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ashs_vol-113_box-01 _Book-05
放热炎症米卡利亚河中的冷损伤。Amer。 J. Enol。 葡萄。 31：1-6。 Proebsting，E.L.，Jr.1963。 空气温度和芽的作用在确定休眠的“ Elberta”桃果芽的坚固性中。 proc。 Amer。 Soc。 hort。 SCI。 83：259-269。 Proebsting，E.L.，Jr.1970。 秋天和冬季温度与落叶果树的花芽行为和木质硬度的关系。 Hortscience 5：422-424。 proebsting，E.L。和H.H. 工厂。 1972。 比较了“ Bing”樱桃和“ Elberta”桃子的果芽中坚硬的反应。 J. Amer。 Soc。 hort。 SCI。 97：802-806。 Quamme，H.A。 1978。 在越冬的桃花芽中过冷的机制。 J. Amer。 Soc。 hort。 SCI。 103：57-61。 Quamme，H.A。 1983。 空气温度与水含量的关系和越冬的桃花芽的过冷。 J. Amer。 Soc。 hort。 SCI。 108：697-701。 Quamme，H.A。 1985。 通过深冷的避免木质植物中的冷冻损伤。 Acta Hort。 168：11-30。 Quamme，H.A.，C。Stushnoff和C.J. Weiser。 1972。 关系Amer。J. Enol。 葡萄。 31：1-6。 Proebsting，E.L.，Jr.1963。 空气温度和芽的作用在确定休眠的“ Elberta”桃果芽的坚固性中。 proc。 Amer。 Soc。 hort。 SCI。 83：259-269。 Proebsting，E.L.，Jr.1970。 秋天和冬季温度与落叶果树的花芽行为和木质硬度的关系。 Hortscience 5：422-424。 proebsting，E.L。和H.H. 工厂。 1972。 比较了“ Bing”樱桃和“ Elberta”桃子的果芽中坚硬的反应。 J. Amer。 Soc。 hort。 SCI。 97：802-806。 Quamme，H.A。 1978。 在越冬的桃花芽中过冷的机制。 J. Amer。 Soc。 hort。 SCI。 103：57-61。 Quamme，H.A。 1983。 空气温度与水含量的关系和越冬的桃花芽的过冷。 J. Amer。 Soc。 hort。 SCI。 108：697-701。 Quamme，H.A。 1985。 通过深冷的避免木质植物中的冷冻损伤。 Acta Hort。 168：11-30。 Quamme，H.A.，C。Stushnoff和C.J. Weiser。 1972。 关系J. Enol。葡萄。31：1-6。Proebsting，E.L.，Jr.1963。空气温度和芽的作用在确定休眠的“ Elberta”桃果芽的坚固性中。proc。Amer。 Soc。 hort。 SCI。 83：259-269。 Proebsting，E.L.，Jr.1970。 秋天和冬季温度与落叶果树的花芽行为和木质硬度的关系。 Hortscience 5：422-424。 proebsting，E.L。和H.H. 工厂。 1972。 比较了“ Bing”樱桃和“ Elberta”桃子的果芽中坚硬的反应。 J. Amer。 Soc。 hort。 SCI。 97：802-806。 Quamme，H.A。 1978。 在越冬的桃花芽中过冷的机制。 J. Amer。 Soc。 hort。 SCI。 103：57-61。 Quamme，H.A。 1983。 空气温度与水含量的关系和越冬的桃花芽的过冷。 J. Amer。 Soc。 hort。 SCI。 108：697-701。 Quamme，H.A。 1985。 通过深冷的避免木质植物中的冷冻损伤。 Acta Hort。 168：11-30。 Quamme，H.A.，C。Stushnoff和C.J. Weiser。 1972。 关系Amer。Soc。hort。SCI。 83：259-269。 Proebsting，E.L.，Jr.1970。 秋天和冬季温度与落叶果树的花芽行为和木质硬度的关系。 Hortscience 5：422-424。 proebsting，E.L。和H.H. 工厂。 1972。 比较了“ Bing”樱桃和“ Elberta”桃子的果芽中坚硬的反应。 J. Amer。 Soc。 hort。 SCI。 97：802-806。 Quamme，H.A。 1978。 在越冬的桃花芽中过冷的机制。 J. Amer。 Soc。 hort。 SCI。 103：57-61。 Quamme，H.A。 1983。 