A new wrinkle in turtles: Their genomes fold in a unique way, researchers find
由爱荷华州立大学进化生物学家领导的一项新研究首次描述了乌龟基因组的三维结构，其折叠结构与迄今为止观察到的任何其他动物都不同。
Continuous evolution of user-defined genes at 1 million times the genomic mutation rate | Science
当大自然在漫长的岁月中大规模进化出一个基因时，它会产生具有保存和变化模式的多种同源序列，其中包含有关该基因的丰富结构、功能和历史信息。然而，自然基因多样性……
Karstsinnectes daxinensis Luo, Zhou & Zhou,in T. Luo, F.-W. Luo, Lan, M.-Y. Xiao, J.-J. Zhou, Liao, N. Xiao et J. Zhou, 2024. 大新中华喀斯特泥鳅 | 大新中华喀斯特泥鳅 || DOI: doi.org/10.3897/zse.100.133964 摘要 2023 年在对 Oreonectes (Nemacheilidae) 属进行修订时，建立了一种名为 Karstsinnectes 的盲鱼属。本研究记录了 6 个物种，并取得了一些分类学进展；然而，由于缺乏某些物种（例
A new piece in the grass pea puzzle – updated genome sequence published
一个国际团队为草豆创建了一个详细的基因组组装，增强了气候智能型农业。文章《草豆谜题的新部分——更新的基因组序列发表》首次出现在《科学探究者》上。
Non-Europeans Opt Out Of Genomic Databases, Leading To Lack Of Diversity
当参议员伊丽莎白·沃伦 (Elizabeth Warren) 的原住民血统主张被 DNA 测试揭穿时，这对所有认同这一点的人都发出了警告——不要接受测试。大多数美国原住民早就这么说了，无论如何，他们更了解生物学是如何运作的华盛顿特区工作人员。五代之后，有可能没有祖先的证据，所以原住民早就告诉他们的社区不要参与。如果数据库中只有几百个，那么数据库就毫无意义，原住民部落可以继续他们的“我们同意你是，你同意你是原住民”政策，而不是有证据。阅读更多
Genome sequencing of all four Macadamia species unlocks new potential for crop improvement
一个研究小组已成功测序并组装了所有四种澳洲坚果的基因组，标志着这种具有商业价值的坚果的作物改良工作取得了重大进展。研究结果揭示了可以增强抗病性、气候适应性和作物产量的关键遗传特征，解决了澳洲坚果育种中遗传多样性的挑战。
UW–Madison researchers find persistent problems with AI-assisted genomic studies
研究人员越来越多地尝试通过使用越来越复杂的 AI 工具来弥补数据差距来解决此问题。
亚马逊地区三种鞭蜘蛛（蛛形纲、Amblypygi）的新线粒体基因组及其系统发育关系和比较分析摘要对鞭蜘蛛 Charinus carajas、C. ferreus 和 Heterophrynus longicornis 的完整线粒体基因组进行了测序、注释，并与其他鞭蜘蛛和蛛形纲动物的线粒体基因组进行了比较。这三种新的线粒体基因组具有后生动物中常见的 37 个基因：13 个蛋白质编码基因 (PCG)、22 个转移 RNA (tRNA) 和两个核糖体 RNA (rRNA)，以及一个非编码控制区 (CR)。大多数 PCG 都呈现 ATN 起始密码子，但两种 Charinus 物种的 cox1 除外，其
Ancient Viral DNA in the Human Genome Linked to Neurodegenerative Diseases
科学家已经确定了古老的病毒 DNA 与多发性硬化症和肌萎缩侧索硬化症等神经退行性疾病易感性之间的关系。通过精确定位基因组中的特定 HERV，该研究为针对这些病毒元素的新型治疗方法打开了大门。古代病毒 DNA 与神经退行性疾病风险伦敦国王学院的新研究 [...]
Between the hedges and between the genomes
UGA 课程描绘了标志性桑福德体育场树篱的遗传谱系。树篱之间和基因组之间文章首次出现在 UGA Today 上。
Most patients with mitochondrial disease can be diagnosed via genomic sequencing
根据一项新研究，超过一半的线粒体疾病患者可以通过基因组测序进行诊断，这一发现将彻底改变家庭护理。墨尔本的研究人员发现了促进和影响测试结果的因素，尤其是在儿童中。
A Small Genome Editing Nuclease Packs a Big Punch
在过去十年中，科学家几乎完全依赖 CRISPR-Cas 系统进行基因组编辑。现在，一种更小但同样有效的核酸酶可以与之竞争。
蒙大拿州立大学和安第斯大学的研究人员发现四足动物参考基因组的分布存在显著的不平衡。他们发现，与全球生物多样性最集中的地方相比，高纬度地区的研究集中度不成比例。
Colossal Biosciences 报告称，它从塔斯马尼亚虎标本中提取了 DNA 和 RNA，这是其在创建灭绝物种的现代替代物方面迈出的关键一步。其他科学家呼吁提供数据来支持这一说法
Traces of ancient immigration patterns to Japan found in 2000-year-old genome
研究表明，弥生和古坟时期，大多数移民到日本的人来自朝鲜半岛，塑造了现代日本人的遗传血统。《在 2000 年前的基因组中发现古代移民到日本的模式痕迹》一文首次出现在《科学探究者》上。
Genomic Advances Promise New Era for Early Disease Detection in Infants
一项新研究表明，使用 DNA 分析进行新生儿筛查可以发现比传统方法更严重但可治疗的健康状况。这项名为 GUARDIAN 的研究是首批使用基因组测序进行新生儿筛查的大型项目之一，早期结果表明，这种方法可以大大改善儿童的医疗保健。早期 [...]
亚洲旱地沙漠蝎 Mesobuthus przewalskii 的染色体水平基因组组装摘要蝎子是具有医学重要性的古老而迷人的节肢动物群，但该群体的高质量参考基因组仍然缺乏。在这里，我们对塔克拉玛干沙漠特有的沙漠蝎子 Mesobuthus przewalskii 进行了全基因组测序。我们结合 PacBio HiFi 测序和 Hi-C 染色体构象捕获，为这种具有医学重要性的蝎子生成染色体水平、单倍型解析和完全注释的基因组组装。组装由两个单倍型（分别为 1052.01 Mbp 和 1055.19 Mbp）组成，达到染色体水平的连续性和 >98% 的 BUSCO 完整性。序列锚定在 13 条染色体上，重
三种新型蜘蛛基因组揭示了蜘蛛蛋白的多样性和 Hox 簇结构：Ryuthela nishihirai（Liphistiidae）、Uloborus plumipes（Uloboridae）和 Cheiracanthium punctorium（Cheiracanthiidae）摘要蜘蛛是一种高度多样化的分类单元，是几乎所有陆地栖息地中最丰富的捕食者之一。它们的成功通常归因于其进化过程中的关键发展，例如丝和毒液的产生以及主要的衍生性状，例如全基因组复制。解决蜘蛛生命树中的深层关系在历史上一直具有挑战性，因此很难衡量这些新奇事物对蜘蛛进化的相对重要性。全基因组数据为这些努力以及功能基因组研究提供了重
