详细内容或原文请订阅后点击阅览
亚马逊三种鞭蜘蛛（蛛形纲、钝尾蛛）的新线粒体基因组及其系统发育关系和比较分析
亚马逊地区三种鞭蜘蛛（蛛形纲、Amblypygi）的新线粒体基因组及其系统发育关系和比较分析摘要对鞭蜘蛛 Charinus carajas、C. ferreus 和 Heterophrynus longicornis 的完整线粒体基因组进行了测序、注释，并与其他鞭蜘蛛和蛛形纲动物的线粒体基因组进行了比较。这三种新的线粒体基因组具有后生动物中常见的 37 个基因：13 个蛋白质编码基因 (PCG)、22 个转移 RNA (tRNA) 和两个核糖体 RNA (rRNA)，以及一个非编码控制区 (CR)。大多数 PCG 都呈现 ATN 起始密码子，但两种 Charinus 物种的 cox1 除外，其以 TTA 开头。大多数 PCG 以终止密码子 TAA 或 TAG 结束，但 C. carajas 的 nad5 和 H. longicornis 的 cox3 除外，它们呈现不完整的终止密码子 (T)。所有 PCG 的 Ka/Ks 比率均小于 1，表明这些基因处于纯化选择之下。除丝氨酸 1 (trnS1) 外，所有 tRNA 均具有典型的三叶草形二级结构。所有系统发育分析都将 Charinus carajas 和 C. ferreus 解析为单系群。尽管如此，我们并没有恢复 Heterophrynus longicornis 的单系性。分区模型下的系统发育学没有将超属分类群恢复为进化枝，但 CAT 无限混合模型下的贝叶斯推断将 Phrynidae 科和 Phrynoidea 超科恢复为单系群。Nogueira, A.F., Pires, E.S., Oliveira, G. et al. New mit
来源:Arácnido对鞭子蜘蛛Charinus carajas，c。ferreus和Heterophrynus longicornis的完整线粒体基因组进行了测序，注释并与其他鞭子蜘蛛和蛛网膜的其他有丝分裂基因组相比。这三个新的有丝分裂组具有通常在后生动物中观察到的37个基因：13个蛋白质编码基因（PCGS），22个转移RNA（TRNA）和两个核糖体RNA（RRNA），以及非编码控制区（CR）。大多数PCG都呈现一个ATN起始密码子，但在这两种Charinus物种中除了COX1外，都使用TTA启动。大多数PCG用终止密码子TAA或TAG终止，除了C. carajas的NAD5和H. longicornis的Cox3外，它们呈现出不完整的终止密码子（T）。对于所有PCG，KA/KS的比率均小于一个，表明这些基因的纯化选择不足。除丝氨酸1（TRNS1）外，所有TRNA都具有典型的三叶草形二级结构。所有系统发育分析均作为单系组解决了Carainus Carajas和C. ferreus。尽管如此，我们并未恢复异源性朗西尼的单一单体。分区模型下的系统发育并未恢复上型分类群作为进化枝，但是在猫无限混合物模型下的贝叶斯推论恢复了phrynidae家族和超家族phrynoidea作为单属群体。
Charinus Carajas c ferreus Heterophrynus longicornis Cox1 Charinus nad5 C. Carajas COX3 H. longicornis trns1 Nogueira，A.F.，Pires，E.S。，Oliveira，G。等。 来自亚马逊（Arachnida，Amblypygi）的三种鞭子蜘蛛种的新线粒体基因组具有系统发育关系和比较分析。 SCI REP 14，26271（2024）。 https://doi.org/10.1038/s41598-024-77525-0 Nogueira，A.F.，Pires，E.S。，Oliveira，G。 等。 来自亚马逊（Arachnida，Amblypygi）的三种鞭子蜘蛛种的新线粒体基因组具有系统发育关系和比较分析。 Sci Rep 14 ，26271（2024）。 https://doi.org/10.1038/s41598-024-77525-0 https://doi.org/10.1038/s41598-024-77525-0 COX3 H. longicornistrns1
Nogueira，A.F.，Pires，E.S。，Oliveira，G。等。 来自亚马逊（Arachnida，Amblypygi）的三种鞭子蜘蛛种的新线粒体基因组具有系统发育关系和比较分析。 SCI REP 14，26271（2024）。 https://doi.org/10.1038/s41598-024-77525-0 Nogueira，A.F.，Pires，E.S。，Oliveira，G。 等。 来自亚马逊（Arachnida，Amblypygi）的三种鞭子蜘蛛种的新线粒体基因组具有系统发育关系和比较分析。 Sci Rep 14 ，26271（2024）。 https://doi.org/10.1038/s41598-024-77525-0 https://doi.org/10.1038/s41598-024-77525-0 Nogueira，A.F.，Pires，E.S。，Oliveira，G。等。 来自亚马逊（Arachnida，Amblypygi）的三种鞭子蜘蛛种的新线粒体基因组具有系统发育关系和比较分析。 SCI REP 14，26271（2024）。 https://doi.org/10.1038/s41598-024-77525-0 Nogueira，A.F.，Pires，E.S。，Oliveira，G。 等。 来自亚马逊（Arachnida，Amblypygi）的三种鞭子蜘蛛种的新线粒体基因组具有系统发育关系和比较分析。 Sci Rep 14，26271（2024）。 https://doi.org/10.1038/s41598-024-77525-0https://doi.org/10.1038/s41598-024-77525-0https://doi.org/10.1038/s41598-024-77525-0