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使用 Python 和 RING 服务器创建 3D 蛋白质结构网络：第 2 部分
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来源:走向数据科学使用Python和Ring Server创建3D蛋白质结构网络：第2部分
使用环形触点网络创建3D PSN
a在第1部分中承诺，本文将提供一个python脚本，用于处理残基相互作用网络生成器（ring）作为输出生成的.json文本文件，然后使用Plotly将数据绘制为3D蛋白结构网络（PSN）。在第1部分中，我们详细描述了下面所示的工作流程图，以使用Python脚本生成3D PSN来处理RING生成的JSON文件。由于第2部分中的大部分代码在结构上与第1部分相似，因此读者应该对简单地将代码复制并粘贴到.py文件并运行脚本的情况下感到有信心 - 非常简单。可以使用第1部分中描述的步骤生成此处显示的JSON文件，也可以从Github下载文本文件。由于本文在短方面，我将更详细地详细介绍该代码正在做什么。首先，从第1部分中回想一下，此故事中引用的.json联系网络文件是在下面的管道图中生成的：
a 第1部分 戒指 plotly github.json