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摘要 — 基因组分析从根本上始于一个称为读取映射的过程，其中将生物体基因组的测序片段与参考基因组进行比较。读取映射目前是整个基因组分析流程的主要瓶颈，因为最先进的基因组测序技术能够比用于分析基因组的计算技术更快地对基因组进行测序。我们描述了显著提高读取映射性能的持续历程。我们解释了最先进的算法方法和基于硬件的加速方法。算法方法利用基因组的结构以及底层硬件的结构。基于硬件的加速方法利用专门的微架构或各种执行范例（例如，在内存内部或附近处理）。我们最后指出了采用这些硬件加速读取映射器的挑战。
加速基因组分析：持续发展之路的入门指南
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