来自哥伦比亚蜘蛛 Pamphobeteus verdolaga 的新型 vrdg183 毒素通过变构机制抑制 L 型 Ca2+ 电流摘要背景蜘蛛毒液富含毒素,可调节哺乳动物电压门控离子通道 (VGIC),具有药理潜力。然而,美洲蜘蛛对电压门控 Ca2+ 通道产生影响的毒素库存量落后于与其他通道相互作用的毒素数量。在这里,我们的目的是鉴定哥伦比亚蜘蛛 Pamphobeteus verdolaga 的新 Ca2+ 通道调节毒素。方法从 Pamphobeteus verdolaga 毒腺的转录组数据库中选择了 5 个新颖的带正电荷的二硫键桥短肽和另一种短的非桥接对照肽的序列。合成肽并使用膜片钳以 1
ToxIR:用于高精度毒素转录组分析的准确 RNA-seq 管道,已在 odontobuthus doriae 毒腺中得到验证。由于组装错误、亚型多样性和注释偏差,复杂组织的转录组分析仍然具有挑战性,需要优化计算管道。蝎毒是生物活性肽的宝库,具有巨大的生物医学潜力,但其复杂性使转录组分析变得复杂。我们推出了 ToxIR(毒素识别和识别),这是一种针对精确毒素转录组分析而优化的 RNA-seq 管道,并在 Odontobuthus doriae 毒腺中得到验证。 ToxIR 结合了深度测序、基于 rnaSPAdes 的从头组装和定制注释策略,甚至可以检测低丰度毒素并高精度解析同种型。它结合了严格
Proteomic and biochemical characterization of Bothrops pubescens (Serpentes: Viperidae) venom
毛蝰蛇(蛇类:蝰蛇科)毒液的蛋白质组学和生化特征摘要毛蝰蛇是乌拉圭临床上重要的蝰蛇科蛇种,每年与松蝰蛇一起造成 60 多例人类中毒事件。以前被归入新维迪双翅目(Bothrops neuwiedi)复合体,最近的分类学修订现在将其分布范围限制在南里奥格兰德州(巴西)和乌拉圭。该物种并不十分健壮,体长为 22 至 92 厘米,并显示出独特的背外侧图案,每侧均由深棕色梯形斑点组成。 毛毛B. pubescens的毒液表现出Bothrops属的典型毒理学特性,包括凝血障碍和严重的局部组织损伤,在极端情况下可能导致截肢。与其他Bothrops物种一样,金属蛋白酶是最丰富的毒素,并伴有高水平的磷脂酶A2、
Pandercetes sp. 肽的分子多样性。蜘蛛毒液和 κ-LhTx-1 毒素电压门控钙通道的拮抗活性摘要有毒动物的毒液代表着丰富的生物活性肽库,可作为离子通道研究、药物和杀虫剂开发的宝贵工具。虽然对不同物种的毒液进行了广泛的研究,但潘德塞特斯属蜘蛛的毒液成分仍然很大程度上未被探索。在本研究中,蜘蛛 Pandercetes sp 的肽多样性。通过构建毒液cDNA文库进行了探索。共获得626个高质量的表达序列标签(EST),分为类毒素EST、细胞成分EST和非分类EST。从类毒素 EST 中,鉴定出 102 个非冗余类毒素肽,并根据序列同源性和半胱氨酸框架分为 11 个家族。生物信息分析显示