ve与层细胞之间的细胞间通信以及对其的相互解释调节了这两个谱系中每一个的发展。然而,沿子宫中小鼠小鼠胚胎的差可及性,了解胚胎发生的这些阶段的参与者和基因调节网络的变化受到了复杂,重叠和冗余的分子机制的阻碍。基于干细胞的胚胎模型已成为研究哺乳动物胚胎早期发育的有吸引力的替代方法,但并非没有局限性。类囊体的发育潜力较差,因为它们的PRE(E3.5-E4)的形成仍然很困难,并且取决于各种培养添加剂[2,11]。小鼠整合性胚胎模型,例如胚胎[2-4]和ETX胚胎[5-10],它们分别模拟了植入前和植入后发育,无法准确复制E3-E5.5之间的体内发育阶段。ETX胚胎在发育的特定阶段仍处于装配模式,因此对于从E5.5开始建模和研究胚胎发生最有用。此外,在这两个综合胚胎模型中达到高效率都构成了重要的