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适应辐射的群体基因组学:加那利群岛特有蜘蛛的遗传多样性和重组水平极高
适应性辐射的群体基因组学:加那利群岛特有蜘蛛的遗传多样性和重组水平极高摘要蜘蛛属 Dysdera 在加那利群岛的海洋群岛中经历了显著的多样化,自群岛起源以来的 2000 万年间,约有 60 种特有物种出现。这种进化辐射伴随着大量的饮食变化,通常以表型改变为特征,包括形态、代谢和行为变化。因此,这些特有蜘蛛是了解进化驱动因素和确定适应性辐射背后的基因组决定因素的绝佳模型。最近,我们首次对特有物种之一 D. silvatica 进行了染色体水平的基因组组装,为进化基因组学研究提供了高质量的参考序列。在这里,我们对来自拉戈梅拉岛的 D. silvatica 自然种群进行了低覆盖率重测序研究。利用新的高质量基因组,我们表征了全基因组水平的核苷酸多态性、发散和连锁不平衡,并推断了该种群的人口历史。我们还对最近的正向选择进行了全面的全基因组扫描。我们的研究结果揭示了这种地理上受限的特有物种 indi 的核苷酸多样性和重组水平异常高
来源:Arácnido蜘蛛属dysdera属在加那利群岛的海洋群岛上发生了显着的多样化,自群岛起源以来,约有60种特有物种起源于2000万年。这种进化辐射伴随着大量的饮食转移,通常以表型修饰为特征,包括形态学,代谢和行为变化。因此,这些地方性蜘蛛代表了理解进化驱动因素并查明基因组决定因素的绝佳模型。最近,我们实现了一个特有物种之一D. silvatica的第一个染色体水平的基因组组装,为进化基因组学研究提供了高质量的参考序列。在这里,我们对La Gomera岛的D. silvatica自然种群进行了低覆盖范围的重新配置研究。利用新的高质量基因组,我们表征了全基因组水平的核苷酸多态性,差异和连锁不平衡,并推断了该人群的人口统计学历史。我们还进行了全面的全基因组扫描,以进行最近的阳性选择。我们的发现发现了这种地理位置限制的特有物种中极高的核苷酸多样性和重组,这表明大量历史有效人口规模。我们还确定了可能在阳性选择下的几个候选基因组区域,突出了相关的生物学过程,例如视力和氮提取为潜在的适应靶标。这些过程最终可能会推动该属中的物种多样化。这项对海洋群岛特有的蜘蛛的开创性研究为更广泛的种群基因组学分析奠定了基础,旨在理解驱动岛屿生态系统适应性辐射的遗传机制。
dysdera D. Silvatica 分子生态学 https://doi.org/10.1111/mec.17547https://doi.org/10.1111/mec.17547