重叠群关键词检索结果

京兆唇形鳅(Theraphosidae:Chilobrachys)核型及基因组特征分析

Karyotype and genome characterization analysis of Chilobrachys jingzhao (Theraphosidae: Chilobrachys)

京兆唇鳖(Theraphosidae:Chilobrachys)核型及基因组特征分析 摘要:京雉唇形鳅药物制剂具有抗炎、解毒、镇痛、抗水肿等多种治疗作用。然而,由于缺乏染色体核型和基因组数据,对其遗传背景和毒素机制的研究受到阻碍。在本研究中,我们利用染色体制备技术分析了京兆虫的核型,利用流式细胞术和K-mer分析估计了基因组大小,并利用第二代和第三代单分子实时测序技术进行了基因组测序和组装。结果表明,京兆二倍体染色体数目为2n=68,核型式为2n=46m+18sm+4st,染色体补数为2n=10L+18M2+38M1+2S。使用 Solanum lycopersicum 和 Trichonep

来自超保守元件 (UCE) 的 Bothriocyrtum californicum (O. Pickard-Cambridge, 1874)(Araneae,Halonoprotidae)线粒体基因组

The mitochondrial genome of Bothriocyrtum californicum (O. Pickard-Cambridge, 1874) (Araneae, Halonoproctidae) from ultraconserved elements (UCEs)

来自超保守元件(UCEs)的Bothriocyrtum californicum (O. Pickard-Cambridge, 1874)(Araneae,Halonoprotidae)线粒体基因组摘要Bothriocyrtum californicum (O. Pickard-Cambridge, 1874) 的线粒体基因组首次被完全测序和注释。这种活板门蜘蛛发现于美国加利福尼亚州。我们使用 SPAdes 组装重叠群,并从所得重叠群中提取有丝分裂基因组。使用 MITOS2 并通过与蜘蛛目的其他物种进行比较来注释线粒体基因组。线粒体基因组有 14,081 个碱基对,包括 22 个转移 RNA

Erigone atra Blackwall, 1833(Araneae,Linyphiidae)的完整线粒体基因组

The complete mitochondrial genome of Erigone atra Blackwall, 1833 (Araneae, Linyphiidae)

Erigone atra Blackwall, 1833 (Araneae, Linyphiidae)完整线粒体基因组摘要Erigone atra Blackwell, Citation1833 的线粒体基因组首次被完整测序和注释。该物种主要发现于北温带大陆地区,在加拉帕戈斯群岛也有报道,该群岛可能是外来物种。对于在捷克共和国收集的两个样本,使用 Qiagen DNEasy 血液和组织试剂盒提取 DNA,然后在 Illumina NovaSeq 6000 上进行 250 bp 双端测序测序。在 SPAdes 中组装重叠群,并从所得重叠群中提取粗略的丝裂基因组草稿,将其用作使用 GetOrgan

来自超保守元件 (UCE) 的 Palmimanus capensis Simon, 1893(Araneae,Palpimanidae)线粒体基因组

The mitochondrial genome of Palpimanus capensis Simon, 1893 (Araneae, Palpimanidae) from ultraconserved elements (UCEs)

来自超保守元件 (UCE) 的 Palmimanus capensis Simon, 1893(Araneae,Palpimanidae)线粒体基因组摘要已从超保守元件 (UCE) 中对 Palmimanus capensis Simon, 1893 的线粒体基因组进行了测序和注释。该物种是南非特有的物种,是自由生活的地面居民。重叠群在 SPAdes 中组装,从所得重叠群中提取了粗略的有丝分裂基因组草稿,该草稿被用作 NOVOPlasty 从头组装的种子,以获得最终的环化基因组。使用 MITOS2 并通过将其与蜘蛛目的其他物种进行比较来注释线粒体基因组。线粒体基因组为 14,268 bp,包括