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对毒液发现全球毒液的计算探索,毒液人工智能
用毒物学人工智能探索全球毒液发现的全球毒液,抗生素耐药病原体的兴起,尤其是革兰氏阴性细菌,突显了对新型疗法的迫切需求。现在,抗药性感染每年大约有500万人死亡,但传统的抗生素发现却大大停滞不前。毒液形成具有抗菌潜力的生物活性分子的巨大且未开发的储层。在这项研究中,我们挖掘了全球毒液数据集,以识别新的抗菌候选者。使用深度学习,我们探索了16,123种毒素,产生了40,626,260个毒液加密的肽。从这些中,我们确定了386名在结构和功能上与已知抗菌肽不同的候选者。它们表现出高净电荷和疏水性升高,有利于细菌膜破坏的特征。结构研究表明,这些肽中的许多采用柔性构象,这些肽在模拟膜的环境中过渡到α-螺旋构象,从而支持其抗菌潜力。在选择实验验证的58种肽中,有53个显示有效的抗菌活性。机械测定法表明它们主要通过细菌 - 膜去极化发挥作用,从而反映了类似AMP的机制。在鲍曼尼杆菌感染的鼠模型中,铅肽显着减轻了细菌负担
来源:Arácnido抗生素耐药病原体的兴起,尤其是革兰氏阴性细菌,突出了对新型治疗剂的迫切需求。现在,抗药性感染每年大约有500万人死亡,但传统的抗生素发现却大大停滞不前。毒液形成具有抗菌潜力的生物活性分子的巨大且未开发的储层。在这项研究中,我们挖掘了全球毒液数据集,以识别新的抗菌候选者。使用深度学习,我们探索了16,123种毒素,产生了40,626,260个毒液加密的肽。从这些中,我们确定了386名在结构和功能上与已知抗菌肽不同的候选者。它们表现出高净电荷和疏水性升高,有利于细菌膜破坏的特征。结构研究表明,这些肽中的许多采用柔性构象,这些肽在模拟膜的环境中过渡到α-螺旋构象,从而支持其抗菌潜力。在选择实验验证的58种肽中,有53个显示有效的抗菌活性。机械测定法表明它们主要通过细菌 - 膜去极化发挥作用,从而反映了类似AMP的机制。在鲍曼尼杆菌感染的鼠模型中,铅肽可显着减轻细菌负担,而无需观察到毒性。我们的发现表明,毒液是先前隐藏的抗微生物支架的丰富来源,并且将大规模计算挖掘与实验验证相结合可以加速急需的抗生素。
baumannii acinetobacterGuan,C。,Torres,M.D.T.,Li,S。等。 使用毒液人工智能的抗菌发现全球毒液的计算探索。 Nat Commun 16,6446(2025)。 https://doi.org/10.1038/s41467-025-60051-6 Guan,C.,Torres,M.D.T.,Li,S。 等。 nat Commun 16
Guan,C。,Torres,M.D.T.,Li,S。等。 使用毒液人工智能的抗菌发现全球毒液的计算探索。 Nat Commun 16,6446(2025)。 https://doi.org/10.1038/s41467-025-60051-6 Guan,C.,Torres,M.D.T.,Li,S。 等。 nat Commun 16 Guan,C.,Torres,M.D.T.,Li,S。 等。nat Commun16