4. van Boxelaere, M.、Clements, J.、Callaerts, P.、D'Hooge, R. 和 Callaerts-Vegh, Z. 不可预测的慢性轻度压力对两种近交系小鼠的社交和情境辨别学习有不同程度的损害。PLoS One 12, e0188537 (2017)。
大豆是全球种子蛋白和油的主要来源,在种子中平均成分为40%蛋白质和20%的油。这项研究的目的是确定使用种子蛋白和油含量的定量性状基因座(QTL),该蛋白质和油含量利用跨平均蛋白质含量线构建的种群,PI 399084,PI 399084到另一个具有低蛋白质含量值的线,PI 507429,均来自USDA Soybeanbeanbeanebean soybeanbean soybeanbean soybeanbeanbean collection。在四年内,对重复的近交系(RIL)人群,PI 507429 X PI 399084进行了评估(2018-2021);使用近红外反射光谱分析种子的种子蛋白质和油含量。使用测序使用基因分型重新列出了重组近交系和两个父母。总共12,761个分子标记物来自基因分型,通过测序,Soysnp6k Beadchip和来自已知蛋白质QTL染色体区域的选择的简单序列重复(SSR)标记来映射。在2号染色体上鉴定出一个QTL,该QTL解释了种子蛋白含量的56.8%的56.8%,种子油含量最高可达43%。15染色体上鉴定出的另一个QTL解释了种子蛋白质变异的27.2%和种子油含量变化的41%。这项研究的蛋白质和油QTL及其相关分子标记物将在繁殖中有用,以改善大豆的营养质量。
大豆是全球种子蛋白和油的主要来源,在种子中平均成分为40%蛋白质和20%的油。这项研究的目的是确定使用种子蛋白和油含量的定量性状基因座(QTL),该蛋白质和油含量利用跨平均蛋白质含量线构建的种群,PI 399084,PI 399084到另一个具有低蛋白质含量值的线,PI 507429,均来自USDA Soybeanbeanbeanebean soybeanbean soybeanbean soybeanbeanbean collection。在四年内,对重复的近交系(RIL)人群,PI 507429 X PI 399084进行了评估(2018-2021);使用近红外反射光谱分析种子的种子蛋白质和油含量。使用测序使用基因分型重新列出了重组近交系和两个父母。总共12,761个分子标记物来自基因分型,通过测序,Soysnp6k Beadchip和来自已知蛋白质QTL染色体区域的选择的简单序列重复(SSR)标记来映射。在2号染色体上鉴定出一个QTL,该QTL解释了种子蛋白含量的56.8%的56.8%,种子油含量最高可达43%。15染色体上鉴定出的另一个QTL解释了种子蛋白质变异的27.2%和种子油含量变化的41%。这项研究的蛋白质和油QTL及其相关分子标记物将在繁殖中有用,以改善大豆的营养质量。
摘要:电穿孔动物基因敲除系统技术(TAKE)是一种简单有效的方法,利用成簇的规律间隔短回文重复序列(CRISPR)/CRISPR 相关蛋白 9(Cas9)系统生成转基因小鼠。为了增强电穿孔在小鼠基因编辑中的多功能性,针对玻璃化冷冻小鼠胚胎优化了电条件,并将其应用于广泛使用的近交系(C57BL/6NCr、BALB/cCrSlc、FVB/NJcl 和 C3H/HeJJcl)的新鲜胚胎。电脉冲设置(穿孔脉冲:电压,150 V;脉冲宽度,1.0 ms;脉冲间隔,50 ms;脉冲数,+4;转移脉冲:电压,20 V;脉冲宽度,50 ms;脉冲间隔,50 ms;脉冲数,±5)对于玻璃化冷冻加温的小鼠胚胎是最佳的,其可以有效地将 gRNA/Cas9 复合物递送到受精卵中而无需透明带变薄过程并编辑目标位点。这些电条件在广泛使用的近交系小鼠中有效地产生了转基因小鼠。此外,使用间隙为 5 mm 的电极进行电穿孔可以在 5 分钟内引入超过 100 个胚胎,而无需特殊的预处理和复杂的技术技能,例如显微注射,并且在产生的后代中表现出较高的胚胎发育率和基因组编辑效率,从而快速高效地产生基因组编辑小鼠。本研究中使用的电条件用途广泛,可以更轻松高效地生成转基因小鼠,有助于了解人类疾病和基因功能。关键词:CRISPR/Cas9、电穿孔、冻融胚胎、基因组编辑
