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World File Search System菲什曼
生物学@孟菲斯
助理教授将有望：（1）开发，培育和扩展一项由外部资金支持的动态，高影响力的研究计划，包括与我们本地和地区医疗中心的合作伙伴建立生产性合作，并利用了该系与田纳西大学健康科学中心（Universityee Science Science Center）（UTHSC）的工程的联合BME BME研究生计划的协同合作的机会。（2）在一个充满活力的企业家友好的城市中，从事相关科学和医学学科的创新，这是医疗设备行业的枢纽。（3）教书并为本科和研究生课程做出贡献。（4）有助于研究领域，例如成像，生物力学，生物印刷，增材制造，生物材料/药物递送，植入物，组织/再生医学工程，生物电性，仪器和/或生物传感器技术。（5）为系，大学，大学和专业社区提供服务。
实施机器学习 - 菲尼斯 -
2020年，挪威公共卫生研究所（NIPH）的审查和卫生技术评估集群（HTV）建立了一个专门的机器学习（ML）团队。此后，ML团队已成为将ML整合和实施ML纳入证据综合的国际领导者。ML团队的总体目标是以最能结合人类智能和ML的方式使用ML，通过弄清楚如何在整个审查过程中弄清楚如何最好地整合ML和工作流程变化来增强人类活动。本报告根据团队在2020年成立以来的经验提出了ML 3.0S策略建议。响应我们研究所的不断发展的需求以及与研究所和部门的战略目标保持一致，该提议提倡ML团队提高到2024年及以后的部门水平。这将确保长期可持续性并减轻HTV的财务负担。此外，我们提出了一个重组的组织框架与三个团队：创新和地平线扫描，评估和证据建设，实施和支持，以及指导委员会，以协调活动并参与外部网络。
中性粒细胞中加油动物D的NLRP1依赖性激活控制皮肤利什曼病
1洛桑大学免疫生物学系，瑞士，2岁，WHO免疫研究与培训合作中心，洛桑大学，瑞士大学，瑞士大学，3个媒介分子生物学科，疟疾实验室，疟疾实验室和媒介研究所，摩洛克国立卫生部，玛丽·诺斯特·诺斯特，摩克斯特式，摩洛克，国际研究所。 States of America, 4 Post Graduate Department of Zoology, Barasat Government College, Barasat, West Bengal, India, 5 INSERM, CNRS, Centre D'Immunologie de Marseille-Luminy, Aix-Marseille Universite´, Marseille, France, 6 Department of Molecular Microbiology and Immunology, Keck School of Medicine, University of Southern California, Los Angeles, California, United States of America
稳定表达 Cas9 和 T7 RNA 聚合酶的利什曼原虫 (Viannia) braziliensis 的有效基因组编辑
直到 2015 年，阐明利什曼原虫蛋白质功能的功能丧失研究都依赖于通过同源重组进行基因破坏。随后，CRISPR/Cas9 革命影响到了这些原生动物寄生虫，只需一轮转染即可实现有效的基因组编辑。此外，LeishGEdit 的开发（一种基于 PCR 的工具包，用于使用 CRISPR/Cas9 生成敲除和标记系）使基因组编辑更加直接有效。在此系统中，质粒 pTB007 被递送至利什曼原虫，在 b-微管蛋白基因座中进行游离表达或整合，并稳定表达 T7 RNA 聚合酶和 Cas9。在南美洲，尤其是在巴西，利什曼原虫 (Viannia) braziliensis 是皮肤利什曼病最常见的病原体。与利什曼原虫相比，L. braziliensis b-微管蛋白基因座表现出显著的序列差异，这阻碍了 pTB007 的有效整合和 Cas9 的稳定表达。为了克服这一限制，pTB007 中存在的 L. major b-微管蛋白序列被利什曼原虫 (Viannia) b-微管蛋白保守序列取代，从而产生了 pTB007_Viannia 质粒。这一修改使 pTB007_Viannia 盒式磁带成功整合到 L. braziliensis M2903 基因组中，并且计算机预测表明这也可以在其他 Viannia 物种中实现。通过敲除鞭毛蛋白 PF16 来评估 Cas9 的活性，这导致这些转染子中出现不动表型。内源性PF16也成功被mNeonGreen标记，并采用基因座互补策略将PF16基因的C端标记拷贝返回到原始基因座，从而恢复游泳能力。
