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人参基因组：DNA 测序的新视角
下一代 DNA 测序的最新进展导致发现了人参的新基因型，彻底改变了我们鉴定和了解这种具有重要药用价值的植物的方式。西蒙弗雷泽大学的研究人员 Christopher Oberc 博士和 Paul Li 博士利用先进的技术揭示了这些基因型，标志着该领域的重大飞跃 […]
来源:科学特色系列新一代 DNA 测序技术的最新进展促成了人参新基因型的发现，彻底改变了我们鉴定和了解这种具有重要药用价值的植物的方式。西蒙弗雷泽大学的研究人员 Christopher Oberc 博士和 Paul Li 博士利用先进的技术发现了这些基因型，标志着植物遗传学领域的重大飞跃。他们的研究结果发表在 Heliyon 上，详细介绍了这项开创性工作的方法和意义。
人参和西洋参，俗称中国/韩国人参和美国/加拿大人参，是人参属中的两个主要物种。尽管它们在形态上存在差异，但当它们被加工成切片或粉末等商业产品时，区分这些物种就变得很困难。因此，克服这些局限性的基因鉴定已成为一种关键工具。
在他们的研究中，Oberc 博士和 Li 博士采用了新一代测序 (NGS) 分析了 14 种不同形式的人参样本。这种方法使他们能够从每个样本中获得数百万个 DNA 读数。使用 Burrows-Wheeler 比对器 (BWA) 和基于 Python 的聚类分析，他们在样本中确定了一种新的基因型。两个样本被确定为真品，而其他样本则显示出杂交特征，揭示了这些植物复杂的遗传性质。
“新一代测序提供了一个强大的平台，可以发现简单的点突变以外的遗传变异，”Li 博士说。该团队应用了一种名为高斯混合聚类的机器学习算法来分析测序数据，这使他们能够将人参样本分为不同的基因型。这项研究揭示了一种以前未报告的基因型，为我们了解人参物种的遗传多样性增加了一个新的层次。