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温度影响西尼罗河病毒的演化和适应性
此预印本版的版权持有人于2025年3月3日发布。 https://doi.org/10.1101/2025.02.28.640855 doi：Biorxiv Preprint
使用哨兵血清学数据在15年内重建加勒比海岛上西尼罗河病毒的无声循环
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证可永久提供。是作者/资助者，他已授予Medrxiv的许可证，以显示预印本（未经同行评审证明）的预印本版权持有人的此版本发布于2025年2月8日。 https://doi.org/10.1101/2025.02.07.25321837 doi：medrxiv Preprint
西尼罗河病毒感染期间Culex Tarsalis Midgut的单细胞图集
蚊子中肠作用是病原体和载体之间的关键界面。然而，对中肠生理学和病毒感染动态的研究很少，在Culex tarsalis中，西尼罗河病毒（WNV）极有效的载体（不存在）。我们在CX上进行了单细胞RNA测序。tarsalis midguts，定义了多种细胞类型，并确定了特定的细胞类型是否更允许WNV感染。我们确定了20个细胞状态，其中包括8种不同的细胞类型，与果蝇和伊迪斯伊蚊的现有描述一致。大多数中肠细胞种群允许WNV感染。然而，肠内分泌细胞（EE）中的WNV RNA（VRNA）水平较高，表明该人群的复制增强。相反，增殖的肠干细胞（ISC）的VRNA水平最低，这一发现与表明中肠中ISC增殖的研究一致，参与感染对照。iSC对WNV感染具有强烈的转移反应；在WNV感染的ISC种群中，涉及核糖体结构和纤维基因SIS的基因显着下调。值得注意的是，我们没有检测到明显的WNV感染引起的蚊子抗病毒免疫基因的上调（例如，AGO2，R2D2等）在整个中型水平上。相反，我们观察到了免疫基因表达水平与单个细胞中的VRNA负载之间存在显着的正相关，这表明在中肠细胞中，高水平的VRNA可能会触发抗病毒反应。我们的发现建立了CX。tarsalis midgut细胞地图集，并通过表征细胞类型的特异性增强/限制，并在单细胞水平上介绍对WNV的中肠感染动力学的见解。
西尼罗河病毒在欧洲传播的生物气候建模，特别关注乌克兰
药物发现AI数据集和基准传统上不包括单细胞分析生物标志物。虽然单细胞分析中的基准努力最近发布了单细胞任务的集合，但他们尚未全面释放数据集，模型和基准测试，这些数据集，模型和基准分析以细胞类型的特异性生物标志物进行整体的各种治疗性发现任务。Therapeutics Commons（TDC-2）介绍了将特定于细胞类型的上下文特征与跨治疗剂的ML任务相结合的数据集，工具，模型和基准。我们介绍了单细胞分辨率的上下文学习的四个任务：药物目标提名，遗传扰动反应预测，化学扰动响应预测和蛋白质肽相互作用预测。我们为这四个任务介绍数据集，模型和台上标记。最后，我们详细介绍了驱动TDC-2实施的机器学习和生物学的进步和挑战，以及如何在其体系结构，数据集和基准和基础模型工具中反映它们。
CRISPR屏幕在IPSC衍生的神经元中揭示了tau proteostasis 的原理 人类诱导的多能干细胞的扰动细胞图集 多态串联重复在免疫景观上形状的单细胞基因表达 蛋白质生成进化扩散 注释冷冻卷：机器学习挑战 胎盘猪中的胎盘HIGF1纳米颗粒基因治疗在肝脂质和葡萄糖代谢相关的信号通路中以胎儿性别特异性方式改善胎儿生长限制相关的变化 西尼罗河病毒在欧洲传播的生物气候建模，特别关注乌克兰 单元格中的信号：用于治疗的多模式和上下文化的机器学习基础 SPAMTP：空间代谢组学和转录组学数据的综合统计分析和可视化 使用捕获的离子迁移率和DDAP 通过成对的细胞表面和病毒1 增强了慢病毒基因递送到哺乳动物细胞 坏死性到凋亡信号轴是炎症性肠病的基础 Devider：多种单倍型的长阅读重建 pyr1生物传感器驱动的全基因组CRISPR筛选，用于改善Kluyveromyces Marxianus的单甲苯样产生 果糖-2,6-双磷酸盐恢复TDP-43病理 - bean（psophocarpus tetragonolobus）
