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DNA微阵列
MAS5 15 我们有什么？ 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 15 背景校正。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 16 局部噪音。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 16 计算表达值。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 17 理想不匹配。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 17 摘要值。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 17 Tukey 的双加权算法。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 18
用于生物技术教学的人工智能范例 | DR-NTU
用于教学生物技术的人工智能范式 Wilson Wen Bin Goh 1* 和 Chun Chau Sze 1* 1 南洋理工大学生物科学学院，新加坡 637551 * 通信地址：wilsongoh@ntu.edu.sg（Goh，WWB）；ccsze@ntu.edu.sg（Sze，CC） 摘要（49 字）人工智能 (AI) 正在深刻改变生物技术创新。除了直接应用之外，它还是一种有用的工具，可用于自适应学习和在庞大的知识网络中建立新的概念联系，以促进生物技术的发展。我们讨论了一种与人工智能共同进化的生物技术教育新范式。 关键词 教育；人工智能；学生作为伙伴；体验式学习 生物技术建立在跨学科知识网络之上 生物技术广泛涉及多学科，一方面涉及修改和使用生物系统创造新产品，另一方面涉及应用技术解决生物问题。它利用生物过程工程、组学和基因编辑技术、材料科学、光学和电子工程等不同领域来挖掘生物系统的潜力。生物技术创新依赖于通过跨学科专家之间的协同学习、讨论和合作，在庞大的知识网络中建立有意义的联系。微阵列是一个典型的例子，它展示了精密工程、计算、化学、生物学、统计学和数学如何统一为一种测量基因表达的实用技术。该技术基于细胞的基本生物化学——核酸与自身的互补版本非常特异性地结合形成双链分子。理论上，通过这一生物学原理可以确定整体基因表达（即 mRNA 组的存在），但其他领域也需要发挥作用。精密工程可实现可重复大小的阵列，将基于 DNA 的基因探针序列定位到芯片的精确位置；化学有助于合成此类基因探针以及染料标签，以产生与结合样品数量相对应的荧光；电气工程有助于开发捕捉芯片图像所需的灵敏相机；计算机硬件开发产生了信号提取方法（将照片图像数字化为强度矩阵）；统计和数学方法有助于执行背景校正、标准化、识别有趣的信号和挖掘重要的模式。最后，生物学家解释处理后的数据，并希望揭示相关的细胞机制。将不同的领域联系起来以产生创新是有意而有意义的。这种建立有意义的联系的过程是生物技术成功的关键公式，质谱蛋白质组学、下一代测序和合成生物学也是如此。生物技术人员不仅需要从许多学科中学习，还需要学习如何建立有意义的联系。他们可以在这方面做得更好，其中一种方法就是创新生物技术
从 TPM2 获得的新见解
材料与方法 AS 数据集 本研究中，我们从基因表达综合 (GEO) 数据库 (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/) 中获得了 AS 的转录组表达谱 GSE43292 (GPL6244)、GSE57691 (GPL10558) 和 GSE125771 (GPL17586)（表 S1）。使用 R 包“limma”对 GSE43292、GSE57691 和 GSE125771 进行探针汇总、合并和背景校正。 微环境评分 ESTIMATE 算法主要基于单个样本的基因集富集分析 (GSEA)，利用表达谱数据对基质细胞和免疫细胞进行评分，然后预测这两类细胞的含量。本研究采用ESTIMATE算法对动脉微环境进行评分，并使用R包绘制微环境评分的散点图，以展示样本与评分之间的关系。TPM2与微环境评分的关系以基质、免疫和ESTIMATE评分作为对差异基因筛选确定的基因进行分组的依据。使用R包“limma”研究TPM2与微环境评分之间的关系。使用受试者工作特征（ROC）曲线检验微环境评分与TPM2关系的诊断价值。加权基因共表达网络分析（WGCNA）使用R包“WGCNA”对所有基因进行WGCNA。对于WGCNA，使用72个AS样本和42个正常样本构建所有基因的共表达网络。使用样本创建邻接矩阵，然后将其转换为拓扑重叠矩阵（TOM）。利用基于TOM的差异测量方法将基因划分为不同的基因模块，最小基因模块>100，相似模块合并的阈值为0.1，利用这些值寻找在AS中发挥重要作用的模块。同时，还利用WGCNA预测模块中基因之间的互连，然后将数据导入Cytoscape软件以绘制基因之间的连接图。还利用基因本体论（GO）分析对TPM2进行了分析，并使用Cytoscape中的BiNGO插件将结果可视化。Cytoscape软件可以为生物学家提供生物网络分析和二维（2D）可视化。BiNGO插件是一种用于确定哪些GO类别在一组基因或生物网络的子图中具有统计过度表达的工具。BiNGO将给定基因集的主要功能主题映射到GO层次结构上，并将此映射输出为Cytoscape图。功能富集分析GSEA是一种可以对全基因组进行GO和KEGG（京都基因和基因组百科全书）分析的计算方法。在我们的研究中，我们根据TPM2的表达水平对样本进行分组，并使用GSEA对全基因组进行GO和KEGG分析。单基因分析 使用 R 包“limma”进行单基因差异分析。 鉴定与 AS 相关的 TPM2 比较毒理基因组学数据库 (CTD 数据库，http://ctdbase.org/) 可用于预测基因/蛋白质与疾病之间的关系。在我们的研究中，使用该数据库分析了 TPM2 与 AS 之间的关系。
ph.d。课程工作教学大纲物理M G K V P ...
