Organism-wide cellular dynamics and epigenomic remodeling in mammalian aging | Science
为了研究衰老过程中全生物体的细胞变化和表观基因组动态,我们构建了一个单细胞染色质可及性图谱,涵盖三个年龄组和两性的 21 个小鼠组织。我们发现大约四分之一的 536 ...
ERGA-BGE-CBP 欧洲最奇异的蝎子——盲蝎 Belisarius xambeui Simon, 1879(Belisariidae, Scorpiones)的染色体水平基因组组装摘要我们提出了盲蝎 Belisarius xambeui Simon, 1879(Belisariidae, Scorpiones)的染色体水平参考基因组。通过流式细胞术估计的基因组大小 (4.32 Gb) 与最终组装大小 (3.98 Gb) 非常匹配。最终组装包括19,045个支架,其中56个染色体水平支架(假染色体),占总组装的90.08%。整个基因组的核苷酸多样性较低,平均 π 为 0.0018。Gu
Far fewer people are related to Genghis Khan than previously assumed, new genomic study suggests
一些专家认为,世界上多达二百人中就有一个与成吉思汗有关。但一项新的基因组研究表明,这个数字要低得多。
Microbe with the smallest genome yet pushes the boundaries of life
生活在昆虫细胞内的共生细菌在数亿年的时间里已经失去了大部分 DNA,就像进化成线粒体的古代微生物
低覆盖率全基因组测序揭示了巴西卡廷加长腿蜘蛛的一个新亚科(Araneae:Pholcidae)摘要Pholcid蜘蛛长期以来被分为五个亚科,这个框架最终可以追溯到1893年Eugène Simon的非系统发育系统。虽然亚科关系和组成在过去几十年里已经得到了广泛更新,但没有必要为数百个新物种中的任何一个建立新的亚科自西蒙以来新描述的。在这里,我们报告了来自半干旱巴西卡廷加的两个新物种:Caipira mineira Huber sp。十一月,和 Caipira baiana Huber sp。十一月基因组数据有力地支持了它们的姐妹群体关系;因此,我们保守地将它们归为一个属,Caipira Hub
Allohistium anas Near 和 MacGuigan,in MacGuigan、Taylor、Ghezelayagh、Wood、Simmons、Mollish 等,2025 年。Cinder Darter || DOI:doi.org/10.1093/sysbio/syaf083 摘要过去 250 年来,生物学家一直依靠形态特征来识别、定义和正式描述物种。系统发育物种概念的出现和分子数据的引入催生了适用于广泛的真核谱系的新物种定界方法。然而,这些方法严重强调基因组数据,往往忽视表型特征。我们提出并实施了一种物种界定方法,该方法利用 ddRAD-seq 的全基因组标记和分枝形态特征
代表 Zygiellidae 家族的常见球织蜘蛛 Leviellus thorelli 的 ERGA-BGE 参考基因组摘要 Levillus thorelli 参考基因组为 Zygiellidae 提供了第一个高质量的基因组资源,Zygiellidae 是一个具有动态系统历史的球织蜘蛛家族,并且在构建具有无螺旋扇区特征的网方面具有独特性。作为欧洲参考基因组图谱 (ERGA) 的一部分,我们生成了 L. thorelli 的染色体水平组装,该组装被组织成 13 个连续的染色体假分子。该染色体级组装大小为 2.20 Gb,由 939 个重叠群和 130 个支架组成,重叠群和支架 N50 值分别为
基于 UCE 衍生的亚基因组数据对新西兰广泛分布的螨类 Rakaia(Arachnida、Opiliones、Cyphophasemi)进行生物地理学摘要新西兰新西兰是大量特有类群的家园,其中一些类群在冈瓦纳大陆分裂之前就已经存在于群岛上。螨虫收割者(Cyphophasemi 亚目)是一种居住在森林落叶层和洞穴中的小型非蜘蛛蜘蛛纲动物。螨虫收割者科 Pettalidae Shear 在新西兰呈现出经典的冈瓦纳分布,具有显着的多样性,新西兰是三个花瓣属的家园。我们的研究重点是最广泛和最特殊的 Aotearoa pettalid 属 Rakaia Hirst,1926 的进化。通过系统发育分析,我
Jumping DNA May Trigger Cancer Years Before Diagnosis
了解跳跃 DNA 如何在诊断前数年破坏基因组的稳定性,从而有可能实现更早的癌症检测和新的治疗方法。
毒液变异和抗蛇毒血清设计的未来:整合群体毒液学、进化毒理学和精准治疗学摘要蛇咬伤仍然是一种被忽视的热带疾病,对热带地区的农村人口影响尤为严重,而这些地区获得及时有效治疗的机会往往有限。传统的抗蛇毒血清是通过用混合毒液对动物进行免疫接种而产生的,已证明具有临床益处,但针对复杂且地域异质的蛇毒成分可能表现出不同的性能。蛋白质组学、转录组学和基因组学的进展揭示了物种内和物种间毒液的巨大变异,这对抗蛇毒血清设计和评估具有潜在影响。这篇综述综合了当前关于毒液多样性的分子、生态和进化驱动因素的知识,并讨论了这些见解如何为开发更多区域性和基于证据的治疗策略提供信息。特别关注毒素解析的抗蛇毒组学、单克隆抗体研
The Disappearing Worms Beneath Our Seas – and the Scientists Fighting Back
EuroWorm 正在建立欧洲海洋环节动物的开放基因组库存,以应对生物多样性丧失并加速物种发现。通过将历史收藏与现代基因组学联系起来,该项目加强了全球研究和博物馆基础设施。在全球范围内,物种正以前所未有的速度消失——气候变化、栖息地丧失和入侵物种加速了这一速度。具有 [...]
Bacteroides Fragilis May Be A Fifth Columnist Helping Colon Cancer In Your Body
肠道细菌脆弱拟杆菌长期以来一直给研究人员带来了一个悖论。它与结直肠癌有关,但它在大多数健康人体内也生活得相当愉快。丹麦研究小组的一项新研究提供了一条可能的线索。当他们超越细菌本身并深入其基因组时,他们发现了一种以前未知的病毒嵌入其中 - 这种病毒在癌症患者中更为常见。阅读更多
Neanderthal Males Mated With Attractive Human Females
大学。人类基因组是数千年来记录的迁徙、进化和祖先的复杂记录。现在,
Imaging Technique Reveals DNA’s Hidden Shape in the Earliest of Embryos
了解有关 Pico-C 的更多信息,这是一种有助于揭示生命第一天基因组结构的工具。
Colorectal Cancer Has a Unique Microbial “Fingerprint,” Scientists Discover
研究人员在癌症 DNA 数据中发现了可能影响诊断和生存的病毒和细菌。癌症基因组测序旨在读取人类 DNA,但它也捕获样本中微生物的 DNA 痕迹。在东安格利亚大学 (UEA) 的一项新研究中,这些微生物 [...]
非长末端重复 (non-LTR) 反转录转座子蛋白通过靶标引发的逆转录的协调切口和逆转录酶活性将其 RNA 模板复制到基因组中。第一链互补的机制...