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Grammostola Actaeon的五种RNA提取方案的效率(Pocock,1903年)
五种RNA提取方案的效率(Pocock,1903年)的小旋转链组织样品样品样品abtlessabtrostystystystystystystystystystysty在非模型蛛网膜中的RNA提取方案对于基因表达研究是必不可少的,包括基因表达研究,包括转录组测序和分析。新热带狼蛛语法化的Actaeon(Pocock,1903年)(家族疗法科)的旋转链植物用于评估两种RNA提取试剂的性能和三个商业可用的试剂盒,以将总RNA与小型真核组织样品中分离出来。使用两个样品从微旋转组织中提取总RNA。我们使用了市售的试剂Trizol和Nucleozol,RNA提取试剂盒和核素蛋白XS(Macherey Nagel)和总RNA纯化试剂盒(Norgen Biotek Corp)。使用Qubit进行定量表明,Nucleospin,Norgen和Nucleospin XS分别产生最高的RNA产量,而纳米体分析以降序排名Norgen,Trizol,Nucleospin,Nucleospin XS。生物分析仪的分析表明,核世基因和核素素XS为我们的样品带来了最佳结果。尽管每种方法成功地产生了足够的RNA来进行RNA-Seq实验,但方法之间RNA质量的变化表明其对特定应用的适用性差异。我们的数据提供了进一步的证据,表明G. actaeon中基于RNA的完整性数(RIN)评估可能不可靠地评估应有的RNA质量五种RNA提取方案的效率(Pocock,1903年)的小旋转链组织样品样品样品abtlessabtrostystystystystystystystystystysty在非模型蛛网膜中的RNA提取方案对于基因表达研究是必不可少的,包括基因表达研究,包括转录组测序和分析。新热带狼蛛语法化的Actaeon(Pocock,1903年)(家族疗法科)的旋转链植物用于评估两种RNA提取试剂的性能和三个商业可用的试剂盒,以将总RNA与小型真核组织样品中分离出来。使用两个样品从微旋转组织中提取总RNA。我们使用了市售的试剂Trizol和Nucleozol,RNA提取试剂盒和核素蛋白XS(Macherey Nagel)和总RNA纯化试剂盒(Norgen Biotek Corp)。使用Qubit进行定量表明,Nucleospin,Norgen和Nucleospin XS分别产生最高的RNA产量,而纳米体分析以降序排名Norgen,Trizol,Nucleospin,Nucleospin XS。生物分析仪的分析表明,核世基因和核素素XS为我们的样品带来了最佳结果。尽管每种方法成功地产生了足够的RNA来进行RNA-Seq实验,但方法之间RNA质量的变化表明其对特定应用的适用性差异。我们的数据提供了进一步的证据,表明G. actaeon中基于RNA的完整性数(RIN)评估可能不可靠地评估应有的RNA质量
来源:ArácnidoGrammostola Actaeon的五种RNA提取方案的效率(Pocock,1903年)
摘要
在非模型蛛网膜中的RNA提取方案的全身优化对于基因表达研究(包括转录组测序和分析)是必不可少的。新热带狼蛛语法化的Actaeon(Pocock,1903年)(家族疗法科)的旋转链植物用于评估两种RNA提取试剂的性能和三个商业可用的试剂盒,以将总RNA与小型真核组织样品中分离出来。使用两个样品从微旋转组织中提取总RNA。我们使用了市售的试剂Trizol和Nucleozol,RNA提取试剂盒和核素蛋白XS(Macherey Nagel)和总RNA纯化试剂盒(Norgen Biotek Corp)。使用Qubit进行定量表明,Nucleospin,Norgen和Nucleospin XS分别产生最高的RNA产量,而纳米体分析以降序排名Norgen,Trizol,Nucleospin,Nucleospin XS。生物分析仪的分析表明,核世基因和核素素XS为我们的样品带来了最佳结果。尽管每种方法成功地产生了足够的RNA来进行RNA-Seq实验,但方法之间RNA质量的变化表明其对特定应用的适用性差异。我们的数据提供了进一步的证据,表明G. actaeon中基于RNA的完整性数(RIN)的评估可能不可靠,可以评估由于节肢动物中“间隙缺失”现象的广泛出现而导致的RNA质量。来自28S rRNA的物种的RNA崩溃可以产生高质量的转录组,这表明当前基于RIN的评估可能对评估许多非模型无脊椎动物的RNA质量可能不可靠。总体而言,在选择最合适的RNA提取方法进行基因表达分析时,应考虑市售RNA提取试剂/试剂盒的结果差异。
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