AI模型将蛋白质中的代码解释为告诉他们去哪里

Whitehead Institute和Csail研究人员创建了一个机器学习模型,以预测和生成蛋白质定位,对理解和纠正疾病产生影响。

来源:MIT新闻 - 人工智能

蛋白质是使我们的细胞运行的工作主场,并且我们的细胞中有数千种类型的蛋白质,每种蛋白质都执行专门功能。长期以来,研究人员知道蛋白质的结构决定了它可以做什么。最近,研究人员开始意识到蛋白质的定位对其功能也至关重要。细胞充满了有助于组织其许多居民的隔室。这些空间还与装饰生物学教科书页面的众所周知的细胞器一起,还包括各种动态的无膜隔室,这些隔室将某些分子集中在一起以执行共享功能。因此,知道给定蛋白质的定位及其与谁共定位,可以更好地理解蛋白质及其在健康或患病细胞中的作用,但是研究人员缺乏一种系统的预测该信息的系统方法。

同时,已经研究了半个世纪以上的蛋白质结构,最终是在人工智能工具中,可以从蛋白质的氨基酸代码中预测蛋白质结构,这是其中的线性构建块,其中折叠起来可以创建以创建的蛋白质块它的结构。 Alphafold和类似模型已成为研究中广泛使用的工具。

2月6日在《科学》杂志上 科学

“我的希望是,这是迈向强大平台的第一步,使人们能够研究蛋白质进行研究,”扬说,“这有助于我们了解人类如何发展成他们的复杂生物,如何发展突变破坏了这些自然过程,以及如何产生治疗假设和设计药物以治疗细胞中功能障碍。”

研究人员还通过细胞中的实验测试验证了许多模型的预测。

开发模型

研究人员希望其他人开始使用蛋白质,就像他们使用Alphafold(例如Alphafold)一样,推进蛋白质功能,功能障碍和疾病的各种项目。