利什曼原虫的遗传多样性和基因组可塑性对治疗和寻找新型化疗靶点的影响
利什曼病是拉丁美洲、非洲、亚洲和欧洲的主要公共卫生问题之一。由于缺乏人用疫苗和有效的媒介控制计划，化疗成为控制所有形式该疾病的主要策略。然而，现有药物的高毒性、治疗药物的选择有限以及耐药性寄生虫菌株的出现是与化疗相关的主要挑战。目前，只有少数药物可用于利什曼病治疗，包括五价锑化合物 (SbV)、两性霉素B及其制剂、米替福新、硫酸巴龙霉素和羟乙基磺酸喷他脒。除了药物毒性之外，利什曼病的治疗失败也是一个严重的问题。耐药性寄生虫的出现是治疗失败的原因之一，并且与该属寄生虫的多样性密切相关。由于基因组具有巨大的可塑性，抗药性可以通过改变不同的代谢途径产生，这表明抗药性机制是多因素的，极其复杂。遗传变异和基因组可塑性不仅导致现有药物存在局限性，而且使寻找新药变得具有挑战性。在这里，我们研究了阻碍药物发现的寄生虫的生物学特性。
利什曼原虫的遗传多样性和基因组可塑性对治疗和寻找新型化疗靶点的影响
利什曼病是拉丁美洲、非洲、亚洲和欧洲的主要公共卫生问题之一。由于缺乏人用疫苗和有效的媒介控制计划，化疗成为控制所有形式该疾病的主要策略。然而，现有药物的高毒性、治疗药物的选择有限以及耐药性寄生虫菌株的出现是与化疗相关的主要挑战。目前，只有少数药物可用于利什曼病治疗，包括五价锑化合物 (SbV)、两性霉素B及其制剂、米替福新、硫酸巴龙霉素和羟乙基磺酸喷他脒。除了药物毒性之外，利什曼病的治疗失败也是一个严重的问题。耐药性寄生虫的出现是治疗失败的原因之一，并且与该属寄生虫的多样性密切相关。由于基因组具有巨大的可塑性，抗药性可以通过改变不同的代谢途径产生，这表明抗药性机制是多因素的，极其复杂。遗传变异和基因组可塑性不仅导致现有药物存在局限性，而且使寻找新药变得具有挑战性。在这里，我们研究了阻碍药物发现的寄生虫的生物学特性。
在人畜共患性皮肤利什曼病的流行病区域中的流行病学研究伊朗
这项研究是在1991 - 92年在伊斯法罕市以北的一个乡村地区的Borkhar的12个月内在伊朗伊斯兰共和国中部进行的。目的是确定利什曼病的自然储层宿主的生态，以实现利什曼原虫疫苗的未来现场试验。该地区的主要储层主机是菱形Opimus，Great Gerbil，其次是Meriones Libycus，Libyan Jird和Hemiechinus Auritis，Longeared Hedgehog。在Borkhar地区检查的179个小型哺乳动物中，绝大多数是R. Opimus（82.1％），然后是M. Libycus（15.7％）和最后一h. Auritis（2.2％）。R. opimus的最高感染率为9月（90.5％），在不同村庄的率在22.2％和80.4％之间。M. libycus的平均感染率为17.9％。这些啮齿动物可能是储层宿主在该地区人畜共患病的流行病学中起重要作用。十六只家养犬和流浪狗似乎未感染，因为检查没有活跃的病变或疤痕。
使用 CRISPR/Cas9 胞嘧啶碱基编辑工具箱对利什曼原虫进行基因编辑和可扩展的功能基因组筛选 LeishBASEedit
摘要 CRISPR/Cas9 基因编辑彻底改变了利什曼病的病原体利什曼原虫的功能丧失实验。然而，由于利什曼原虫缺乏功能性非同源 DNA 末端连接途径，因此获得无效突变体通常需要额外的供体 DNA、选择与药物耐药性相关的编辑或耗时的克隆分离。因此，目前无法在不同条件下和多种利什曼原虫物种中进行全基因组功能丧失筛选。在这里，我们报告了一个克服这些限制的 CRISPR/Cas9 胞嘧啶碱基编辑器 (CBE) 工具箱。我们利用利什曼原虫中的 CBE 通过将胞嘧啶转化为胸腺嘧啶来引入终止密码子，并创建了用于动基体中 CBE 引物设计的 http://www.leishbaseedit.net/。通过报告基因检测以及针对 L. mexicana 、 L. major 、 L. donovani 和 L. infantum 中的单拷贝和多拷贝基因，我们展示了该工具如何通过仅表达一个单向导 RNA 来有效生成功能性无效突变体，在非克隆群体中达到高达 100% 的编辑率。然后，我们生成了针对利什曼原虫优化的 CBE，并成功地针对质粒文库传递的 L. mexicana 中的功能丧失筛选中的必需基因。由于我们的方法不需要 DNA 双链断裂、同源重组、供体 DNA 或克隆分离，我们相信这首次使通过质粒文库传递在利什曼原虫中进行功能性遗传筛选成为可能。