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发现新的非逆转录病毒内源性病毒元素揭示了它们与蜘蛛的长期共同进化
发现新的非逆转录病毒内源性病毒元件揭示其与蜘蛛的长期共同进化摘要内源性病毒元件 (EVE) 广泛存在于各种生物的基因组中，并在进化中发挥着至关重要的作用。从历史上看，对 EVE 的研究主要集中在源自逆转录病毒的 EVE 上；然而，非逆转录病毒 EVE (nrEVE) 的重要性已逐渐得到认可。在本研究中，我们采用了一种结合蛋白质结构预测和序列分析的新方法来识别蜘蛛基因组中一大群以前未被认识的 nrEVE。此外，我们在蜘蛛中发现了与 nrEVE 相关的信使 RNA、microRNA 和 PIWI 相互作用 RNA，这表明这些 nrEVE 可能具有功能活性。我们还通过实验证实了蜘蛛 nrEVE 及其转录本在单个蜘蛛中的存在。进化分析表明，这些蜘蛛 nrEVE 起源于大约 2.7 亿年前的祖先核节肢动物大 DNA 病毒 (NALDV)，该病毒属于 Lefavirales 目、Naldaviricetes 纲。这些 nrEVE 的整合发生在蜘蛛目最后的共同祖先之前，表明这些 nrEVE 与蜘蛛之间存在长期的共同进化关系。我们的研究结果揭示了一组新的 nrEVE，并为它们与节肢动物的进化关系提供了宝贵的见解。Manli Wang、Hengrui Hu、Just Vlak 等人发现新的非逆转录病毒内源性
来源:Arácnido内源性病毒元素（EVE）在各种生物的基因组中广泛存在，并且在进化中起着至关重要的作用。从历史上看，对EVES的研究主要集中在逆转录病毒中。但是，非返回病毒eves（NREVE）的重要性逐渐获得了认可。在这项研究中，我们采用了一种新颖的方法，将蛋白质结构预测与序列分析相结合，以识别跨蜘蛛基因组的大量先前未识别的Nreves。此外，我们确定了与NREVE相关的Messenger RNA，microRNA和PIWI相互作用RNA中的RNA，这表明这些Nreves可能在功能上有效。我们还通过实验证实了蜘蛛NREVES及其在单个蜘蛛中的转录本。进化分析表明，这些蜘蛛Nreves起源于大约2.7亿年前的Naldaviricetes级的祖先核节肢动物大型DNA病毒（NALDV）。这些Nreves的整合发生在Araneae的最后一个共同祖先之前，表明这些Nreves与蜘蛛之间存在长期的共同进化关系。我们的发现揭示了一群新型的Nreves，并为他们与节肢动物的进化关系提供了宝贵的见解。
lefavirales naldaviricetesManli Wang，Hengrui Hu，Just Vlak等。新型非报告中内源性病毒元件的发现揭示了它们与蜘蛛的长期共同进化，2024年10月15日，Preprint（版本1），可在研究方面[https://doi.org/10.21203/rs.3.rs-4996788/v1]
https://doi.org/10.21203/rs.3.rs-4996788/v1https://doi.org/10.21203/rs.3.rs-4996788/v1