Sanger Sequencing: Principles, History, Challenges, and Applications
为学生解释桑格测序，涵盖 DNA 测序的原理、工作流程、挑战和现代应用。后桑格测序：原理、历史、挑战和应用首先出现在《科学笔记》上。
作者：Micha L. Rieser，归因，https://commons.wikimedia.org/w/index.php?curid=35243275白头短毛虫的完整线粒体基因组测序和七种蝼蛄科物种的密码子使用偏倚比较分析摘要狼蛛（狼蛛科）是陆地上具有重要生态意义的无脊椎动物捕食者生态系统，但许多物种面临栖息地破碎化和国际宠物贸易不可持续收集的威胁。 Brachypelma albiceps 是 CITES 附录 II 所列物种，缺乏全面的线粒体基因组特征，限制了系统发育和进化研究。在这里，我们报告了白头孢菌的完整线粒体基因组序列（13,856 bp；GC 含量 32.84%），并提供了
DNA Breakthrough Solves Decade-Old Mystery of the Beachy Head Woman
新研究表明，神秘的罗马时代“海滩头女人”很可能来自英国，而不是地中海或撒哈拉以南非洲。 DNA 测序技术的进步正在帮助研究人员解开困扰 Beachy Head Woman 十多年来的谜团。一名罗马时期年轻女子的遗骸在 [...]
What exactly are you eating? The nutritional ‘dark matter’ in your food
当科学家在 2003 年破解人类基因组（对人类的整个遗传密码进行测序）时，许多人预计它将解开疾病的秘密。但遗传学只能解释大约 10% 的风险。其余 90% 取决于环境，其中饮食起着重要作用。在世界范围内，大约五分之一的人与不良饮食习惯有关 […]帖子 你到底在吃什么？食物中的营养“暗物质”首先出现在《Knowridge Science Report》上。
Scientists Find Extinct Rhino DNA in Wolf Pup Mummy’s Stomach
科学家从自然木乃伊化的更新世狼幼崽的胃中发现的遗骸中对早已灭绝的披毛犀的基因组进行了测序
以单细胞分辨率破译寄生蜂毒液基因表达的调控景观摘要毒腺是寄生蜂的一个重要器官，它产生控制宿主的毒液，对寄生蜂的生存和繁殖至关重要。但人们对毒腺细胞如何精确调节毒液合成知之甚少。在这里，我们利用单核RNA测序构建了蔬菜害虫天敌翼手龙毒腺和卵巢的细胞图谱。毒腺中的细胞分为六个亚群，卵巢中的主要细胞类型是卵泡细胞、生殖细胞和护士细胞。名为VgC1至VgC6的毒腺亚群的细胞功能在毒液的产生和分泌方面得到丰富。此外，已鉴定的毒液基因的表达模式（77个基因在所有6个VgC中表达，46个基因在5个VgC中表达）表明大多数毒液基因在VgC中广泛表达。最后，对毒腺细胞的 hdWGCNA 分析鉴定了一组共表达的毒
E. Coli Linked To Diabetic Foot Infections Gets Worldwide Analysis
糖尿病足部感染是糖尿病的严重并发症，也是导致下肢截肢的主要原因，但人们对这些慢性足部感染所涉及的具体病原体知之甚少，特别是大肠杆菌，尽管在临床样本中经常检测到大肠杆菌。直接从多个大陆的糖尿病足部溃疡中分离出的大肠杆菌菌株的新基因组特征可能有助于解释为什么某些感染变得难以治疗并导致严重甚至危及生命的结果。研究小组分析了从欧洲、非洲、亚洲和美洲患者感染的糖尿病足溃疡中分离出的 42 株大肠杆菌菌株的全基因组序列，并对每种菌株的完整 DNA 进行了测序。阅读更多
Polygonatum dabieshanensis B.X.Han, S.Y.Yi & X.W.Song, in Song, Xu, Wang, Han, Li et Yi, 2026. 大别山黄精 || DOI：doi.org/10.3897/phytokeys.269.173145 AbstractPolygonatum dabieshanensis（天冬酰胺科）是来自中国安徽省和河南省大别山的一个新物种，进行了描述和说明。它与早花、玉竹、玉竹最为相似，但区别在于具有黄色圆柱状根茎、圆柱状茎、椭圆形叶片、总状花序、1-2朵（有时3朵）花、向内延伸的圆柱形花被、靠近花被管远端1/2处着
ToxIR：用于高精度毒素转录组分析的准确 RNA-seq 管道，已在 odontobuthus doriae 毒腺中得到验证。由于组装错误、亚型多样性和注释偏差，复杂组织的转录组分析仍然具有挑战性，需要优化计算管道。蝎毒是生物活性肽的宝库，具有巨大的生物医学潜力，但其复杂性使转录组分析变得复杂。我们推出了 ToxIR（毒素识别和识别），这是一种针对精确毒素转录组分析而优化的 RNA-seq 管道，并在 Odontobuthus doriae 毒腺中得到验证。 ToxIR 结合了深度测序、基于 rnaSPAdes 的从头组装和定制注释策略，甚至可以检测低丰度毒素并高精度解析同种型。它结合了严格
Researchers Discover Rare New Type of Diabetes Affecting Newborns Worldwide
一个鲜为人知的基因对于生命早期阶段的胰岛素产生至关重要。 DNA 测序的最新进展与新的干细胞研究方法相结合，使一个国际科学家小组能够识别出一种以前未被识别的婴儿期糖尿病形式。埃克塞特大学医学院的研究人员 [...]