对近交系的遗传距离和组成的分析是父母选择和利用植物育种计划中的杂种的先决条件。 这项研究旨在评估玉米种质面板的遗传多样性和种群结构,其中包括182个创始人线和866个使用单核苷酸多态性(SNP)标记物衍生的近交系,以识别用于杂化育种的遗传独特系。 用1201个SNP对创始人线进行基因分型,并用1484个SNP进行派生线。 中等遗传变异,遗传多样性范围从0.004至0.44,平均为0.25,为创始人线记录,而派生线的相应值为0.004至0.34,平均值为0.13。 杂合性值范围为0.00至0.24,两条线的平均值为0.08。 使用的SNP标记的,1201个标记中的82%和1484个标记中的84%表现出多态性信息含量,范围为0.25至0.50。 分子方差的分析表明,在创始人和衍生线中种群中的人群中和内部之间存在显着的遗传差异(p 0.001)。 分别归因于创始人和派生线中的种群中最多的变化,即97%和88.38%。 种群结构分析确定了创始人线之间的三个不同的亚群,在衍生线中确定了两个。 所选的线在遗传上是不同的,建议用于标记辅助杂化玉米繁殖以利用有益等位基因的频率。对近交系的遗传距离和组成的分析是父母选择和利用植物育种计划中的杂种的先决条件。这项研究旨在评估玉米种质面板的遗传多样性和种群结构,其中包括182个创始人线和866个使用单核苷酸多态性(SNP)标记物衍生的近交系,以识别用于杂化育种的遗传独特系。用1201个SNP对创始人线进行基因分型,并用1484个SNP进行派生线。中等遗传变异,遗传多样性范围从0.004至0.44,平均为0.25,为创始人线记录,而派生线的相应值为0.004至0.34,平均值为0.13。杂合性值范围为0.00至0.24,两条线的平均值为0.08。,1201个标记中的82%和1484个标记中的84%表现出多态性信息含量,范围为0.25至0.50。分子方差的分析表明,在创始人和衍生线中种群中的人群中和内部之间存在显着的遗传差异(p 0.001)。分别归因于创始人和派生线中的种群中最多的变化,即97%和88.38%。种群结构分析确定了创始人线之间的三个不同的亚群,在衍生线中确定了两个。所选的线在遗传上是不同的,建议用于标记辅助杂化玉米繁殖以利用有益等位基因的频率。Cluster analysis sup- ported the population structure The following genetically distant founder and derived inbred lines were selected: G15NL337 and G15NL312 (Cluster 1), 15ARG152 and RGS-PL44 (Cluster 2), RGS-PL44 and 15ARG149 (Cluster 2), and RGS-PL33 and RGS-PL44 (Cluster 2), 分别。这项研究为玉米育种计划提供了宝贵的见解,实现了有益的等位基因的开发,并通过混合育种为改善农作物产量和粮食安全做出了贡献。
