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创建人类胚胎模型的方法
人类胎盘从妊娠到妊娠5周。第一部分：我们对植入后形成性胎盘发育有何了解？J L James，A M Carter，L W Chamley，胎盘。33（5）：327-34，2012 https：//doi.org/10.1016/j.placenta.2012.01.020 fige1
幼稚的人类多能干细胞保持胚胎，胚外和胚泡产生潜力
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证。根据作者/资助者，它是根据预印本提供的（未经同行评审的认证），他已授予Biorxiv的许可证，以在2025年1月28日发布的此版本中在版权所有者中显示预印本。 https://doi.org/10.1101/2025.01.17.633522 doi：Biorxiv Preprint
幼稚的人类多能干细胞保持胚胎，胚外和胚泡产生潜力
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证。是根据作者/资助者提供的预印本（未经同行评审认证）提供的，他已授予Biorxiv的许可证，以在2025年1月20日发布的此版本中显示此版本的版权持有人。 https://doi.org/10.1101/2025.01.17.633522 doi：Biorxiv Preprint
水稻受精卵、成熟胚、未成熟胚再生植株突变的全基因组序列分析
通过全基因组测序，研究了由单个母株的合子、成熟胚和未成熟胚再生的水稻植株 (Oryza sativa L.，‘Nippon-bare’) 的体细胞克隆变异。还对母株和其种子繁殖子代进行了测序。在子代中检测到了 338 个母株序列变异，平均值范围从种子繁殖植株的 9.0 到成熟胚再生体的 37.4。利用种子繁殖植株中的变异计算出的自然突变率为 1.2 × 10 –8，与之前报道的值一致。种子繁殖植株中变异的单核苷酸变异 (SNV) 比例为 91.1%，高于之前报道的 56.1%，且与再生体中的差异不显著。总体而言，如前所述，再生体中 SNV 的转换与颠换比率较低。成熟胚再生的植物的变异明显多于不同子代类型。因此，在水稻遗传操作过程中，使用受精卵和未成熟胚可以减少体细胞克隆变异。
水稻受精卵、成熟胚、未成熟胚再生植株突变的全基因组序列分析
通过全基因组测序，研究了由单个母株的合子、成熟胚和未成熟胚再生的水稻植株 (Oryza sativa L.，‘Nippon-bare’) 的体细胞克隆变异。还对母株和种子繁殖子代进行了测序。在子代中检测到了 338 个母株序列变异，平均值范围从种子繁殖植株的 9.0 到成熟胚再生体的 37.4。利用种子繁殖植株中的变异计算出的自然突变率为 1.2 × 10 –8，与之前报道的值一致。种子繁殖植株中变异的单核苷酸变异 (SNV) 比例为 91.1%，高于之前报道的 56.1%，且与再生体中的差异不显著。总体而言，如前所述，再生体中 SNV 的转换与颠换比率较低。成熟胚再生的植物的变异明显多于不同子代类型。因此，在水稻遗传操作过程中，使用受精卵和未成熟胚可以减少体细胞克隆变异。
中胚疾病链接和生物标志物
结果：这项研究中发现了几种生物标志物，以增强我们对CTA的理解。此外，我们的发现揭示了CTA和Ecto-secodermal疾病之间的显着关联，这之前尚未进行广泛探讨。值得注意的是，在发育前和发育后阶段都表达了24个双表达基因，这表明在牙齿完整性，修复和稳态中具有调节作用。代谢组学分析显示，与CTA独特相关的28个上调和17个下调的代谢产物。关键的代谢改变涉及核苷酸代谢，嘌呤代谢，氧化应激和WNT信号传导。高性能代谢物（AUC≥0.90），包括PEG N5（0.99），PEG N6（0.98）（0.98）（0.98），PEG-4（0.97），PEG N7（0.96），PEG N8（0.95），0.94（0.94），咖啡因（0.94），咖啡因（0.94），Hydroxycaproic（0.91）和Alpha-Alpha-Apperyl（0.91）和Alphaa-appArty基因（0.91）（0.91）（0.91）（0.91）（0.91）强大的诊断潜力。CTA患者在对照组中显示292例独特的代谢产物与238例，表明代谢途径改变。蛋白质组学分析鉴定出76个上调和33个下调的基因，并具有关键的生物标志物[SERPINA1（0.92），PZP（0.90），FGA（0.91），TLN1（0.94），FGB（0.95）]，显示AUC-ROC≥0.90。pan-omics融合，然后进行弦分析确定了20个与先天性牙齿发育量信号密切相关的中央集线器基因。
线粒体载体在人肠寄生虫胚泡