蛋白质tau的抽象聚集定义了tauopathies，其中包括阿尔茨海默氏病和额颞痴呆。特定的神经元亚型有选择地容易受到tau聚集的影响，随后的功能障碍和死亡，但潜在的机制尚不清楚。系统地揭示了控制人类神经元中Tau聚集体积累的细胞因子，我们在IPSC衍生的神经元中进行了基于基因组CRISPRI的修饰筛网。屏幕发现了预期的途径，包括自噬，以及意外的途径，包括ufmylation和GPI锚构成。我们发现E3泛素连接酶CUL5 SOCS4是人类神经元中tau水平的有效修饰符，泛素化tau，与小鼠和人类中的auopanty的脆弱性相关。线粒体功能的破坏会促进tau的蛋白酶体错误处理，从而产生tau蛋白水解片段
西尼罗河创新者
参考文献 1. Young A. 西尼罗河病毒。加州大学戴维斯分校兽医学系。2021 年 11 月 19 日。https://ceh.vetmed.ucdavis.edu/health-topics/west-nile-virus。2024 年 8 月 26 日访问。 2. 媒介传播的东部马脑炎和西尼罗河病毒威胁着马和其他哺乳动物，包括人类。密歇根州立大学兽医学院。https://cvm.msu.edu/vdl/client-education/newsletter/summer-2018/vector-borne-eastern-equine-encephalitis-and-west-nile-virus-threaten-horses-and-other-mammals- including-humans#:~:text=Prevalence%20of%20EEE%20a nd%20WNV,in%20the%20number%20equine%20WNV。访问时间：2024 年 8 月 26 日。3. 核心疫苗接种指南。美国马兽医协会网站。http://www.aaep.org/-i-165.html。访问时间：2023 年 8 月。4. Epp T、Waldner C、West K。萨斯喀彻温省马匹接种西尼罗河病毒疫苗的有效性。论文发表于：第 51 届美国马兽医协会会议论文集。2005；180-182。5. Epp T、Waldner C、Townsend HGG。2003 年萨斯喀彻温省西尼罗河病毒临床疾病发展相关因素的病例对照研究。Equine Vet J。2007；39：498-503。6. Davis EG、Zhang Y、Tuttle J 等人。接种灭活西尼罗河病毒疫苗的健康马匹抗原特异性淋巴细胞反应调查。兽医免疫学与免疫病理学。2008；126(3-4)：293-301。7. Davis EG、Bello NM、Bryan AJ 等人。在 90 日龄或 180 日龄开始多价疫苗方案时健康马驹的免疫反应特征。马兽医杂志。2014。doi:10.1111/evj.12350。8. Cortese V、Hankins K、Holland R 等人。西尼罗河病毒血清阴性成熟马对西尼罗河病毒疫苗的血清学反应。马兽医杂志。2013；33：1101-1105。 9. 文件中的数据，截至 2015 年 12 月 31 日 WEST NILE-INNOVATOR 的 MDI 销售数据，Zoetis LLC。
CRISPR/CAS-9在西尼罗河病毒载体culex quinquefasciatus中通过同源性维修介导的敲门
