使用 FFPE 样本改进 RNA 测序

样本通常以降解 RNA 的方式保存。科学家正在设计新方法来克服 RNA 测序的这一障碍。

来源:The Scientist

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用FFPE样品改进RNA测序

样品通常以降解RNA的方式存储。科学家正在设计新的方法来克服RNA测序的这一障碍。

Twist RNA外显子群检测到更多的目标,读取较少。

Twist RNA外显子组以较少的读数检测到更多目标。

扭曲生物科学

RNA测序(RNA-SEQ)是寻求分子生物学家寻求驱动疾病机制的分子生物学家的强大工具。1RNA-SEQ通常用于疾病中的研究和临床应用,这些疾病和临床应用具有高水平的遗传动力学和异质性,例如癌症。但是,尽管RNA-SEQ的进一步有效,但它可以防止RNA-Seq的行为能够获得技术,并且可以通过技术来访问,它可以通过技术来实现。他们需要的高质量数据。

强大的工具 1 例如癌症 2

RNA比化学,物理或酶促的DNA更容易受到降解。使此事复杂化,进行疾病研究的科学家依赖于临床组织样本作为RNA来源。这些样品通常是福尔马林固定和石蜡包裹的(FFPE),该过程可在长期进行免疫组织化学分析的长期保留样品完整性,但可能导致高度降解的RNA。2

高度降解的RNA

科学家正在设计FFPE样品限制的RNA库制备协议,试剂和套件以去除此瓶颈。例如,Twist Bioscience提供了一个快速的库准备套件,旨在与FFPE和其他低输入样品一起使用,从头到尾才需要4.5小时才能完成。套件协议包括用于去除核糖体和环球蛋白RNA的可选耗竭步骤,仅留下Messenger RNA。它还在第二链合成过程中掺入了DUTP核苷酸,从而使科学家可以追踪放大序列回到起源链。

快速图书馆准备套件

更多地了解使用FFPE样品最大化RNA测序的可用解决方案。