摘要 创伤性脑损伤 (TBI) 通常会导致中线移位 (MLS),这是头部损伤严重程度和预后的关键指标。在过去十年中,使用人工智能 (AI) 技术自动分析头部计算机断层扫描 (CT) 扫描中的 MLS 引起了广泛关注,并有望提高诊断效率和准确性。本综述旨在总结基于 AI 的 TBI 病例 MLS 分析方法的研究现状,确定所采用的方法,评估算法的性能,并得出关于其潜在临床适用性的结论。进行了全面的文献检索,确定了 15 篇不同的出版物。对已确定的文章进行了分析,重点关注使用 AI 技术进行 MLS 检测和量化,包括它们的 AI 算法选择、数据集特征和方法。所综述的文章涵盖了与 MLS 检测和量化相关的各个方面,采用在二维或三维 CT 成像数据集上训练的深度神经网络。数据集大小从 11 名患者的 CT 扫描到 25,000 张 CT 图像不等。AI 算法的性能在准确度、灵敏度和特异性方面表现出差异,灵敏度范围为 70% 到 100%,特异性范围为 73% 到 97.4%。利用深度神经网络的基于 AI 的方法已显示出在 TBI 病例中 MLS 的自动检测和量化方面的潜力。然而,不同的研究人员使用了不同的技术;因此,很难进行批判性比较。需要进一步研究和评估方案的标准化,以确定这些 AI 算法在临床实践中用于 MLS 检测和量化的可靠性和通用性。研究结果强调了 AI 技术在改善 MLS 诊断和指导 TBI 管理临床决策方面的重要性。
简单的摘要:弥漫性中线神经胶质瘤(DMG),尤其是弥漫性内在的蓬托胶质瘤(DIPG),是一种致命的小儿脑肿瘤,难以诊断并且缺乏任何实际治疗方法。这些肿瘤通常会影响幼儿的深层中线大脑结构,这表明与早期大脑发育和分化有联系。H3K27M突变会触发DIPG,影响基因表达和脑发育。尽管有针对性的基因突变药物干预措施,但该疾病的严峻预后仍未改变。DIPG患者通常在诊断后12至18个月内屈服于疾病。我们的审查发现,超过85%的DIPG肿瘤在组蛋白基因中具有K27M突变,促进异常生长。该突变影响至关重要的大脑过程,包括上皮 - 间质转变途径,有可能解释有和没有K27M的神经胶质瘤之间的差异。这些突变的时机尚不清楚。一个想法是,这些突变可能是在出生前大脑早期发育过程中开始的。
保留所有权利。未经许可就不允许重复使用。(未经同行评审证明)是作者/资助者,他已授予Medrxiv的许可证,以永久显示预印本。此预印本版的版权持有人于2024年3月21日发布。 https://doi.org/10.1101/2024.03.19.24304372 doi:medrxiv preprint
10-11转倾性(TET)酶通过连续氧化5-甲基胞嘧啶(5MC)对衍生物的连续氧化有助于调节甲基,这些酶在缺乏细胞分裂的情况下可以通过基础外观修复(BER)机制积极去除。这在有丝质神经元中尤其重要,因为DNA甲基化的变化与神经功能的变化相关。tet3,具体来说,是发育中神经元分化的关键调节剂,并介导了与认知功能相关的成年神经元的甲基甲基组的动态变化。虽然将DNA甲基化理解为调节转录,但对神经元中TET3依赖性催化活性的特定靶标几乎一无所知。我们报告了神经胚瘤衍生细胞系的无偏转录组分析的结果; Neuro2a,其中TET3被沉默。氧化磷酸化(OXPHOS)被确定为最显着下调的功能典型途径,并且通过测量海马生物能源分析仪的氧消耗率来证实这些发现。通过TET3-SiLencing降低了核和线粒体编码的OXPHOS基因的mRNA水平,但我们没有发现这些基因基因座的差异(羟基)甲基化沉积的证据。然而,在没有TET3的情况下,已知与线粒体质量控制相关的基因的mRNA表现也显着下调。这些基因之一;内生被认为是其基因体内非CPG甲基化位点TET3催化活性的直接靶标。因此,我们提出,异常的线粒体稳态可能有助于Oxphos的降低,而神经2a细胞中TET3降低了调节。
Isabel Arrillaga-Romany,医学博士,博士1;莎朗·加德纳(Sharon L. Gardner),医学博士2; Yazmin Odia,医学博士,MS,FAAN 3;多莉·阿奎莱拉(Dolly Aguilera),医学博士4;约书亚·E·艾伦(Joshua E. Allen),博士5; Tracy Batchelor,医学博士,MPH 6; Nicholas Butowski,MD 7;马里兰州克拉克·陈(Clark Chen),博士8; Timothy Cloughesy,医学博士9; Andrew Cluster,MD 10;约翰·德·格鲁特(John de Groot),医学博士7; Karan S. Dixit,MD 11; Jerome J. Graber,医学博士,MPH 12; Aya M. Haggiagi,医学博士13;丽贝卡·哈里森(Rebecca A. Harrison),医学博士14; Albert Kheradpour,医学博士15; Lindsay Kilburn,医学博士16; Sylvia C. Kurz,医学博士,博士17;广播Lu,MBBS 18; Tobey J. MacDonald,医学博士4; Minesh Mehta,医学博士3; Allen S. Melemed,MD 5; Phioanh Leia Nghiemphu,医学博士9; Samuel C. Ramage,博士5; Nicole Shonka,医学博士19; Ashley Sumrall,医学博士,FACP 20; Rohinton Tarapore,博士5; Lynne Taylor,医学博士,Faan,Fana 12; Yoshie Umemura,医学博士21;以及医学博士Patrick Y. Wen,PhD 6