culex quinquefasciatus说是在世界的热带和亚热带地区分布的蚊子。这是一种夜间活性的，机会性的血液源，媒介是许多动物和人类疾病，包括西尼罗河病毒和禽类疟疾。当前向量控制方法（例如物理/化学）越来越无效；杀虫剂的使用还对人类和生态系统健康构成危害。基因组编辑的进步允许开发遗传昆虫控制方法，这些方法是特异性物种特异性的，从理论上讲，非常有效。crispr/cas9是一种细菌衍生的可编程基因编辑工具，可在一系列物种中起作用。我们描述了Quinquefasciatus中同源性修复的第一个成功的种系基因基因概括。使用CRISPR/CAS9，我们将编码荧光蛋白荧光团（HR5/IE1 -DSRED，CQ7SK -SGRNA）编码的SGRNA表达盒和标记基因集成到kynurenine 3 − 3-单核酶（KMO）基因中。我们达到的最小转化率为2.8％，类似于其他蚊子物种的速率。确定了预期基因座的精确敲门in。插入纯合子在早期幼虫中表现出白眼表型，并且通过化合物表现出隐性致命表型。这项工作为工程C. Quinquefasciatus提供了一种有效的方法，为该向量开发遗传控制工具提供了一种新工具。
使用零膨胀模型探索温度和其他环境因素在加利福尼亚县的西尼罗河病毒发生率和预测中的作用
西尼罗河病毒（WNV）是美国最常见的蚊子传播疾病，仅在加利福尼亚州就会导致数百例报告。传输周期主要发生在鸟类和蚊子中，使气象条件（例如温度），对传播特征尤其重要。鉴于由于全球气候变化，温度的未来增长几乎是不可避免的，因此确定人类温度与WNV发生率之间的关联，以及对未来病例的预测，对加利福尼亚州的公共卫生机构来说很重要。使用加利福尼亚公共卫生部（CDPH）的监视数据，国家海洋与大气管理局（NOAA）的气象数据以及VectorsUrv的向量和托管数据，我们创建了GEE自动性自动化和零添加的回归回归，以确定温度和其他环境因素在WNV生病和预期中的作用。发现温度升高与2017 - 2022年之间11个高负荷加州县的发病率升高（IRR = 1.06），保持位置，一年中的时间和降雨常数。在我们的研究期间，假设的华氏2度（到2040年）将导致每年超过20个过量病例。使用2017–2021作为训练集，气象/寄主/矢量数据能够密切预测2022年的发病率，尽管这些模型确实高估了病例的峰值数量。零充气的模型紧密地预测了冬季的病例数量较少，但在高传输期间的表现比GEE模型差。这些发现表明，气候变化将会并且可能已经改变了加利福尼亚州WNV的传输动态和发病率，并提供了帮助预测未来发病率的工具。
糖尿病是严重登革热和西尼罗河热的危险因素：荟萃分析
1病原生物学系，阿纳伊省人畜共努性的主要实验室，安海岛高级机构的关键实验室，基础医学科学学院，安武医科大学，赫菲，赫菲，2中国重庆大学，中国第四个内分泌学系Anhui医科大学，中国Hefei的第一家附属医院，中国5个国家寄生虫病研究所，中国疾病控制与预防疾病中心（中国热带疾病研究中心），国家卫生委员会寄生虫和媒介生物学的关键实验室；谁合作的热带疾病中心；国家国际热带疾病研究中心，上海，中国
诊断西尼罗河病毒问题的专家系统...
摘要：西尼罗河病毒（WNV）是一种蚊子传播的黄病毒，于1937年首次在乌干达西尼罗河区确定。该病毒现在已广泛分布在世界范围内，被认为是一个重大的公共卫生问题。WNV主要通过被感染的蚊子咬伤传播给人类，鸟类是主要的储层宿主。大多数感染了WNV的人不会出现任何症状，但是大约1分之一会发烧，较小的百分比可能会出现更严重的症状，例如脑膜炎或脑炎。没有针对WNV感染的特定治疗方法，预防工作集中于蚊子控制措施和个人保护措施，以避免蚊子叮咬。虽然WNV通常不被认为是对人类健康的主要威胁，但在世界各地散发地发生了疫情，并且必须进行持续的监视和研究以更好地理解和控制病毒。目标：本文将通过正确的诊断和治疗来解决西尼罗河病毒（WNV）的治疗问题。方法：在这项研究中，我们为诊断西尼罗河病毒（WNV）提供了专家系统，该系统将帮助医生探索与西尼罗河病毒（WNV）问题有关的一切。我们期待为西尼罗河病毒（WNV）提供简化的答案。