First Comprehensive Atlas of Human Cellular Senescence in Aging
耶鲁大学医学 一项旨在解码衰老如何重塑人体的大型科学计划本月达到了一个重要里程碑。美国国立卫生研究院 (NIH) 细胞衰老...
A global map for introgressed structural variation and selection in humans | Science
尼安德特人和丹尼索瓦人的基因渗入塑造了现代人类基因组；然而，基因渗入的结构变异（SV ≥ 50 个碱基对）仍然难以发现。我们集成了来自四个新巴布亚新的高质量分阶段组件......
Scientists Map Proteins From Billion-Year-Old Organism and Discover New Links to Rare Diseases
研究人员发现了以前未知的基因与三种罕见疾病有关，这一发现为人类疾病的遗传原因提供了新的线索。《科学家绘制来自十亿年前生物体的蛋白质并发现与罕见疾病的新联系》一文首先发表在 UT Austin News - 德克萨斯大学奥斯汀分校。
A Structure-Informed Atlas of Venom-Derived Peptides Reveals the Organization of Chemical Space
毒液衍生肽的结构信息图谱揭示了化学空间的组织摘要毒液衍生肽是结构多样的生物活性支架，与计算发现和分子设计的相关性越来越大。然而，它们在化学空间内的组织在综合框架中仍然缺乏特征。在这里，我们提出了一个精心策划的、基于结构的毒液肽图谱，该图谱由基于描述符的集成框架支持，该框架结合了 3,423 个肽的序列和结构衍生特征。高置信度 AlphaFold 模型与物理化学和结构描述符集成，生成统一的分子表示。多变量分析表明，毒液肽占据了由二硫键介导的稳定性、结构致密性和静电疏水平衡形成的化学空间的受限且可解释的区域。功能类别显示出明显的分离，而分类起源解释了较小的差异，支持收敛设计原则。该图集为肽科学中的
AI atlas reveals hidden whole-body-damage caused by obesity
研究人员开发了 MouseMapper，这是一种人工智能框架，可以以细胞分辨率绘制小鼠疾病变化图，揭示与肥胖相关的炎症和神经损伤，对了解人类健康具有重要意义。
七鳃鳗在阐明脊椎动物大脑进化方面占据着关键地位。利用空间转录组学和单核 RNA 测序，我们生成了七鳃鳗大脑的三维分子图谱，识别了 209 个不同的细胞......
Truncated life history underlies rapid local adaptation in island rattlesnake venom expression
截短的生活史是岛屿响尾蛇毒液表达快速局部适应的基础摘要快速适应性进化可能不仅通过长期遗传变异发生，而且通过先前暴露于选择的现有遗传变异轴更有可能发生。个体发生变异代表了这样一个轴，并且通常在蛇毒的强烈选择下进化。蛇毒是蛋白质毒素的复杂混合物，毒液表达的个体发生变化很频繁，反映了生命史中的饮食变化。在这里，我们使用形态学、蛋白质组学、转录组学、表观基因组和光学基因组图谱数据来研究一对经过充分研究的东部菱背响尾蛇（Crotalus adamanteus）的岛屿-大陆种群对，以确定种群之间的快速适应性表达分歧是否通过个体发育调控网络的共同选择、独立于个体发育的种群特异性变化或两者的组合而发生。我们发
New protein-folding AI vastly expands on Alphafold's efforts
由名为 ESMFold2 的人工智能工具生成的新开源图谱极大地扩展了已知的蛋白质宇宙