单位 - 研究定义，研究假设，研究和基本研究，研究动机，研究方法的含义，研究与研究方法学之间的差异。研究方法和相关工具，研究类型，研究的意义，研究人员的素质，研究问题的组成部分，科学研究的各种步骤，研究目的，研究设计，研究概述，研究概述，文献调查，流程图研究过程，条件和良好研究标准。沟通技巧在研究和写作中表达力量的研究发展，演示技巧的重要性。关于研究主题的进度报告写作。困境和决定 - 现实。单元-II-II计算机基础知识，硬件和软件，不同的操作系统，应用程序，计算机应用程序，文字处理，Excel，Excel，Power Point，Power Point，数据处理，使用Web-2工具用于研究，使用图形软件的使用，使用多媒体工具，多媒体工具，结构，结构和组件研究报告，研究报告，报告写作，Seninar，Seminar，介绍。报告类型：研究论文，论文。研究项目报告，图片和图，引文样式。单位-III在Linux环境中工作，基本Linux命令，用乳胶，图形和可视化编写科学文档，GNU图；其他有用的软件工具的简介，例如Mathematica计算机编程。使用设计思维方法避免窃并正确使用电子资源。文字和参考书：1。2。Tex和乳胶之间的差异，使用乳胶，乳胶输入文件，输入文件结构，文档布局，标题，章节和部分的布局，交叉参考，脚注，环境，排版，数学公式，矩阵，矩阵，表格，包括包装的帖子图形图形图形图形，书目，书目，下载和安装液的构建块。对来源的简介，导入和导出数据的基础，与Microsoft Excel一起工作，图形，原点的统计信息，基本的线性回归和曲线拟合，最小平方拟合的方法与线性方程，非线性曲线拟合，背景校正，使用原点进行数据操作。IV单元的性质和伦理范围，伦理学的挑战和重要性，研究，伦理学和学术诚实的伦理学，写作中的伦理，学术诚信，研究不当行为/制造/不道德实践学术/研究：伪造，操纵或回火。 写作高质量的学术出版物，科学阅读，引用和写作，窃政策，处罚和后果。 Kumar Ranjit，研究方法论：初学者的逐步指南，Sage出版，2014年。 Kothari C.R. ：研究方法论，《新时代国际》，2011年。 3。 anthulingom n：研究方法论，喜马拉雅人出版4。 C. Rajendar Kumar：研究方法论，APH出版。 5。 Pradeep K.Sinha，计算机基础 - 第8版，BPB出版物6。 Nicola L. C. Talbot，乳胶完成新手7。 Stefan Kottwitz，乳胶初学者指南，Packt Publishing，2011年8。 9。 10。 11。IV单元的性质和伦理范围，伦理学的挑战和重要性，研究，伦理学和学术诚实的伦理学，写作中的伦理，学术诚信，研究不当行为/制造/不道德实践学术/研究：伪造，操纵或回火。写作高质量的学术出版物，科学阅读，引用和写作，窃政策，处罚和后果。Kumar Ranjit，研究方法论：初学者的逐步指南，Sage出版，2014年。Kothari C.R.：研究方法论，《新时代国际》，2011年。3。anthulingom n：研究方法论，喜马拉雅人出版4。C. Rajendar Kumar：研究方法论，APH出版。5。Pradeep K.Sinha，计算机基础 - 第8版，BPB出版物6。Nicola L. C. Talbot，乳胶完成新手7。Stefan Kottwitz，乳胶初学者指南，Packt Publishing，2011年8。9。10。11。Muhammad Arsalan，Origin软件：新用户的完整指南。John G D'Angelo，《科学伦理》，科学研究中的道德不当行为。 Partha Pratim Ray，研究和出版伦理指南。 Sandra C. Greer，物理科学家的伦理学要素。John G D'Angelo，《科学伦理》，科学研究中的道德不当行为。Partha Pratim Ray，研究和出版伦理指南。Sandra C. Greer，物理科学家的伦理学要素。