空气温度与水含量的关系和越冬的桃花芽的过冷。 J. Amer。 Soc。 hort。 SCI。 108：697-701。 Quamme，H.A。 1985。 通过深冷的避免木质植物中的冷冻损伤。 Acta Hort。 168：11-30。 Quamme，H.A.，C。Stushnoff和C.J. Weiser。 1972。 关系SCI。83：259-269。 Proebsting，E.L.，Jr.1970。 秋天和冬季温度与落叶果树的花芽行为和木质硬度的关系。 Hortscience 5：422-424。 proebsting，E.L。和H.H. 工厂。 1972。 比较了“ Bing”樱桃和“ Elberta”桃子的果芽中坚硬的反应。 J. Amer。 Soc。 hort。 SCI。 97：802-806。 Quamme，H.A。 1978。 在越冬的桃花芽中过冷的机制。 J. Amer。 Soc。 hort。 SCI。 103：57-61。 Quamme，H.A。 1983。 空气温度与水含量的关系和越冬的桃花芽的过冷。 J. Amer。 Soc。 hort。 SCI。 108：697-701。 Quamme，H.A。 1985。 通过深冷的避免木质植物中的冷冻损伤。 Acta Hort。 168：11-30。 Quamme，H.A.，C。Stushnoff和C.J. Weiser。 1972。 关系83：259-269。Proebsting，E.L.，Jr.1970。秋天和冬季温度与落叶果树的花芽行为和木质硬度的关系。Hortscience 5：422-424。proebsting，E.L。和H.H.工厂。1972。比较了“ Bing”樱桃和“ Elberta”桃子的果芽中坚硬的反应。J. Amer。 Soc。 hort。 SCI。 97：802-806。 Quamme，H.A。 1978。 在越冬的桃花芽中过冷的机制。 J. Amer。 Soc。 hort。 SCI。 103：57-61。 Quamme，H.A。 1983。 空气温度与水含量的关系和越冬的桃花芽的过冷。 J. Amer。 Soc。 hort。 SCI。 108：697-701。 Quamme，H.A。 1985。 通过深冷的避免木质植物中的冷冻损伤。 Acta Hort。 168：11-30。 Quamme，H.A.，C。Stushnoff和C.J. Weiser。 1972。 关系J. Amer。Soc。hort。SCI。 97：802-806。 Quamme，H.A。 1978。 在越冬的桃花芽中过冷的机制。 J. Amer。 Soc。 hort。 SCI。 103：57-61。 Quamme，H.A。 1983。 空气温度与水含量的关系和越冬的桃花芽的过冷。 J. Amer。 Soc。 hort。 SCI。 108：697-701。 Quamme，H.A。 1985。 通过深冷的避免木质植物中的冷冻损伤。 Acta Hort。 168：11-30。 Quamme，H.A.，C。Stushnoff和C.J. Weiser。 1972。 关系SCI。97：802-806。Quamme，H.A。1978。在越冬的桃花芽中过冷的机制。J. Amer。 Soc。 hort。 SCI。 103：57-61。 Quamme，H.A。 1983。 空气温度与水含量的关系和越冬的桃花芽的过冷。 J. Amer。 Soc。 hort。 SCI。 108：697-701。 Quamme，H.A。 1985。 通过深冷的避免木质植物中的冷冻损伤。 Acta Hort。 168：11-30。 Quamme，H.A.，C。Stushnoff和C.J. Weiser。 1972。 关系J. Amer。Soc。hort。SCI。 103：57-61。 Quamme，H.A。 1983。 空气温度与水含量的关系和越冬的桃花芽的过冷。 J. Amer。 Soc。 hort。 SCI。 108：697-701。 Quamme，H.A。 1985。 通过深冷的避免木质植物中的冷冻损伤。 Acta Hort。 168：11-30。 Quamme，H.A.，C。Stushnoff和C.J. Weiser。 1972。 关系SCI。103：57-61。Quamme，H.A。1983。空气温度与水含量的关系和越冬的桃花芽的过冷。J. Amer。 Soc。 hort。 SCI。 108：697-701。 Quamme，H.A。 1985。 通过深冷的避免木质植物中的冷冻损伤。 Acta Hort。 168：11-30。 Quamme，H.A.，C。Stushnoff和C.J. Weiser。 1972。 关系J. Amer。Soc。hort。SCI。 108：697-701。 Quamme，H.A。 1985。 通过深冷的避免木质植物中的冷冻损伤。 Acta Hort。 168：11-30。 Quamme，H.A.，C。Stushnoff和C.J. Weiser。 1972。 关系SCI。108：697-701。Quamme，H.A。1985。通过深冷的避免木质植物中的冷冻损伤。Acta Hort。168：11-30。 Quamme，H.A.，C。Stushnoff和C.J. Weiser。 1972。 关系168：11-30。Quamme，H.A.，C。Stushnoff和C.J.Weiser。1972。关系
