Ancient genomes reveal when modern humans and Neanderthals interbred
从现代人类身上恢复的最古老的基因组有助于确定两种原始人类的重大融合发生的时间和方式
When Did Neandertals and Humans Interbreed? Genomics Closes In on a Date
有史以来最古老的人类基因组测序表明,我们的尼安德特人祖先来自一次杂交“脉搏”,并确定了时间
What Does It Mean to Be In the ‘Post-Genomic’ Age?
明年将是人类基因组第一份草图公布 25 周年。在《选择性压力》专栏中,C. Brandon Ogbunu 反思了“后基因组”时代的含义,并思考了关于生物科学下一步发展的新兴对话。
GENOT: Entropic (Gromov) Wasserstein Flow Matching with Applications to Single-Cell Genomics
单细胞基因组学极大地促进了我们对细胞行为的理解,促进了治疗和精准医疗的创新。然而,单细胞测序技术本质上具有破坏性,只能同时测量有限的数据模式。这一限制凸显了对能够重新排列细胞的新方法的需求。最佳传输 (OT) 已成为一种有效的解决方案,但传统的离散求解器受到可扩展性、隐私和样本外估计问题的阻碍。这些挑战刺激了神经网络的发展……
Revvity Broadens Relationship with Genomics England to Advance Genomics in the UK
Revvity, Inc. 宣布扩大与 Genomics England 的合作,利用两个组织的专业知识和资源推动英国各地的关键基因组计划。基于双方长期而富有成效的工作历史,此次高级合作致力于加速 Genomics England 著名的研究项目,支持基因组学的不同领域,培养创新医疗领域的人才……
Cancers share DNA mutations that affect our genome
研究人员发现了人类 DNA 中的某些区域,在这些区域中,突变会破坏基因组的结构,并可能促进不同类型癌症的生长。
Diving Into the Brittle Star Genome to Understand the Evolution of Regeneration
蛇尾的基因组测序揭示了独特的基因排列,并深入了解了与肢体再生有关的古老基因。
使用系统基因组学重新评估热带游走蜘蛛的进化关系:基于 UCE 的 Ctenidae (Araneae) 系统发育,发现新的狼蛛科摘要热带游走蜘蛛 (Ctenidae) 是一个多样化的游走捕食者科,其物种丰富度在热带地区达到顶峰。人们已经使用形态学和基于桑格的测序数据对 Ctenidae 的系统发育进行了研究,但这些研究受到分类单元采样的限制,并且通常为许多科内系统发育关系恢复了较低的分支支持。在此,我们使用基因组规模的数据展示了该科最广泛的系统发育采样,利用了来自世界各地的所有 ctenid 亚科的博物馆收藏。我们获得了 Ctenidae 的系统发育,大多数节点在不同的系统发育分析中显示出最大
One genomic test can diagnose nearly any infection
加州大学旧金山分校的 mNGS 测试可快速诊断各种病原体,改善神经系统感染护理和大流行应对。文章《一种基因组测试可以诊断几乎任何感染》首次出现在《科学探究者》上。
Breakthrough Genomic Test Can Diagnose Nearly Any Infection
加州大学旧金山分校开发的下一代宏基因组测序测试证明了其能够快速准确地诊断多种病原体的能力。加州大学旧金山分校开发的基因组测试能够快速识别几乎任何类型的病原体(包括病毒、细菌、真菌或寄生虫),经过十年的使用,已证明是成功的。该测试具有潜力 [...]
AI-Assisted Genome Studies Are Riddled with Errors
研究人员在大型基因组学研究中使用人工智能来填补患者信息的空白并改善预测,但新的研究发现了假阳性和误导性相关性。
Metagenomic profiling method with enhanced precision uses fewer computing resources
卡内基梅隆大学和多伦多大学的研究人员开发了一种新的 k-mer 草图宏基因组分析器,称为 sylph,它使科学家能够比其他分析器更快、更准确地分析基因组数据。
New Genomic Test Can Diagnose Nearly Any Infection
加州大学旧金山分校 加州大学旧金山分校开发的一项基因组测试可以快速检测几乎任何类型的病原体 - 病毒、细菌、真菌或寄生虫 - 在...
PacBio to reduce the cost of sequencing a human genome to less than $500
PacBio 是一家领先的高质量、高精度测序解决方案开发商,已宣布推出 SPRQ,这是其 Revio™ 长读测序系统的改进测序化学方法。新的化学方法将 Revio DNA 输入要求降低 4 倍至每个样本 500ng,从而能够使用 HiFi 测序技术对更多样本类型(例如使用 PacBio 的新 Nanobind 协议提取的唾液和肿瘤样本)进行测序……
巨型醋栗 Mastigoproctus giganteus 的染色体水平基因组显示出前志留纪全基因组复制的特征 摘要在蛛形纲动物中,染色体水平的基因组组装极大地加速了对蜘蛛 (Araneae)、螨虫和蜱 (Acariformes 和 Parasitiformes) 等关键群体的基因家族进化和发育基因组学的理解。其他缺乏基因组组装的蛛形纲动物目中,研究较少的目包括 Pedipalpi 进化枝,该进化枝由三个目组成,这三个目形成了蜘蛛的姊妹群,它们在 4 亿多年前分化。我们通过从醋栗 Mastigoproctus giganteus (Uropygi) 的单个标本生成第一个染色体水平的组装来弥补这