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AI 工具精确绘制细胞代谢
了解细胞代谢很复杂，但 RENAISSANCE 使用 AI 简化了它，为研究和生物技术提供了准确的动力学建模。文章《AI 工具精确绘制细胞代谢图》首次出现在《科学探究者》上。
来源:Scientific Inquirer了解细胞如何处理营养和产生能量（统称为代谢）在生物学中至关重要。但是，分析细胞过程的大量数据以确定代谢状态是一项复杂的任务。
现代生物学在各种细胞活动上生成了大型数据集。这些“ OMICS”数据集为不同的细胞功能（例如基因活性和蛋白质水平）提供了见解。但是，整合并理解这些数据集以了解细胞代谢是具有挑战性的。
动力学模型通过提供细胞代谢的数学表示来解码这种复杂性。它们充当详细的地图，描述了分子在细胞内如何相互作用和转化，描绘了物质如何随着时间的推移转化为能量和其他产物。这有助于科学家了解基于细胞代谢的生化过程。尽管它们具有潜力，但由于难以确定控制细胞过程的参数，因此开发动力学模型是具有挑战性的。
由Ljubisa Miskovic和EPFL的Vassily Hatzimanikatis领导的一组研究人员现在创建了Renaissance，这是一种基于AI的工具，可简化动力学模型的创建。文艺复兴时期结合了各种类型的细胞数据，以准确描述代谢状态，从而更容易理解细胞的功能。文艺复兴时期是计算生物学方面的重大进步，开辟了有关健康和生物技术创新的新途径。
研究人员使用复兴来创建动力学模型，以准确反映大肠杆菌的代谢行为。该工具成功地生成了与实验观察到的代谢行为相匹配的模型，并模拟了细菌如何在生物反应器中随着时间的推移调整其代谢。
大肠杆菌的处理…
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