Clemson大学Clemson,SC 29634 2癌症系统成像UT MD Anderson癌症中心休斯顿TX 77030 3 Sporos Bioventures 3000 Bissonnet,Belmont Suite,Belmont Suite 5303 Houston,TX 77005,TX 77005 4真核病病病原中心Innovation Innovation Innovation Center of Clemson Clemson Clemson Clembriide Clembriide Clembri岛,SC296634444434344。 98110 6西雅图结构性基因组学中心全球感染疾病研究中心研究西雅图儿童研究所西雅图,西雅图98109 7免疫学系杜克大学医学院医学院达勒姆大学北卡罗来纳州27710
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证。是根据作者/资助者提供的预印本(未经Peer Review的认证)提供的,他已授予Biorxiv的许可证,以在2023年12月5日发布的此版本中显示此版本的版权持有人。 https://doi.org/10.1101/2023.12.05.570066 doi:Biorxiv Preprint
摘要。亚细胞细胞器(植物)的DNA矩阵的拷贝数可以作为光合作用和氧化磷酸化过程的强度的指标。我们评估了三种葡萄品种的年轻和成熟叶子中线粒体和叶绿体DNA的相对拷贝数(RCN):“ Traminer Pink”,“ Chardonnay”和“ Syrah”和“ Syrah”,在田间条件下生长。叶样品(5-10 mg),以进行随后的总DNA提取。使用LightCycler 480 SYBR Green I Master Mix(Lifescience,Roche)和LightCycler 96自动分析仪(Roche Life Science)进行QRT-PCR反应。使用GAPDH基因(染色体DNA)确定NAD1基因(线粒体DNA)和RPS16基因(叶绿体DNA)的相对拷贝数。使用2 -∆ CT 2- ∆ΔCT算法进行定量评估。已经确定,叶绿体和线粒体DNA的相对拷贝数(RCN)值变化,并取决于葡萄的品种和叶片成熟度。RCN在成熟的葡萄叶中的光合作用强度和成熟葡萄叶片的氧化磷酸化强度更高。在评估宏观能力平衡(MEB)指标时,可以得出结论,通过光合作用过程在叶绿体中获得的能量的2%至4%用于生产年轻叶子和成熟叶片中各种葡萄品种的线粒体中的宏观能。我们开发的实验方案可以成功用作测试系统,以评估各种葡萄品种的潜在产量。
摘要 线粒体含有一个独立的基因组,称为线粒体 DNA (mtDNA),其中包含必需的代谢基因。尽管 mtDNA 突变发生频率很高,但它们很少被遗传,这表明生殖系机制限制了它们的积累。为了确定生殖系 mtDNA 是如何调控的,我们研究了秀丽隐杆线虫原始生殖细胞 (PGC) 中 mtDNA 数量和质量的控制。我们发现 PGC 结合多种策略来产生 mtDNA 数量的低点,方法是将线粒体分离成叶状突起,这些突起会被相邻细胞蚕食,同时通过自噬消除线粒体,使整体 mtDNA 含量降低两倍。当 PGC 离开静止状态并分裂时,mtDNA 会复制以维持每个生殖系干细胞约 200 个 mtDNA 的设定点。尽管同类相食和自噬会随机消除线粒体 DNA,但我们发现,独立于 Parkin 和自噬的激酶 PTEN 诱导激酶 1 (PINK1) 优先减少突变线粒体 DNA 的比例。因此,PGC 采用并行机制来控制种系线粒体 DNA 创始群体的数量和质量。
结果本研究表明,属于51-60岁(32%)和61-70岁(40%)的年龄组的患者人数几乎相等,随后是70岁以上的患者(12%),该组患有质量效应,在对照组中几乎相同。在100个临床诊断出的出血性中风50中有自发的脑出血,质量效应,男性为38(76%),女性为12(24%)。其他50例自发性脑出血,无目的地将质量效应视为对照,而男性为34(68%),女性为16(32%)(表1)。在100个受试者中(案例加对照)以下站点中有CT扫描中出血:supertentorial(85%)和infratentorial(15%)(表II)。很明显,由于MCA分支的破裂,其后大部分(76%)发生,然后是前和后大脑动脉(病例加对照)(表III)。格拉斯哥昏迷量表得分为13-15,有06名(12%)的ISCH患者具有质量效应,9-12的患者有17(34%),而低GCS得分分别为3-5例,同一组的患者分别为27(54%)。另一方面,在没有质量效应的组中,有24%的得分为13-15,而60%的得分为9-12,而8(16%)的得分为3-5(表IV)。将CT扫描中的隔膜移位分为两组:在20(40%)中观察到10毫米或更少30毫米(60%)的患者(60%)患者的转移大于10 mm。
