Manis aurita Hodgson,1836in Koju、Zeng、Zhang、Yao、Huang、Wang、Hawkins、Hinckley、Flores、Guo、Li、Maharjan、Byanjankar、Huang、Yu、Leng、He、Feijó et Hua,2026。DOI: doi.org/10.1038/s42003-026-10314-9Abstract穿山甲在全球面临着严重的保护威胁,需要准确的分类以进行有效的保护。先前对中华穿山甲(Manis pentadactyla)的基因组研究发现了两个截然不同的谱系(MPA 和 MPB),表明物种多样性被低估。然而,最近对
图片来源:CC BY 2.5,https://commons.wikimedia.org/w/index.php?curid=40194191对裂殖纲蜘蛛 Rowlandius potiguar Santos、Ferreira 和 Buzzato 进行全基因组测序,2013 年来自巴西半干旱抽象短尾鞭蝎(蜘蛛纲:尽管裂殖纲蜘蛛纲动物与地下环境具有生态和进化相关性,但它们是一个研究很少的蜘蛛纲动物,特别是在基因组资源方面。在这项研究中,我们提出了 Rowlandius potiguar 的第一个基因组组装草案,这是巴西东北部喀斯特系统特有的与洞穴相关的物种。使用 Illumina 双端技术 (2
Beijing’s Asymmetric Securitization of Genomic Data
摘要:5月8日,2024年从科技部手中接管人类遗传资源(HGR)管理工作的国家卫生健康委员会(NHC)发布了《人类遗传资源管理条例》修订实施细则征求意见稿,公开征求意见期持续至6月7日(NHC,[…]北京基因组数据不对称证券化首先出现在詹姆斯敦。
Chromosome-level genome assembly of the jumping spider Spartaeus platnicki
跳蛛 Spartaeus platnicki 的染色体水平基因组组装摘要跳蛛是一个多样化且富有魅力的无脊椎动物群体,以其高度专业化的视觉系统、复杂的求偶行为和广泛的生态适应性而闻名。然而,高质量基因组资源的持续缺乏阻碍了对这些关键性状的遗传基础和表型进化的研究。为了解决这一空白,我们对 Spartaeus platnicki(一种代表跳蛛基础谱系的物种)的染色体水平基因组进行了从头组装。该组装通过整合 PacBio HiFi 长读长、Illumina 短读长、RNA-seq 和 Hi-C 数据实现,包含 15 条假染色体,包括 X1 和 X2 性染色体,总长度为 3.71 Gb,支架 N50
年龄和早年逆境 (ELA) 是健康的关键决定因素,但它们是否影响跨组织的类似生理机制尚不清楚。我们生成了 237 只半散养恒河猴 14 个组织的 DNA 甲基化 (DNAm) 谱...