大豆六种组织中可及染色质区域的鉴定
可及染色质区域 (ACR) 与基因组中的基因表达紧密相关。保守的非编码顺式调控元件，如转录因子结合基序，通常存在于 ACR 中，表明 ACR 在植物基因组结构中起着重要的调控作用。然而，关于大豆 ACR 的研究很少，尤其是针对特定组织的研究。因此，在本研究中，我们利用便捷的 ATAC-seq，鉴定了六种大豆组织中的 ACR，包括根、叶芽、花、花芽、发育中的种子和豆荚。总的来说，ACR 约占整个大豆基因组的 3.3%。通过整合 RNA 测序和转录因子 (TF) ChIP-seq 的结果，发现 ACR 与大豆中的基因表达和 TF 结合能力紧密相关。总之，这些数据提供了对大豆 ACR 基因组特征的全面了解。作为重要基因组资源的集合，这些处理后的数据可在 datahub.wildsoydb.org 上获取。
TERMINAL FLOWER 1 基因敲除改变了油菜的开花时间和植株结构
背景：顶花基因1（TFL1）属于磷脂酰乙醇胺结合蛋白（PEBP）家族，在高等植物花分生组织身份决定及开花时间调控中起重要作用。结果：在油菜基因组中鉴定出5个BnaTFL1基因拷贝。系统发育分析表明，5个BnaTFL1基因拷贝与祖先种芜菁和甘蓝中相应的同源拷贝聚集在一起。BnaTFL1的表达局限于花芽、花、种子、角果和茎组织中，并表现出不同的表达谱。利用CRISPR/Cas9技术产生的BnaC03.TFL1敲除突变体表现出早花表型，而其他基因拷贝的敲除突变体开花时间与野生型相似。此外，BnaTFL1基因单个拷贝的敲除突变体表现出了植株结构的改变，BnaTFL1突变体的株高、分枝起始高度、分枝数、角果数、每角果种子数和主花序上的角果数均显著减少。
非洲豆薯荚和叶面疾病病原菌炭疽菌 (Colletotrichum siamense) 和炭疽菌 (Colletotrichum truncatum) 的全基因组序列
1. Silva C、Michereff S。2014 年。炭疽菌属的生物学和热带果树炭疽病的流行病学。Rev Caatinga 26:130–138。https://www.proquest.com/docview/1787752398?sourcetype=Scholarly%20Journals。2. Weir BS、Johnston PR、Damm U。2012 年。炭疽菌 gloeosporioides 物种复合体。Stud Mycol 73:115–180。https://doi.org/10.3114/sim0011 3. Liu F、Wang M、Damm U、Crous PW、Cai L。2016 年。植物病原真菌的物种边界：炭疽菌案例研究。BMC Evol Biol 16:81。 https://doi.org/10.1186/s12862-016-0649-5 4. Rogério F、Ciampi-Guillardi M、Barbieri MCG、Bragança CAD、Seixas CDS、Almeida AMR、Massola NS Jr. 2017。与巴西大豆炭疽病相关的元宝炭疽病的系统发育和变异。应用微生物学杂志 122：402–415。 https://doi.org/10.1111/jam.13346 5.Hartman GL、Sinclair JB、Rupe JC。 1999.大豆病害简述。第四版。 APS 出版社，美国明尼苏达州圣保罗。 6. Afolabi CG、Ogunsanya OM、Lawal OI。 2019. 评估一些非洲豆薯（Sphenostylis stenocarpa [Hochst. Ex A. Rich]）种质对花芽和豆荚腐烂病的抗性。Curr Plant Biol 20:100126。https://doi.org/10.1016/j.cpb.2019.100126
赤霉素抑制剂对芒果（Mangifera indica L.）品种 Irwin 花芽分化和代谢物动力学的潜在影响