摘要:耕种的花生(Arachis hypogaea L.)是全球重要的油和现金作物。一百个烟和种子的重量是花生产量的重要组成部分。在当前的研究中,为了揭开一百个pod重量(HPW)和百分子重量(HSW)的遗传基础,从JH5(JH5,大豆荚和种子重量和种子重量)之间的十字架开发了一个重组近交系(RIL)人群,并使用M130(小荚和种子重量)(小荚和种子重量),并用来识别QTLS和HPW和HPW。使用SSR,AHTE,SRAP,TRAP和SNP标记构建了一个集成的遗传链接图。该地图由3130个遗传标记组成,分配给20个染色体,并覆盖1998.95 cm,平均距离为0.64 cm。在此基础上,HPW和HSW的31个QTL位于7个染色体上,每个QTL占表型方差的3.7–10.8%(PVE)。其中,在多个环境下检测到了七个QTL,并且在B04和B08上发现了两个主要的QTL。值得注意的是,染色体A08上的QTL热点在2.74 cm的遗传间隔内包含7个QTL,其中包括0.36 MB物理图,包括18个候选基因。Arahy.d52S1Z,Arahy.ibm9rl,Arahy.W18Y25,Arahy.cplc2w和Arahy.14H.14H可能在调节花生荚和种子重量中发挥作用。这些发现可以促进进一步研究培养花生中影响豆荚和种子重量的遗传机制。
胸膜售出是一种全球蘑菇作物,具有营养和药用益处。但是,多种商业特征的遗传基础仍然未知。为了解决这个问题,我们分析了两个代表性品种“ Heuktari”和“ Miso”的定量性状基因座(QTLS),具有明显不同的等位基因。构建了一个具有11个连锁基团的遗传图,其中27个QTL分配给14个特征。QTL中解释的表型变化范围为7.8%至22.0%。分别估计了针头周期和有效齿轮的数量,相对较高的LOD值为6.190和5.485。一些QTL衍生的分子标记物在近交系中显示出选择精度的潜在增强率,尤其是对于帽形状(50%)和帽厚度(30%)。候选基因是从QTL区域推断出的,并使用QRT-PCR验证,特别是对于囊肿和谷胱甘肽途径,与Cap Yellowness有关。这项研究中的分子标记物有望促进Heuktari和Miso系的繁殖,并提供探针以鉴定P中的相关基因。ofteatus。
两栖动物非洲爪蟾是一种功能强大、用途广泛且经济高效的非哺乳动物模型,可用于研究与人类健康相关的当代重要免疫问题,例如免疫的个体发育、自我耐受、伤口愈合、自身免疫、癌症免疫、免疫毒理学以及宿主免疫防御对新出现的病原体的适应。该模型系统具有几个吸引人的特征:外部发育环境不受母体影响,可从生命早期阶段轻松进行实验;免疫系统与哺乳动物的免疫系统非常相似;可获得大规模遗传和基因组资源;无价的主要组织相容性复合体 (MHC) 定义的青蛙近交系;以及有用的工具,例如淋巴肿瘤细胞系、单克隆抗体和 MHC 四聚体。应用于免疫功能的现代反向遗传功能丧失和基因组编辑技术进一步增强了该模型。最后,非洲爪蟾与哺乳动物之间的进化距离使我们能够区分物种特异性适应与免疫系统更保守的特征。在本介绍中,概述了非洲爪蟾在免疫学研究中的优势和特点,以及使用该模型系统的现有工具、资源和方法。
摘要:基于无人机(UAV)的图像已被广泛用于收集时间序列的农艺数据,然后将其纳入植物育种计划中,以增强作物的改善。在本研究中,通过利用航空摄影数据集进行有效的分析,从玉米多样性面板中进行了233种不同的近交系的现场试验,我们开发了机器学习方法,以在地图水平上获得自动化的流苏数。我们既采用了基于对象的逐项计数(CBD)方法,也采用了基于密度的划分(CBR)方法。使用一种图像分割方法,该方法删除了与植物流苏无关的大多数像素,结果表明,基于对象(CBD)检测的准确性有了显着提高,并且在探测器训练有滤过90的图像上,在0.7033上达到0.7033的交叉验证预测准确性(R 2)峰值。使用未经过滤的图像时,CBR方法的准确性最高,平均绝对误差(MAE)为7.99。但是,当使用引导时,在90的阈值中过滤的图像显示出比未经过滤的图像(8.90)更好的MAE(8.65)。这些方法将允许对开花相关性状进行准确的估计,并有助于做出繁殖决定以改善作物。