来自超保守元件 (UCE) 的 Palmimanus capensis Simon, 1893(Araneae,Palpimanidae)线粒体基因组

来自超保守元件 (UCE) 的 Palmimanus capensis Simon, 1893(Araneae,Palpimanidae)线粒体基因组摘要已从超保守元件 (UCE) 中对 Palmimanus capensis Simon, 1893 的线粒体基因组进行了测序和注释。该物种是南非特有的物种,是自由生活的地面居民。重叠群在 SPAdes 中组装,从所得重叠群中提取了粗略的有丝分裂基因组草稿,该草稿被用作 NOVOPlasty 从头组装的种子,以获得最终的环化基因组。使用 MITOS2 并通过将其与蜘蛛目的其他物种进行比较来注释线粒体基因组。线粒体基因组为 14,268 bp,包括 22 个转移 RNA (tRNA)、13 个蛋白质编码基因 (PCG)、2 ​​个核糖体 RNA (rRNA) 基因和一个控制区。这是触手足属和触手科科中第一个具有线粒体基因组测序和注释的物种。Merrill, C. M.、Patrick, L. B.、Wood, H. M. 和 Santos, S. R. (2025)。来自超保守元件 (UCE) 的 Palmimanus capensis Simon, 1893(Araneae,Palpimanidae)的线粒体基因组。线粒体 DNA B 部分,10(12), 1221–1225。 https://doi.org/10.1080/23802359.2025.2594315

来源:Arácnido

来自超保守元件 (UCE) 的 Palmimanus capensis Simon, 1893(Araneae,Palpimanidae)线粒体基因组

摘要

Palmimanus capensis Simon, 1893 的线粒体基因组已根据超保守元件 (UCE) 进行了测序和注释。该物种是南非特有的物种,是自由生活的地面居民。重叠群在 SPAdes 中组装,从所得重叠群中提取了粗略的有丝分裂基因组草稿,该草稿被用作 NOVOPlasty 从头组装的种子,用于最终的环化基因组。使用 MITOS2 并通过将其与蜘蛛目的其他物种进行比较来注释线粒体基因组。线粒体基因组为 14,268bp,包括 22 个转移 RNA (tRNA)、13 个蛋白质编码基因 (PCG)、2 ​​个核糖体 RNA (rRNA) 基因和一个控制区。这是帕尔皮马努斯属和帕尔皮马尼达科中第一个具有线粒体基因组测序和注释的物种。

帕尔皮马努斯 capensis 从头开始 帕尔皮马努斯

Merrill, C. M.、Patrick, L. B.、Wood, H. M. 和 Santos, S. R. (2025)。来自超保守元件 (UCE) 的 Palmimanus capensis Simon, 1893(Araneae,Palpimanidae)的线粒体基因组。 线粒体 DNA B 部分,10(12), 1221–1225。 https://doi.org/10.1080/23802359.2025.2594315

Merrill, C. M.、Patrick, L. B.、Wood, H. M. 和 Santos, S. R. (2025)。线粒体基因组 Simon, 1893(Araneae,Palpimanidae)来自超保守元素(UCE)。 线粒体 DNA B 部分 , 10 (12), 1221–1225。 https://doi.org/10.1080/23802359.2025.2594315 https://doi.org/10.1080/23802359.2025.2594315