全球气温上升导致温室内芒果 ( Mangifera indica L. ) 的种植面积扩大，尤其是在韩国南部。然而，芒果树过度的营养生长会阻碍生殖生长和果实生产，对温室种植构成挑战。花芽分化过程中赤霉素 (GA) 水平过高会阻碍这一过程，减少开花和结果。这项先导研究调查了已知的 GA 抑制剂多效唑 (PBZ) 和调环酸钙 (Pro-Ca) 对温室条件下生长的芒果树花芽分化和穗发育的影响。设立了两个处理组：PBZ 一次和两次（22.9% 悬浮浓缩液中 1,500 ppm）以及 Pro-Ca 一次和两次（20% 悬浮浓缩液中 500 ppm）。处理于 2022 年 7 月进行，在夏季修剪后枝条变硬后进行，恰逢花芽分化诱导期（2022 年 11 月中旬至 2023 年 1 月中旬）。在此期间，平均温度和平均相对湿度分别为 13.4°C 和 62%。通过七个阶段观察到生殖生长变化。PBZ 一次和两次处理最快达到第 2 阶段（花芽起始），其次是 Pro-Ca 一次和两次，以及对照组，均在四天内完成。值得注意的是，处理和对照之间的结果没有显著差异。关于穗特征，PBZ 两次产生的穗最长，而 Pro-Ca 两次产生的穗最短。然而，所有组的穗宽度保持相似。研究结果表明，PBZ 两次、Pro-Ca 一次和 Pro-Ca 两次处理可有效促进花芽分化并根据生长特性提高穗质量。此外，随后的 GC-MS 分析和热图分析发现，所有样品（包括对照组和处理组）中都存在八种关键代谢物，这些代谢物均与芒果开花反应有关。总体而言，GA 抑制剂在诱导花芽分化方面表现出良好的效果。
来自Ash Yellows Group
“ Cantidatus Phytoplasma Fraxini”的Ashy1菌株起源于伊萨卡（美国纽约，美国纽约），并于白灰（Fraxinus Americana），并被转移到Catharanthus Roseus（5）。使用Dneasy血液和组织试剂盒（Qiagen，Hilden，Germany）制备了由感染的玫瑰花芽芽孢杆菌和叶子材料制备的测序模板。使用SMRTBELL PREP KIT 3.0（美国加利福尼亚州PACBIO）的SMRTBELL PREP KIT 3.0（美国）而没有其他DNA片段化制备了用于单分子实时（SMRT）的高保真库。在Max Planck Genome-Centre（德国科隆）的续集IIE设备（PACBIO）上对片段文库进行了测序，其结合KIT 2.0（PACBIO）和续集II测序套件2.0（PACBIO）。通过使用BLAST+ v2.2.2.9，MetAgenome Analyze（Megan）和一个数据核定的数据，通过BLAST+ v2.2.2.9，MetAgenome Analyze（Megan）v.6.18.2（6.18.2（6.18.2）（6）（6）（6.6.18.2（6）的候选，分类构造分类为“ candidatus phyto plasma”属，其中11,518个读取（5834中的N 50）被分配给“念珠菌Phyto等离子体”属。 GenBank的Tus Phytoplasma”和Catharanthus Roseus（登记：2024年1月）。 使用PACBIO-HIFI选项和估计的基因组大小为600 kb，将其余的读数与CANU v2.2（7）组装在一起。 实现了一个连续的圆形序列，具有67.17倍的覆盖率。 通过爆炸分析确认了> 10 kb的序列重叠。 随后，使用Artemis V18.2.0（8）手动删除序列重叠。 在Rast V2.0（9）中进行了完整染色体的注释，然后在Artemis v18.2.0（8）中进行手动策划，DNAA将DNAA设置为染色体的第一个基因。 未发现质粒。通过BLAST+ v2.2.2.9，MetAgenome Analyze（Megan）v.6.18.2（6.18.2（6.18.2）（6）（6）（6.6.18.2（6）的候选，分类构造分类为“ candidatus phyto plasma”属，其中11,518个读取（5834中的N 50）被分配给“念珠菌Phyto等离子体”属。 GenBank的Tus Phytoplasma”和Catharanthus Roseus（登记：2024年1月）。使用PACBIO-HIFI选项和估计的基因组大小为600 kb，将其余的读数与CANU v2.2（7）组装在一起。实现了一个连续的圆形序列，具有67.17倍的覆盖率。通过爆炸分析确认了> 10 kb的序列重叠。随后，使用Artemis V18.2.0（8）手动删除序列重叠。在Rast V2.0（9）中进行了完整染色体的注释，然后在Artemis v18.2.0（8）中进行手动策划，DNAA将DNAA设置为染色体的第一个基因。未发现质粒。使用BUSCO的151个单拷贝直系同源物（94％）的比较支持了注释的完整性（10）。在染色体组装中未考虑的读数对额外的分类套筒进行了进一步的分类，并筛选了ASHY1的肉体外DNA。默认参数用于所有软件，除非另有说明。