基因组和转录组分析揭示了蜘蛛对半水生和水生生物的适应摘要蜘蛛主要是陆生的,但一些谱系已经独立适应了海洋和淡水栖息地。尽管支持这些进化转变的生理和行为特征已经得到表征,但蜘蛛适应水生和半水生栖息地的基因组基础仍不清楚。在这里,我们报告了水生蜘蛛 Argyroneta Aquatica 的染色体水平基因组组装。对 22 种蜘蛛的比较分析支持半水生 (∼56 Mya) 和水生 (∼44 Mya) 谱系的两个独立转变。与陆生蜘蛛相比,水生蜘蛛表现出独特的呼吸形态,包括前气孔和更密集的气管。分子进化分析确定了选择性约束中谱系特异性的变化或与气管发育(例如,Wnt-1、Catenin beta、TMEM2
Cyrtopodion oculiplenum Nazarov、Nabizadeh、Rajabizadeh、Moaddab、Nikolaev、Solovyeva、Melnikov、Ananjeva、Poyarkov 和 Ratsegar-Pouyani,2026 DOI:doi.org/10.30906/1026-2296-2026-33-2-85-168 Researchgate.net/publication/408559918摄影:Roman Nazarov 摘要 Cyrtopodion agamuroides-gastropolisis 物种复合体的薄趾壁虎代表了一个在分类学上具有挑战
Advancing regulatory variant effect prediction with AlphaGenome
根据 DNA 序列预测功能基因组测量结果的深度学习模型是破译遗传调控密码的强大工具。现有方法涉及输入序列长度和预测分辨率之间的权衡,从而限制了它们的模态范围和性能1,2,3,4,5。我们推出了 AlphaGenome,这是一个统一的 DNA 序列模型,它以 1 Mb 的 DNA 序列作为输入,并通过不同的模式预测数千个功能基因组轨迹,最高可达单碱基对分辨率。这些模式包括基因表达、转录起始、染色质可及性、组蛋白修饰、转录因子结合、染色质接触图、剪接位点使用以及剪接连接坐标和强度。 AlphaGenome 在人类和小鼠基因组上进行训练,在 26 项变异效应预测评估中的 25 项中匹配或超过了最强的
Gene-Editing Tool Unlocks Trove of Chemicals From Fungi
EurekAlert! 研究人员花费了数十年和数十亿美元对动物和作物基因组进行测序,但真菌在历史上一直是基因组学中被遗忘的中间孩子,只是......
Scientists looked inside cockroach DNA, and found something they never expected
一项新研究显示,蟑螂含有古老的细菌 DNA。研究人员发现了来自长期微生物伙伴Blattabacteruenoti的数千个微小DNA片段,这些片段已整合到蟑螂基因组中。这一发现凸显了持久的动物-微生物伙伴关系如何留下持久的遗传印记,挑战了之前关于动物 DNA 的假设。
Tracking a Tarantula Diversification in a Neotropical Open Biome
追踪新热带开放生物群落中的狼蛛多样性摘要目的调查卡廷加生物群落中 Dolichothele exilis 的谱系多样性,并推断该地区多样化的地质和气候驱动因素。位置卡廷加,巴西东北部。分类单元 Dolichothele exilis(蜘蛛亚科:Theraphosidae)。方法我们使用 96 个个体进行基因组测序 (GBS)测序)和 39 个人进行 COI 线粒体标记测序。使用STRUCTURE和SNMF方法推断种群结构,并计算遗传多样性和多样化指数。使用 SNP 数据构建最大似然系统发育树,并使用线粒体数据构建贝叶斯树。为了探索人口统计历史,使用了 DIYABC 和随机森林 (RF) 分类器
Koalas Nearly Vanished 100,000 Years Ago – Long Before Humans Arrived
考拉在 10 万年前气候导致的人口崩溃中幸存下来,新的基因组研究正在帮助科学家更好地保护当今的物种。一项重要的基因组研究改变了科学家对考拉(Phascolarctos cinereus)进化的理解,表明该物种在大约 10 万年前经历了种群数量的急剧下降,远早于人类到达澳大利亚。研究人员发现 [...]
This New DNA Test Solves Rare Disease Mysteries That Standard Genetics Misses
一种新的长读长 DNA 测试可改善罕见疾病的诊断,取代多种现有测试,并可能成为基因诊断的首选全球标准。一项新的 DNA 测试提供了比当前标准诊断方法更详细的基因组视图,帮助医生更频繁地识别罕见的遗传性疾病。该测试可以替换 [...]
The shared world of Leishmania and us: A journey of adaptability and co-evolution
童年时期对科学家形象的迷恋促使印度理工学院卡拉格布尔 (IIT Kharagpur) 助理教授、EMBO 全球研究员网络 (EMBO GIN) 获奖者 Budhaditya Mukherjee 开始研究世界上适应性最强的寄生虫之一——利什曼原虫。在这篇简介中,他反思了研究、复原力、指导、基因组可塑性,以及了解病原体进化如何有助于解决耐药性和慢性感染。