如今,基因改造基因组经常用于许多基础和应用研究领域。在许多研究中,编码或非编码区域被故意修改,以改变蛋白质序列或基因表达水平。修改基因组中的一个或多个核苷酸也会导致基因表观遗传调控的意外变化。因此,在设计具有许多突变的合成基因组时,能够预测这些突变对染色质的影响将非常有用。我们在此开发了一种深度学习方法,可以量化每个可能的单个突变对整个酿酒酵母基因组上核小体位置的影响。这种类型的注释轨道可用于设计改良的酿酒酵母基因组。我们进一步强调了该轨道如何为驱动核小体在体内位置的序列依赖机制提供新的见解。关键词——深度学习、基因组学、酿酒酵母、突变、合成生物学、核小体、DNA 基序
图2。PSM-CO -OMAM(共co-)聚合物的结构和表征。(a)聚合物结构显示醛平衡及其乙酰形式。(b)1 H NMR(700 MHz,d 2 O)纯化的PSM- CO-OMAM共聚物(S25 – S75)和峰分配的聚(3-磺胺甲基丙烯酸酯)均聚合物(S100)的光谱。请注意,游离醛状态(a,b,c)及其相关的乙酰形式(a*,b*,c*)的存在。在图S14中,将S25频谱作为代表性示例包括在表示a:b:c的积分比为≈1:1:1:a+a*:b+b*:c+c*是≈1:2:2。(c)纯化的S25 – S100的ATR-FTIR光谱。酰胺I和醛羧基拉伸(1637 cm -1),酰胺II带(1537 cm -1),磺酸盐(1041 cm -1)和酯(1714 cm -1)峰用点缀的线表示。S100光谱中带有星号(*)的峰与指定的酰胺I和醛峰(1648 cm -1 vs 1637 cm -1)不一致。完整的ATR-FTIR光谱可以在图S15中找到。
新型 SARS-CoV-2 于 2019 年出现,全球 COVID-19 大流行将持续到 2022 年。已知一部分患者在从 COVID-19 急性感染中完全康复后会出现慢性、使人衰弱的症状。有多个术语被用来描述这一系列症状,包括长期 COVID、长期 COVID 和 SARS-CoV-2 综合征急性后遗症 (PASC)。PASC 被广义地定义为感染后至少四周出现的一系列新症状、复发症状或持续症状。这些患者中,有十分之一在急性 COVID-19 感染后被送往急诊室,但由于对 PASC 的潜在病理生理学尚不清楚,因此他们的症状无法得到充分控制。在 PASC 患者中,体位性直立性心动过速综合征 (POTS) 的认识度越来越高。 POTS 是最常见的自主神经功能障碍之一,其定义为在没有直立性低血压或其他心肺疾病的情况下,在主动站立或直立倾斜试验期间出现持续性直立性心动过速。由于 POTS 是一种可治疗的疾病,因此在 PASC 患者中识别 POTS 非常重要。本文,我们回顾了目前关于 POTS 和 PASC 中自主神经功能障碍的文献,以便更好地了解这些病理之间的重叠和区别。
最近的文献表明,触觉事件在初级体感皮层 (S1) 中的表现超出了其长期确定的拓扑结构;此外,S1 受视觉调节的程度仍不清楚。为了更好地描述 S1,在触摸前臂或手指时记录了人类电生理数据。条件包括视觉观察到的物理触摸、没有视觉的物理触摸和没有物理接触的视觉触摸。从这个数据集中得出两个主要发现。首先,视觉强烈调节 S1 区域 1,但前提是触摸有物理元素,这表明被动触摸观察不足以引起神经反应。其次,尽管在假定的 S1 手臂区域记录,但神经活动在物理触摸期间代表手臂和手指刺激。手臂触摸的编码更强烈和具体,支持 S1 主要通过其拓扑组织编码触觉事件的想法,但也更普遍地涵盖身体的其他区域。