生长室可以实现跨大陆可重复的植物微生物数据

利用人工智能的力量来研究植物微生物组(生活在植物内部和周围的微生物群落)可以帮助改善土壤健康、提高作物产量并恢复退化的土地。但有一个问题:人工智能需要大量可靠的数据来学习,而这种关于植物与微生物相互作用的一致信息很难获得。

来源:英国物理学家网首页

利用人工智能的力量来研究植物微生物组(生活在植物内部和周围的微生物群落)可以帮助改善土壤健康、提高作物产量并恢复退化的土地。但有一个问题:人工智能需要大量可靠的数据来学习,而这种关于植物与微生物相互作用的一致信息很难获得。

在 PLOS Biology 发表的一篇新论文中,劳伦斯伯克利国家实验室(伯克利实验室)生物科学领域的研究人员领导了一个国际科学家联盟,研究名为 EcoFAB 的小型塑料生长室是否有助于解决这一问题。

在之前对无微生物植物的研究基础上,科学家们使用伯克利实验室开发的设备在三大洲的实验室中进行了相同的植物-微生物实验,并得到了匹配的结果。这一突破表明,EcoFAB 可以消除微生物组研究中最大的障碍之一:在不同地方重复实验的困难。

“我们都知道‘坏数据输入,坏数据输出’这句话,”该论文的第一作者、伯克利实验室环境基因组学和系统生物学 (EGSB) 部门的研究科学家 Vlastimil Novak 说。 “如果你想对微生物和植物做出有意义的预测,特别是对于未来的人工智能模型,你需要干净、一致的数据集。EcoFAB 恰恰可以满足这一点。”

研究合著者 John Vogel 是联合基因组研究所 (JGI) 植物功能基因组学小组的负责人,他补充说,这项工作建立在对模型草的多年投资的基础上。 JGI 是位于伯克利实验室的美国能源部科学办公室国家用户设施。

“这个项目利用 JGI 为 Brachypodium 开发的资源来创建一个系统,我们可以在其中控制微生物组、环境,甚至植物的遗传学,”Vogel 说。 “这使其成为可重复的综合科学的强大平台。”

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