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表观遗传脑部扫描
低分辨率空间表观基因组学方法为传统单细胞方法提供了一种经济有效的替代方案。
来源:The Scientist如果说基因组是一本说明书，那么组成表观基因组的化学修饰就像荧光笔和便签。每个表观遗传标记都会告诉细胞阅读手册的哪些部分以发挥其功能。在像大脑这样复杂的器官中，成千上万种细胞类型被精心组织成具有基本功能的复杂神经结构，这些表观遗传标记的空间模式很重要。这些模式的改变可能是疾病的征兆。
I新技术可以以接近单细胞的分辨率测量大脑中组蛋白和 DNA 上的表观遗传标记。1,2 然而，这些工具对于实验室来说可能很昂贵，尤其是在研究大量患者和对照组的疾病时。
新技术 接近单细胞分辨率 1,2“由于成本和劳动力，单细胞方法并不实用，”弗吉尼亚理工大学的化学工程师 Chang Lu 说。 “我们认为必须有一种更低成本、更简单的方法来实现这一目标。”
Chang Lu为了解决这个问题，Lu 的团队想出了另一种方法，通过解剖薄片并运行成本较低的批量表观基因组学方法来扫描大脑中表观遗传标记的空间模式。3 这样一来，他们就无需从头到尾阅读数百万本细胞说明书，而是只需阅读书架上所有手册的一份摘要即可。他们在《Cell Reports Methods》上发表了他们的研究成果，并将该方法称为表观基因组断层扫描，其灵感来自之前发表的 RNA 断层扫描方法，该方法本身引用了通过迭代切片对大型物体进行成像的方法系列。4
替代方法 3 Cell Reports Methods RNA 断层扫描 4继续阅读下文...
MOWChIP-seq , 5 Marc Beyer继续阅读下文...
Gonçalo Castelo-Branco