抽象的杂种形成了各种真核生物的进化枝，包括多细胞藻类，鱼类和植物性的致病性卵菌，例如马铃薯枯萎病植物植物和人类肠道原生动物原生动物胚泡。在大多数真核生物中，糖酵解是一种严格的胞质代谢途径，将葡萄糖转化为丙酮酸，导致NADH和ATP的产生（三磷酸腺苷）。相比之下，斯流媒体具有分支的糖酵解，其中回报阶段的酶位于细胞质和线粒体基质中。在这里，我们在胚泡中确定了一个可以运输糖酵解中间体的线粒体载体，例如二羟基乙酮磷酸二羟基苯甲酸酯和3-磷酸甘油醛，穿越线粒体内膜，与细胞质和线粒体分支相关。与系统发育相关的人线粒体氧甲酸酯载体（SLC25A11）和二烷基化合物载体（SLC25A10）进行了比较分析，表明糖酵解中间载体失去了其经过跨性质底物疟疾和氧气的能力。胚泡缺少生成线粒体ATP所需的几个关键成分，例如复合物III和IV，ATP合酶以及ADP/ATP载体。线粒体矩阵中糖酵解的回报阶段的存在会产生ATP，该ATP可以为诸如型蛋白质i使用的蛋白质促进蛋白质和蛋白质和分解蛋白质的物质，从而为诸如大分子核酸菌合物以及NADH等动力提供动力。鉴于其在碳和能源代谢中的独特底物特异性和中心作用，此处鉴定出的糖酵解中间体的载体代表了针对斯特雷默培养病原体的特定药物和农药靶标，这是非常重要的。
胚泡：肠道微生物组的神秘成员
1 Tokat Gaziosmanpasa大学寄生虫学系，Tokat 60030，Türkiye2，Türkiye2寄生虫学系，Aydin Adnan Menderes大学医学院，Aydin Adnan Menderes University，Aydin 09010，Türkiye； erdogan.malatyali@adu.edu.tr 3 3 Ankara Ankara City Hospital，Ankara 06500，Türkiye的医学微生物学系； filiz.demirel@gmail.com 4türkiye的Zonguldak 67300的KaradenizEre˘gli州立医院医学微生物学系； cburcakt@yahoo.com 5兽医学院兽医学系，尼科西亚大学兽医学院，尼科西亚2414年，塞浦路斯； gentekaki.e@unic.ac.cy 6分子和进化寄生虫学实验室，快速小组，生物科学学院，肯特大学，坎特伯雷CT2 7NZ，英国肯特大学； a.tsaousis@kent.ac.uk 7医学寄生虫学部医学微生物学系，加西大学医学院，安卡拉06560，türkiye； alfunda@gazi.edu.tr *通信：mehmetaykur@gmail.com1 Tokat Gaziosmanpasa大学寄生虫学系，Tokat 60030，Türkiye2，Türkiye2寄生虫学系，Aydin Adnan Menderes大学医学院，Aydin Adnan Menderes University，Aydin 09010，Türkiye； erdogan.malatyali@adu.edu.tr 3 3 Ankara Ankara City Hospital，Ankara 06500，Türkiye的医学微生物学系； filiz.demirel@gmail.com 4türkiye的Zonguldak 67300的KaradenizEre˘gli州立医院医学微生物学系； cburcakt@yahoo.com 5兽医学院兽医学系，尼科西亚大学兽医学院，尼科西亚2414年，塞浦路斯； gentekaki.e@unic.ac.cy 6分子和进化寄生虫学实验室，快速小组，生物科学学院，肯特大学，坎特伯雷CT2 7NZ，英国肯特大学； a.tsaousis@kent.ac.uk 7医学寄生虫学部医学微生物学系，加西大学医学院，安卡拉06560，türkiye； alfunda@gazi.edu.tr *通信：mehmetaykur@gmail.com
利用神经速度场进行微分同胚图像配准
微分同胚图像配准能够提供平滑的变换和拓扑保存，在许多医学图像分析任务中是必需的。传统方法对可接受的变换空间施加某些建模约束，并使用优化来寻找两幅图像之间的最佳变换。指定正确的可接受的变换空间具有挑战性：如果空间过于严格，配准质量可能会很差，而如果空间过于笼统，则优化可能难以解决。最近基于学习的方法利用深度神经网络直接学习变换，实现了快速推理，但由于难以捕捉微小的局部变形和泛化能力，在准确性方面面临挑战。在这里，我们提出了一种新的基于优化的方法，称为 DNVF（带神经速度场的微分同胚图像配准），该方法利用深度神经网络来建模可接受的变换空间。具有正弦激活函数的多层感知器 (MLP) 用于表示连续速度场，并为空间中的每个点分配一个速度矢量，从而提供对复杂变形进行建模的灵活性以及优化的便利性。此外，我们提出了一种级联图像配准框架 (Cas-DNVF)，结合了优化和基于学习的方法的优点，其中训练完全卷积神经网络 (FCN) 来预测初始变形，然后使用 DNVF 进行进一步细化。在两个大型 3D MR 脑部扫描数据集上进行的实验表明，我们提出的方法明显优于最先进的配准方法。
评论文章胚泡和肠易激综合症
肠易激综合征（IBS）被分类为功能性胃肠道疾病的类别，这些功能性胃肠道疾病的特征是腹部不适或疼痛，并以腹泻或便秘的形式不规则肠运动，没有已知的有机原因。感染后的IBS（PI-IBS）是指肠道感染后发展IBS。包括胚泡在内的各种寄生虫被认为是PI-IBS的潜在原因。胚泡属。是一种单细胞寄生虫，在包括人在内的不同哺乳动物的肠道定植。几个因素，例如亚型，寄生虫负荷和与宿主相关的因素可能影响胚泡感染的结果。几项研究表明，胚泡属的存在之间存在关系。和IBS，因为它在IBS患者中经常发现。一些研究将胚泡的某些亚型（如胚泡ST-1和胚泡ST-3）与IBS联系起来，但大多数研究无法在IBS和特定亚型之间建立明显的关联。炎症，营养不良和肠道稳态的破坏是胚泡SPP的主要建议机制。可能导致IBS。