Analyzing diversity of reverse-transcriptase-containing viruses through global metagenomics
病毒逆转录酶 (RT) 在复制(例如,逆转录病毒将 RNA 模板逆转录成互补 DNA)和基因组突变(例如,噬菌体中产生多样性的逆转录元件)中起着关键作用。与逆转录病毒不同,细菌病毒(噬菌体)不是使用 RT 进行基因组复制,而是使用病毒基因在产生多样性的逆转录元件 (DGR) 内变异,或用于其他多样化的生物功能(例如,CRISPR-RT)。
基于蜘蛛线粒体基因组的分子系统发育关系:揭示进化和对极端环境的适应性摘要本研究对共 255 个蜘蛛线粒体基因组和 4 个外群进行了比较分析,其中 39 个物种的线粒体基因组是从头组装的,以探索线粒体基因组的系统发育关系和适应性进化。结果表明,水生银线蛛的线粒体长度最长,密码子偏好性最明显,为 UUA,其次是 CCU。不同科的密码子使用频率相似,蜘蛛线粒体基因组中的密码子使用主要受自然选择压力而非 G/C 突变偏向的影响。我们的系统发育拓扑结构清楚地解释了蜘蛛之间的进化关系,分歧时间估计表明蜘蛛起源于早泥盆世,中皮蜘蛛和后皮蜘蛛两个分支在晚石炭世分离。祖先范围和性状重建结果支持蜘蛛的祖先起源于泥
Will genome editing transform our children's health? Some have doubts
一组科学家声称,通过在胚胎阶段编辑人类基因组,可以大幅降低心脏病等常见疾病的风险 - 但其他生物学家强烈反对
Azenta Obtains Regulatory Approval for Clinical Long-Read Whole Genome Sequencing Test
Azenta, Inc. 宣布推出用于临床应用的长读长全基因组测序 (WGS) 测试。Azenta 成为第一家获得监管部门批准在美国提供此测试的商业供应商。传统的短读长测序方法通常难以识别基因组重复区域中的遗传变异,而这些变异是许多罕见疾病的基础,阻碍了准确诊断和有针对性的治疗……
1,500 ancient European genomes reveal previously hidden waves of migration, study finds
研究人员开发了一种更精确的方法来从古代 DNA 中了解祖先,并用它来识别以前未知的迁徙浪潮。
Semisulcospira egretta Y.-Z. Meng,载 Xu, Meng, Zeng, Wang, Zhong, Yang, Zhou et Glasby,2025。 DOI:doi.org/10.3897/zse.101.136882 摘要在研究中国半沟螺科(Semisulcospira egretta)的多样性和系统发育过程中,我们在福建省厦门市的山溪中根据形态学和分子证据发现了一个推测的新种。该新种半沟螺属(Semisulcospira egretta sp. nov.)的特点是其壳薄而光滑,育儿囊中保留了约0.5毫米长的胚壳,并且其舌状形态具有独特特征。线粒体标记
Ancient genomes provide final word in Indo-European linguistic origins
一支由 91 名研究人员组成的团队(包括哥本哈根大学伦贝克基金会地理遗传学中心的著名遗传学家 Eske Willerslev)发现了与东地中海和西地中海印欧语系使用者有关的青铜时代遗传差异。
蝎子的基因组规模系统发育:模型比较和位点间组成异质性建模摘要蝎子的进化史是一个备受关注的课题,蝎子是最具魅力的节肢动物群之一,已描述的物种超过 2,500 种。鉴于其独特的身体结构和古老的化石记录,了解其系统发育至关重要。最近的基因组规模数据已显示出阐明蝎子生命树中科间关系的潜力;然而,分子数据集之间也存在差异。为了解决这个问题,我们通过综合之前的三项系统基因组学研究,使用考虑位点间组成异质性的模型比较方法探索了蝎子的系统发育关系。我们的分析表明,在无限位点异质性 CAT 和有限混合模型下,蝎目内的关系与普遍结论有显著不同,尤其是关于布提达内的科间关系。我们的结果表明了以下关系:[Pseudo
Houttuynia cordata: Analyzing the genome behind the medicinal plant
鱼腥草,俗称鱼腥草,几个世纪以来一直是传统医学中的关键成分,因其类似抗生素的特性和治疗各种疾病的能力而受到重视。尽管它已被长期使用,但其药用化合物背后的遗传机制仍未得到充分探索。这一知识空白阻碍了其治疗潜力的充分发挥,迫切需要研究 H. cordata 的基因组学,以了解其生物碱的生物合成途径并揭示该植物的进化历史。
The genomic journey of modern and archaic humans may be older than we thought
帕多瓦大学生物系进行的研究确定了智人进化过程中的关键基因组里程碑,包括关键的染色体重排和特定基因变异,这些都有助于形成当前的现代人类特征。
The Oldest Human Genomes in Europe Show How an Entire Branch of Humanity Disappeared
一个古老的人类血统在欧洲的冻原上漫游了近 80 代。然后他们灭绝了。
Scientists decipher genome map of Lycium barbarum
枸杞,俗称枸杞,以其果胶多糖 (LBPP) 而闻名,具有抗氧化、免疫调节和抗衰老等一系列益处。然而,枸杞基因图谱的缺失阻碍了我们对其活性成分的合成和调控机制的理解,限制了其在分子育种和生物技术中的应用。
巨型醋栗 Mastigoproctus giganteus 的染色体水平基因组显示出前志留纪全基因组复制的特征摘要在蛛形纲动物中,染色体水平的基因组组装极大地加速了对蜘蛛 (Araneae)、螨虫和蜱 (Acariformes 和 Parasitiformes) 等关键群体的基因家族进化和发育基因组学的理解。其他缺乏基因组组装的蛛形纲动物目中,研究较少的目包括 Pedipalpi 进化枝,该进化枝由三个目组成,这三个目构成了蜘蛛的姊妹群,它们在 4 亿多年前分化。我们通过从醋栗 Mastigoproctus giganteus (Uropygi) 的单个标本生成第一个染色体水平的组装来弥补这一
Oldest Modern Human Genomes Sequenced
马克斯普朗克学会 很少有早期现代人类的基因组被测序,他们首次抵达欧洲时,该地区已经有尼安德特人居住。一个国际团队领导...
对大约 45,000 年前生活在欧洲的早期现代人类已知最古老的基因组的分析表明,现代人类和尼安德特人在 45,000 至 49,000 年前的一次事件中混合,根据包括一名澳大利亚人的国际研究,这比之前的估计更近。在一篇论文中,研究人员深入研究了 42,000 至 49,000 年前生活在德国拉尼斯和捷克兹拉蒂昆的七个人的基因组。这些人是一个小型的、密切相关的人类群体的一部分,该群体首先从大约 50,000 年前离开非洲的人口中分离出来,后来定居在世界其他地方。尽管他们很早就分开了,但他们 DNA 中的尼安德特人 DNA 痕迹表明,非洲以外的所有人都曾发生过一次 DNA 混合事件,该事件发生在大
Oldest Human Genomes Reveal How a Small Group Burst Out of Africa
45,000 年前欧洲化石中的 DNA 为我们人类如何在世界各地传播提供了新的线索。