以前所未有的方式粉碎 ChIP

一把任性的实验室椅子以一个脚步声结束了 Elinne Becket 三天的工作。

来源:The Scientist

作为南加州大学 Peter Jones 实验室的博士后研究员,我研究了肾细胞癌肿瘤中的 DNA 甲基化和核小体定位。在我的项目中,我收集了捐赠的患者肿瘤样本,并使用染色质免疫沉淀 (ChIP) 研究其组蛋白模式的变化。当时正值 ChIP 的早期,因此没有适用于我的样本的试剂盒,我们的实验室内方案大约需要三天半才能完成。

Peter Jones 染色质免疫沉淀

Elinne Becket,目前是加州州立大学圣马科斯分校的微生物基因组学家,讲述了她在博士后研究员期间犯下的惨痛错误。

Ciara Sanders

有一天,当我完成这个过程的最后一次洗脱时,我掉了一个样本。当我低头看到盖子保持关闭状态时,我松了一口气。我开始走下台阶去捡起试管。不幸的是,我们用的椅子轻轻一碰就会滚落。当我转移重心时,椅子向后滚,我的脚正好踩在样本上。

我吓坏了。幸运的是,我计划进行额外的重复实验,因此没有毁掉整个实验。然而,我很生自己的气,因为浪费了如此宝贵的样本,以至于有人好心地让我们在研究中使用它。我不记得我的导师对这个消息作何反应,但我记得我的实验室同事嘲笑了我几个星期,直到其中一个犯了错误,嘲讽转移到了新的目标上。

每当想起那件事,我还是会感到畏缩。然而,它很好地提醒了我自己,现在也提醒了我的学生,错误是难免的,但稳定的实验室操作和准备工作可以防止大多数错误发生。更重要的是,我从错误中吸取教训,这样错误只会发生一次。

本次采访已编辑,以便篇幅和清晰度。

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