Exploring Spiders Without Venom as New Sources of Peptidase Inhibitors
探索没有毒液的蜘蛛作为肽酶抑制剂的新来源摘要肽酶构成生物体中至少 2% 的基因，并参与生命形式的几乎所有生理过程。相反，肽酶抑制剂对于调节蛋白水解活性至关重要，并且已被广泛应用。目前，将新型肽酶抑制剂来源的高通量测序与分子建模和药物设计相结合代表了开发新分子的有效策略。有毒蜘蛛的毒液和消化系统中含有多种肽酶抑制剂。然而，对无毒蜘蛛（Uloboridae）的生化和转录组学研究仍然是近期且稀缺的。在这里，对 Uloboridae 蜘蛛 Zosis geniculata 消化中肠憩室 (MD) 的转录组和生化分析表明，该物种表现出与其他蜘蛛相似的消化酶谱。此外，MD 转录组鉴定了属于 6 个抑制剂家
京兆唇鳖（Theraphosidae：Chilobrachys）核型及基因组特征分析 摘要：京雉唇形鳅药物制剂具有抗炎、解毒、镇痛、抗水肿等多种治疗作用。然而，由于缺乏染色体核型和基因组数据，对其遗传背景和毒素机制的研究受到阻碍。在本研究中，我们利用染色体制备技术分析了京兆虫的核型，利用流式细胞术和K-mer分析估计了基因组大小，并利用第二代和第三代单分子实时测序技术进行了基因组测序和组装。结果表明，京兆二倍体染色体数目为2n=68，核型式为2n=46m+18sm+4st，染色体补数为2n=10L+18M2+38M1+2S。使用 Solanum lycopersicum 和 Trichonep
转录组和蛋白质组综合分析揭示疣蛛科（Araneae：Sparassidae）毒液成分的多样性摘要疣蛛是一种大型夜行性游走蜘蛛，是农林害虫的重要天敌，其毒液在捕获猎物中发挥着关键作用。然而，对其毒液成分的系统研究仍然很少。在本研究中，我们利用高通量转录组测序结合定量蛋白质组学对毒腺和毒液样本进行了综合分析。转录组产生了43,244个具有代表性的unigene序列，其中通过功能注释鉴定出102个类毒素序列，涵盖13个肽毒素超家族和7个蛋白质毒素家族。蛋白质组学分析鉴定出 35 种毒液成分，其中包括 14 种肽毒素和 21 种功能蛋白。表达最丰富的毒素家族，超家族 IX 和 VII，在转录组和蛋白质
来自超保守元件（UCEs）的Bothriocyrtum californicum (O. Pickard-Cambridge, 1874)（Araneae，Halonoprotidae）线粒体基因组摘要Bothriocyrtum californicum (O. Pickard-Cambridge, 1874) 的线粒体基因组首次被完全测序和注释。这种活板门蜘蛛发现于美国加利福尼亚州。我们使用 SPAdes 组装重叠群，并从所得重叠群中提取有丝分裂基因组。使用 MITOS2 并通过与蜘蛛目的其他物种进行比较来注释线粒体基因组。线粒体基因组有 14,081 个碱基对，包括 22 个转移 RNA
